NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
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651942 |
6w3m   |
28094 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1324 |
data_6w3m_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_6w3m
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_6w3m 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_6w3m
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 6w3m "Master copy" parsed_6w3m
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_6w3m
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 6w3m.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6w3m 1
1 6w3m.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 934 parsed_6w3m 1
1 6w3m.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 68 parsed_6w3m 1
1 6w3m.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 322 parsed_6w3m 1
1 6w3m.mr . . XPLOR/CNS 5 planarity "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6w3m 1
1 6w3m.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6w3m 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_6w3m
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA 09-MAR-20 6W3M
*TITLE SOLUTION NMR STRUCTURE OF 5'UTR STEM LOOP B IN DENV4 FLAVIVIRUS.
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: RNA (41-MER);
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: DENGUE VIRUS 4 PHILIPPINES/H241/1956;
*SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 408686;
*SOURCE 4 EXPRESSION_SYSTEM: DENGUE VIRUS 4 PHILIPPINES/H241/1956;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 408686
*KEYWDS RNA, 5'UTR
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 10
*AUTHOR S.SHARMA,G.VARANI
*REVDAT 1 23-SEP-20 6W3M 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6w3m
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_6w3m 1
2 1 . . . parsed_6w3m 1
3 1 . . . parsed_6w3m 1
4 1 . . . parsed_6w3m 1
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24 1 . . . parsed_6w3m 1
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65 1 . . . parsed_6w3m 1
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131 1 . . . parsed_6w3m 1
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37 G37 889 1 889 5 parsed_6w3m 1
38 A38 915 1 915 5 parsed_6w3m 1
39 A39 942 1 942 5 parsed_6w3m 1
40 C40 970 1 970 5 parsed_6w3m 1
41 C41 998 1 998 5 parsed_6w3m 1
42
;
H2O
C41
;
1019 1 1021 5 parsed_6w3m 1
43 C40 1026 1 1026 5 parsed_6w3m 1
44 C25 1031 1 1031 5 parsed_6w3m 1
45 C27 1036 1 1036 5 parsed_6w3m 1
46 C20 1041 1 1041 5 parsed_6w3m 1
47 U3 1047 1 1047 4 parsed_6w3m 1
48 U4 1053 1 1053 4 parsed_6w3m 1
49 U5 1060 1 1060 4 parsed_6w3m 1
50 U7 1067 1 1067 4 parsed_6w3m 1
51 U8 1075 1 1075 4 parsed_6w3m 1
52 U9 1081 1 1081 4 parsed_6w3m 1
