NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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559686 |
2m21   |
18891 | cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 151 |
data_2m21_MR_file_constraints
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2m21
_Study_list.ID 1
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_Study.Type
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2m21 1
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_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2m21
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2m21 "Master copy" parsed_2m21
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2m21
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
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_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
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_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2m21.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2m21 1
1 2m21.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 459 parsed_2m21 1
1 2m21.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 37 parsed_2m21 1
1 2m21.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 151 parsed_2m21 1
1 2m21.mr . . XPLOR/CNS 5 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2m21 1
1 2m21.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2m21 1
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_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2m21
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 4
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_3
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_Torsion_angle_constraint.Seq_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Comp_ID_3
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_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Angle_lower_bound_val
_Torsion_angle_constraint.Angle_upper_bound_val
_Torsion_angle_constraint.Source_experiment_ID
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_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 1 . O3' . 2 . P . 2 . O5' . 2 . C5' parsed_2m21 1
2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 2 . O3' . 3 . P . 3 . O5' . 3 . C5' parsed_2m21 1
3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 3 . O3' . 4 . P . 4 . O5' . 4 . C5' parsed_2m21 1
4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 4 . O3' . 5 . P . 5 . O5' . 5 . C5' parsed_2m21 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 5 . O3' . 6 . P . 6 . O5' . 6 . C5' parsed_2m21 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 6 . O3' . 7 . P . 7 . O5' . 7 . C5' parsed_2m21 1
7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 14 . O3' . 15 . P . 15 . O5' . 15 . C5' parsed_2m21 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 15 . O3' . 16 . P . 16 . O5' . 16 . C5' parsed_2m21 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 16 . O3' . 17 . P . 17 . O5' . 17 . C5' parsed_2m21 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 17 . O3' . 18 . P . 18 . O5' . 18 . C5' parsed_2m21 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 18 . O3' . 19 . P . 19 . O5' . 19 . C5' parsed_2m21 1
12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 19 . O3' . 20 . P . 20 . O5' . 20 . C5' parsed_2m21 1
13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 20 . O3' . 21 . P . 21 . O5' . 21 . C5' parsed_2m21 1
14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -209.9 -149.9 . . 2 . P . 2 . O5' . 2 . C5' . 2 . C4' parsed_2m21 1
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22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -209.9 -149.9 . . 17 . P . 17 . O5' . 17 . C5' . 17 . C4' parsed_2m21 1
23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -209.9 -149.9 . . 18 . P . 18 . O5' . 18 . C5' . 18 . C4' parsed_2m21 1
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61 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.27 67.27 . . 15 . C1' . 15 . C2' . 15 . C3' . 15 . C4' parsed_2m21 1
62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.27 67.27 . . 16 . C1' . 16 . C2' . 16 . C3' . 16 . C4' parsed_2m21 1