53 G15 1086 1 1086 5 parsed_6w3m 1
54 G17 1091 1 1091 5 parsed_6w3m 1
55 G37 1097 1 1097 5 parsed_6w3m 1
56 G6 1103 1 1103 4 parsed_6w3m 1
57 U24 1110 1 1110 5 parsed_6w3m 1
58 U26 1115 1 1115 5 parsed_6w3m 1
59 U28 1121 1 1121 5 parsed_6w3m 1
60 U36 1127 1 1127 5 parsed_6w3m 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 1: NMR_Restraints" 1 1 1 35 parsed_6w3m 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6w3m
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_6w3m 2
2 1 . . . parsed_6w3m 2
3 1 . . . parsed_6w3m 2
4 1 . . . parsed_6w3m 2
5 1 . . . parsed_6w3m 2
6 1 . . . parsed_6w3m 2
7 1 . . . parsed_6w3m 2
8 1 . . . parsed_6w3m 2
9 1 . . . parsed_6w3m 2
10 1 . . . parsed_6w3m 2
11 1 . . . parsed_6w3m 2
12 1 . . . parsed_6w3m 2
13 1 . . . parsed_6w3m 2
14 1 . . . parsed_6w3m 2
15 1 . . . parsed_6w3m 2
16 1 . . . parsed_6w3m 2
17 1 . . . parsed_6w3m 2
18 1 . . . parsed_6w3m 2
19 1 . . . parsed_6w3m 2
20 1 . . . parsed_6w3m 2
21 1 . . . parsed_6w3m 2
22 1 . . . parsed_6w3m 2
23 1 . . . parsed_6w3m 2
24 1 . . . parsed_6w3m 2
25 1 . . . parsed_6w3m 2
26 1 . . . parsed_6w3m 2
27 1 . . . parsed_6w3m 2
28 1 . . . parsed_6w3m 2
29 1 . . . parsed_6w3m 2
30 1 . . . parsed_6w3m 2
31 1 . . . parsed_6w3m 2
32 1 . . . parsed_6w3m 2
33 1 . . . parsed_6w3m 2
34 1 . . . parsed_6w3m 2
35 1 . . . parsed_6w3m 2
36 1 . . . parsed_6w3m 2
37 1 . . . parsed_6w3m 2
38 1 . . . parsed_6w3m 2
39 1 . . . parsed_6w3m 2
40 1 . . . parsed_6w3m 2
41 1 . . . parsed_6w3m 2
42 1 . . . parsed_6w3m 2
43 1 . . . parsed_6w3m 2
44 1 . . . parsed_6w3m 2
45 1 . . . parsed_6w3m 2
46 1 . . . parsed_6w3m 2
47 1 . . . parsed_6w3m 2
48 1 . . . parsed_6w3m 2
49 1 . . . parsed_6w3m 2
50 1 . . . parsed_6w3m 2
51 1 . . . parsed_6w3m 2
52 1 . . . parsed_6w3m 2
53 1 . . . parsed_6w3m 2
54 1 . . . parsed_6w3m 2
55 1 . . . parsed_6w3m 2
56 1 . . . parsed_6w3m 2
57 1 . . . parsed_6w3m 2
58 1 . . . parsed_6w3m 2
59 1 . . . parsed_6w3m 2
60 1 . . . parsed_6w3m 2
61 1 . . . parsed_6w3m 2
62 1 . . . parsed_6w3m 2
63 1 . . . parsed_6w3m 2
64 1 . . . parsed_6w3m 2
65 1 . . . parsed_6w3m 2
66 1 . . . parsed_6w3m 2
67 1 . . . parsed_6w3m 2
68 1 . . . parsed_6w3m 2
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 1 . N1 parsed_6w3m 2
1 1 2 . . . . . . . . . 41 . N3 parsed_6w3m 2
2 1 1 . . . . . . . . . 1 . O6 parsed_6w3m 2
2 1 2 . . . . . . . . . 41 . N4 parsed_6w3m 2
3 1 1 . . . . . . . . . 1 . N2 parsed_6w3m 2
3 1 2 . . . . . . . . . 41 . O2 parsed_6w3m 2
4 1 1 . . . . . . . . . 1 . H1 parsed_6w3m 2
4 1 2 . . . . . . . . . 41 . N3 parsed_6w3m 2
5 1 1 . . . . . . . . . 1 . O6 parsed_6w3m 2
5 1 2 . . . . . . . . . 41 . H41 parsed_6w3m 2
6 1 1 . . . . . . . . . 1 . H21 parsed_6w3m 2
6 1 2 . . . . . . . . . 41 . O2 parsed_6w3m 2
7 1 1 . . . . . . . . . 2 . N1 parsed_6w3m 2
7 1 2 . . . . . . . . . 40 . N3 parsed_6w3m 2
8 1 1 . . . . . . . . . 2 . O6 parsed_6w3m 2
8 1 2 . . . . . . . . . 40 . N4 parsed_6w3m 2
9 1 1 . . . . . . . . . 2 . N2 parsed_6w3m 2
9 1 2 . . . . . . . . . 40 . O2 parsed_6w3m 2
10 1 1 . . . . . . . . . 2 . H1 parsed_6w3m 2
10 1 2 . . . . . . . . . 40 . N3 parsed_6w3m 2
11 1 1 . . . . . . . . . 2 . O6 parsed_6w3m 2
11 1 2 . . . . . . . . . 40 . H41 parsed_6w3m 2
12 1 1 . . . . . . . . . 2 . H21 parsed_6w3m 2
12 1 2 . . . . . . . . . 40 . O2 parsed_6w3m 2
13 1 1 . . . . . . . . . 3 . N3 parsed_6w3m 2
13 1 2 . . . . . . . . . 39 . N1 parsed_6w3m 2
14 1 1 . . . . . . . . . 3 . O4 parsed_6w3m 2
14 1 2 . . . . . . . . . 39 . N6 parsed_6w3m 2
15 1 1 . . . . . . . . . 3 . H3 parsed_6w3m 2
15 1 2 . . . . . . . . . 39 . N1 parsed_6w3m 2
16 1 1 . . . . . . . . . 3 . O4 parsed_6w3m 2
16 1 2 . . . . . . . . . 39 . H61 parsed_6w3m 2
17 1 1 . . . . . . . . . 4 . N3 parsed_6w3m 2
17 1 2 . . . . . . . . . 38 . N1 parsed_6w3m 2
18 1 1 . . . . . . . . . 4 . O4 parsed_6w3m 2
18 1 2 . . . . . . . . . 38 . N6 parsed_6w3m 2
19 1 1 . . . . . . . . . 4 . H3 parsed_6w3m 2
19 1 2 . . . . . . . . . 38 . N1 parsed_6w3m 2
20 1 1 . . . . . . . . . 4 . O4 parsed_6w3m 2
20 1 2 . . . . . . . . . 38 . H61 parsed_6w3m 2
21 1 1 . . . . . . . . . 7 . N3 parsed_6w3m 2
21 1 2 . . . . . . . . . 35 . N1 parsed_6w3m 2
22 1 1 . . . . . . . . . 7 . O4 parsed_6w3m 2
22 1 2 . . . . . . . . . 35 . N6 parsed_6w3m 2
23 1 1 . . . . . . . . . 7 . H3 parsed_6w3m 2
23 1 2 . . . . . . . . . 35 . N1 parsed_6w3m 2
24 1 1 . . . . . . . . . 7 . O4 parsed_6w3m 2
24 1 2 . . . . . . . . . 35 . H61 parsed_6w3m 2
25 1 1 . . . . . . . . . 8 . N3 parsed_6w3m 2
25 1 2 . . . . . . . . . 34 . N1 parsed_6w3m 2
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26 1 2 . . . . . . . . . 34 . N6 parsed_6w3m 2
27 1 1 . . . . . . . . . 8 . H3 parsed_6w3m 2
27 1 2 . . . . . . . . . 34 . N1 parsed_6w3m 2
28 1 1 . . . . . . . . . 8 . O4 parsed_6w3m 2
28 1 2 . . . . . . . . . 34 . H61 parsed_6w3m 2
29 1 1 . . . . . . . . . 9 . N3 parsed_6w3m 2
29 1 2 . . . . . . . . . 33 . N1 parsed_6w3m 2
30 1 1 . . . . . . . . . 9 . O4 parsed_6w3m 2
30 1 2 . . . . . . . . . 33 . N6 parsed_6w3m 2
31 1 1 . . . . . . . . . 9 . H3 parsed_6w3m 2
31 1 2 . . . . . . . . . 33 . N1 parsed_6w3m 2
32 1 1 . . . . . . . . . 9 . O4 parsed_6w3m 2
32 1 2 . . . . . . . . . 33 . H61 parsed_6w3m 2
33 1 1 . . . . . . . . . 28 . N3 parsed_6w3m 2
33 1 2 . . . . . . . . . 14 . N1 parsed_6w3m 2
34 1 1 . . . . . . . . . 28 . O4 parsed_6w3m 2
34 1 2 . . . . . . . . . 14 . N6 parsed_6w3m 2
35 1 1 . . . . . . . . . 28 . H3 parsed_6w3m 2
35 1 2 . . . . . . . . . 14 . N1 parsed_6w3m 2
36 1 1 . . . . . . . . . 28 . O4 parsed_6w3m 2