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67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.27 67.27 . . 21 . C1' . 21 . C2' . 21 . C3' . 21 . C4' parsed_2m21 1
68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -189.01 -129.01 . . 1 . C4' . 1 . C3' . 1 . O3' . 2 . P parsed_2m21 1
69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -189.01 -129.01 . . 2 . C4' . 2 . C3' . 2 . O3' . 3 . P parsed_2m21 1
70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -189.01 -129.01 . . 3 . C4' . 3 . C3' . 3 . O3' . 4 . P parsed_2m21 1
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stop_
loop_
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1
;
DIHEDRAL RESTRAINTS
backbone dihedral angles for bases 1-21
to constrain 1-7, 15-21 to an ideal A form RNA helix
A-form backbone dihedral angles for the stem region as Watson-Crick stem
;
1 1 5 75 parsed_2m21 1
2 *alpha* 12 59 12 59 parsed_2m21 1
3 *alpha* 17 59 17 59 parsed_2m21 1
4 *alpha* 22 59 22 59 parsed_2m21 1
5 *alpha* 27 59 27 59 parsed_2m21 1
6 *alpha* 32 59 32 59 parsed_2m21 1
7 *alpha* 37 59 37 59 parsed_2m21 1
8 *alpha* 42 59 42 59 parsed_2m21 1
9 *alpha* 47 59 47 59 parsed_2m21 1
10 *alpha* 52 59 52 59 parsed_2m21 1
11 *alpha* 57 59 57 59 parsed_2m21 1
12 *alpha* 62 59 62 59 parsed_2m21 1
13 *alpha* 67 59 67 59 parsed_2m21 1
14 *alpha* 72 59 72 59 parsed_2m21 1
15 *beta* 80 59 80 59 parsed_2m21 1
16 *beta* 85 59 85 59 parsed_2m21 1
17 *beta* 90 59 90 59 parsed_2m21 1
18 *beta* 95 59 95 59 parsed_2m21 1
19 *beta* 100 59 100 59 parsed_2m21 1
20 *beta* 105 59 105 59 parsed_2m21 1
21 *beta* 110 60 110 60 parsed_2m21 1
22 *beta* 115 60 115 60 parsed_2m21 1
23 *beta* 120 60 120 60 parsed_2m21 1
24 *beta* 125 60 125 60 parsed_2m21 1
25 *beta* 130 60 130 60 parsed_2m21 1
26 *beta* 135 60 135 60 parsed_2m21 1
27 *beta* 140 60 140 60 parsed_2m21 1
28 *gamma* 148 59 148 59 parsed_2m21 1
29 *gamma* 153 59 153 59 parsed_2m21 1
30 *gamma* 158 59 158 59 parsed_2m21 1
31 *gamma* 163 59 163 59 parsed_2m21 1
32 *gamma* 168 59 168 59 parsed_2m21 1
33 *gamma* 173 59 173 59 parsed_2m21 1
34 *gamma* 178 59 178 59 parsed_2m21 1
35 *gamma* 183 60 183 60 parsed_2m21 1
36 *gamma* 188 60 188 60 parsed_2m21 1
37 *gamma* 193 60 193 60 parsed_2m21 1
38 *gamma* 198 60 198 60 parsed_2m21 1
39 *gamma* 203 60 203 60 parsed_2m21 1
40 *gamma* 208 60 208 60 parsed_2m21 1
41 *gamma* 213 60 213 60 parsed_2m21 1
42 *zeta* 221 59 221 59 parsed_2m21 1
43 *zeta* 226 59 226 59 parsed_2m21 1
44 *zeta* 231 59 231 59 parsed_2m21 1
45 *zeta* 236 59 236 59 parsed_2m21 1
46 *zeta* 241 59 241 59 parsed_2m21 1
47 *zeta* 246 59 246 59 parsed_2m21 1
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49 *zeta* 256 60 256 60 parsed_2m21 1
50 *zeta* 261 60 261 60 parsed_2m21 1
51 *zeta* 266 60 266 60 parsed_2m21 1
52 *zeta* 271 60 271 60 parsed_2m21 1
53 *zeta* 276 60 276 60 parsed_2m21 1
54 *zeta* 281 60 281 60 parsed_2m21 1
55 *nu2* 289 59 289 59 parsed_2m21 1
56 *nu2* 294 59 294 59 parsed_2m21 1
57 *nu2* 299 59 299 59 parsed_2m21 1
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60 *nu2* 314 59 314 59 parsed_2m21 1
61 *nu2* 319 59 319 59 parsed_2m21 1
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63 *nu2* 329 60 329 60 parsed_2m21 1
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65 *nu2* 339 60 339 60 parsed_2m21 1
66 *nu2* 344 60 344 60 parsed_2m21 1
67 *nu2* 349 60 349 60 parsed_2m21 1
68 *nu2* 354 60 354 60 parsed_2m21 1
69 *epsilon* 362 58 362 58 parsed_2m21 1
70 *epsilon* 367 58 367 58 parsed_2m21 1
71 *epsilon* 372 58 372 58 parsed_2m21 1
72 *epsilon* 377 58 377 58 parsed_2m21 1
73 *epsilon* 382 58 382 58 parsed_2m21 1
74 *epsilon* 387 58 387 58 parsed_2m21 1
75 *epsilon* 392 59 392 59 parsed_2m21 1
76 *epsilon* 397 59 397 59 parsed_2m21 1
77 *epsilon* 402 59 402 59 parsed_2m21 1
78 *epsilon* 407 59 407 59 parsed_2m21 1
79 *epsilon* 412 59 412 59 parsed_2m21 1
80 "stem alphas are already in htrhp.dihe" 417 1 417 39 parsed_2m21 1
81 beta 455 1 455 6 parsed_2m21 1
82 chi 492 1 492 5 parsed_2m21 1
83 "restraints dihedral" 493 1 493 29 parsed_2m21 1
84
;
chi dihedral restraints for DCLOOP hairpin
All chi angles are restrainted as "anti" or as "syn".