36 1 2 . . . . . . . . . 14 . H61 parsed_6w3m 2
37 1 1 . . . . . . . . . 15 . N1 parsed_6w3m 2
37 1 2 . . . . . . . . . 27 . N3 parsed_6w3m 2
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38 1 2 . . . . . . . . . 27 . N4 parsed_6w3m 2
39 1 1 . . . . . . . . . 15 . N2 parsed_6w3m 2
39 1 2 . . . . . . . . . 27 . O2 parsed_6w3m 2
40 1 1 . . . . . . . . . 15 . H1 parsed_6w3m 2
40 1 2 . . . . . . . . . 27 . N3 parsed_6w3m 2
41 1 1 . . . . . . . . . 15 . O6 parsed_6w3m 2
41 1 2 . . . . . . . . . 27 . H41 parsed_6w3m 2
42 1 1 . . . . . . . . . 15 . H21 parsed_6w3m 2
42 1 2 . . . . . . . . . 27 . O2 parsed_6w3m 2
43 1 1 . . . . . . . . . 26 . N3 parsed_6w3m 2
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44 1 2 . . . . . . . . . 16 . N6 parsed_6w3m 2
45 1 1 . . . . . . . . . 26 . H3 parsed_6w3m 2
45 1 2 . . . . . . . . . 16 . N1 parsed_6w3m 2
46 1 1 . . . . . . . . . 26 . O4 parsed_6w3m 2
46 1 2 . . . . . . . . . 16 . H61 parsed_6w3m 2
47 1 1 . . . . . . . . . 17 . N1 parsed_6w3m 2
47 1 2 . . . . . . . . . 25 . N3 parsed_6w3m 2
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48 1 2 . . . . . . . . . 25 . N4 parsed_6w3m 2
49 1 1 . . . . . . . . . 17 . N2 parsed_6w3m 2
49 1 2 . . . . . . . . . 25 . O2 parsed_6w3m 2
50 1 1 . . . . . . . . . 17 . H1 parsed_6w3m 2
50 1 2 . . . . . . . . . 25 . N3 parsed_6w3m 2
51 1 1 . . . . . . . . . 17 . O6 parsed_6w3m 2
51 1 2 . . . . . . . . . 25 . H41 parsed_6w3m 2
52 1 1 . . . . . . . . . 17 . H21 parsed_6w3m 2
52 1 2 . . . . . . . . . 25 . O2 parsed_6w3m 2
53 1 1 . . . . . . . . . 24 . N3 parsed_6w3m 2
53 1 2 . . . . . . . . . 18 . N1 parsed_6w3m 2
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54 1 2 . . . . . . . . . 18 . N6 parsed_6w3m 2
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55 1 2 . . . . . . . . . 18 . N1 parsed_6w3m 2
56 1 1 . . . . . . . . . 24 . O4 parsed_6w3m 2
56 1 2 . . . . . . . . . 18 . H61 parsed_6w3m 2
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57 1 2 . . . . . . . . . 5 . H3 parsed_6w3m 2
58 1 1 . . . . . . . . . 37 . O6 parsed_6w3m 2
58 1 2 . . . . . . . . . 5 . N3 parsed_6w3m 2
59 1 1 . . . . . . . . . 37 . H1 parsed_6w3m 2
59 1 2 . . . . . . . . . 5 . O2 parsed_6w3m 2
60 1 1 . . . . . . . . . 37 . N1 parsed_6w3m 2
60 1 2 . . . . . . . . . 5 . O2 parsed_6w3m 2
61 1 1 . . . . . . . . . 6 . O6 parsed_6w3m 2
61 1 2 . . . . . . . . . 36 . H3 parsed_6w3m 2
62 1 1 . . . . . . . . . 6 . O6 parsed_6w3m 2
62 1 2 . . . . . . . . . 36 . N3 parsed_6w3m 2
63 1 1 . . . . . . . . . 6 . H1 parsed_6w3m 2
63 1 2 . . . . . . . . . 36 . O2 parsed_6w3m 2
64 1 1 . . . . . . . . . 6 . N1 parsed_6w3m 2
64 1 2 . . . . . . . . . 36 . O2 parsed_6w3m 2
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65 1 2 . . . . . . . . . 13 . H3 parsed_6w3m 2