;
495 1 496 56 parsed_2m21 1
85 anti 503 53 503 59 parsed_2m21 1
86 anti 508 53 508 59 parsed_2m21 1
87 anti 513 53 513 60 parsed_2m21 1
88 anti 518 53 518 59 parsed_2m21 1
89 anti 523 53 523 59 parsed_2m21 1
90 anti 528 53 528 59 parsed_2m21 1
91 anti 533 53 533 59 parsed_2m21 1
92 anti 538 53 538 59 parsed_2m21 1
93 anti 543 53 543 59 parsed_2m21 1
94 anti 548 53 548 59 parsed_2m21 1
95 anti 553 53 553 59 parsed_2m21 1
96 "syn or high anti" 558 53 558 71 parsed_2m21 1
97 anti 563 53 563 59 parsed_2m21 1
98 anti 568 53 568 59 parsed_2m21 1
99 anti 573 53 573 60 parsed_2m21 1
100 anti 578 53 578 60 parsed_2m21 1
101 anti 583 53 583 59 parsed_2m21 1
102 anti 588 53 588 95 parsed_2m21 1
103 anti 593 53 593 60 parsed_2m21 1
104 anti 598 53 598 60 parsed_2m21 1
105
;
anti
delta=sugar pucker North (82),South (145), or Intermediate (120)
;
603 53 605 66 parsed_2m21 1
106 *delta* 610 62 610 62 parsed_2m21 1
107 *delta* 615 62 615 62 parsed_2m21 1
108 *delta* 620 62 620 62 parsed_2m21 1
109 *delta* 625 62 625 62 parsed_2m21 1
110 *delta* 630 62 630 62 parsed_2m21 1
111 *delta* 635 62 635 62 parsed_2m21 1
112 *delta* 640 61 640 61 parsed_2m21 1
113 *delta* 645 61 645 61 parsed_2m21 1
114 *delta* 650 62 650 62 parsed_2m21 1
115 *delta* 655 61 655 61 parsed_2m21 1
116 *delta* 660 62 660 62 parsed_2m21 1
117 *delta* 665 62 665 62 parsed_2m21 1
118 *delta* 670 63 670 63 parsed_2m21 1
119 *delta* 675 63 675 63 parsed_2m21 1
120 *delta* 680 62 680 62 parsed_2m21 1
121 *delta* 685 63 685 63 parsed_2m21 1
122 *delta* 690 62 690 62 parsed_2m21 1
123 *delta* 695 62 695 62 parsed_2m21 1
124 *delta* 700 62 700 62 parsed_2m21 1
125 *delta* 705 62 705 62 parsed_2m21 1
126 *delta* 710 62 710 62 parsed_2m21 1
127 epsilon 712 1 712 9 parsed_2m21 1
128 "stem zetas already in htrhp.dihe" 758 1 758 35 parsed_2m21 1
stop_
loop_
_TA_constraint_parse_err.ID
_TA_constraint_parse_err.Content
_TA_constraint_parse_err.Begin_line
_TA_constraint_parse_err.Begin_column
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_TA_constraint_parse_err.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 "Scale = 1.0" 7 2 7 12 parsed_2m21 1
2 "Scale = 1.0" 498 2 498 12 parsed_2m21 1
stop_
save_
Contact the webmaster for help, if required. Tuesday, April 30, 2024 9:27:41 PM GMT (wattos1)