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66 1 2 . . . . . . . . . 13 . N3 parsed_6w3m 2
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67 1 2 . . . . . . . . . 13 . O2 parsed_6w3m 2
68 1 1 . . . . . . . . . 29 . N1 parsed_6w3m 2
68 1 2 . . . . . . . . . 13 . O2 parsed_6w3m 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
_Dist_constraint_value.Intensity_lower_val_err
_Dist_constraint_value.Intensity_upper_val_err
_Dist_constraint_value.Distance_val
_Dist_constraint_value.Distance_lower_bound_val
_Dist_constraint_value.Distance_upper_bound_val
_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . . . 2.91 2.71 3.11 parsed_6w3m 2
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5 1 . . . . . 1.91 1.71 2.11 parsed_6w3m 2
6 1 . . . . . 1.86 1.66 2.06 parsed_6w3m 2
7 1 . . . . . 2.95 2.75 3.15 parsed_6w3m 2
8 1 . . . . . 2.91 2.71 3.11 parsed_6w3m 2
9 1 . . . . . 2.86 2.66 3.06 parsed_6w3m 2
10 1 . . . . . 1.95 1.75 2.15 parsed_6w3m 2
11 1 . . . . . 1.91 1.71 2.11 parsed_6w3m 2
12 1 . . . . . 1.86 1.66 2.06 parsed_6w3m 2
13 1 . . . . . 2.73 2.53 2.93 parsed_6w3m 2
14 1 . . . . . 2.92 2.72 3.12 parsed_6w3m 2
15 1 . . . . . 1.73 1.53 1.93 parsed_6w3m 2
16 1 . . . . . 1.92 1.72 2.12 parsed_6w3m 2
17 1 . . . . . 2.73 2.53 2.93 parsed_6w3m 2
18 1 . . . . . 2.92 2.72 3.12 parsed_6w3m 2
19 1 . . . . . 1.73 1.53 1.93 parsed_6w3m 2
20 1 . . . . . 1.92 1.72 2.12 parsed_6w3m 2
21 1 . . . . . 2.73 2.53 2.93 parsed_6w3m 2
22 1 . . . . . 2.92 2.72 3.12 parsed_6w3m 2
23 1 . . . . . 1.73 1.53 1.93 parsed_6w3m 2
24 1 . . . . . 1.92 1.72 2.12 parsed_6w3m 2
25 1 . . . . . 2.73 2.53 2.93 parsed_6w3m 2
26 1 . . . . . 2.92 2.72 3.12 parsed_6w3m 2
27 1 . . . . . 1.73 1.53 1.93 parsed_6w3m 2
28 1 . . . . . 1.92 1.72 2.12 parsed_6w3m 2
29 1 . . . . . 2.73 2.53 2.93 parsed_6w3m 2
30 1 . . . . . 2.92 2.72 3.12 parsed_6w3m 2
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stop_
loop_
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_TA_constraint_comment_org.Torsion_angle_constraint_list_ID
1
;
Torsion angle restraints for sugar pucker in the
- DENV4_WT
Pucker is defined with ribose torsion angles nu1 and nu2.
nu1 = O4'-C1'-C2'-C3'
nu2 = C1'-C2'-C3'-C4'
"N" C3' endo:
nu1 = -20 +/- 10
nu2 = +35 +/- 5
"S" C2' endo:
nu1 = +35 +/- 10
nu2 = -35 +/- 5
See Saenger page 20.
C2' endo nucleotides (Judging from TOCSY): only if both H1'-H2'' and
H1'-H3' couplings both are strong (intensity of H1'-H3' even larger)
Xhi is defined as follows...
Purines = O4'-C1'-N9-C4
pyrimidine = O4'-C1'-N1-C2
Anti:
Xhi = 180.0 +/- 90.0
including high-anti and excluding high-syn :
Xhi = =-150 +/- 90.0
Syn: Xhi = 0.0 +/- 90.0
See Saenger page 22.
3' endo!
G1
;
1 1 35 11 parsed_6w3m 1
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