NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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539116 |
2lrk   |
18379 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 2939 |
data_2lrk_MR_file_constraints
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2lrk
_Study_list.ID 1
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_Study.ID
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_Study.Details
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2lrk 1
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_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2lrk
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2lrk "Master copy" parsed_2lrk
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2lrk
_Constraint_stat_list.ID 1
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_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
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_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2lrk.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lrk 1
1 2lrk.mr . . n/a 2 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lrk 1
1 2lrk.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE ambi 873 parsed_2lrk 1
1 2lrk.mr . . XPLOR/CNS 4 distance "hydrogen bond" simple 462 parsed_2lrk 1
1 2lrk.mr . . XPLOR/CNS 5 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 845 parsed_2lrk 1
1 2lrk.mr . . XPLOR/CNS 6 "chemical shift" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lrk 1
1 2lrk.mr . . XPLOR/CNS 7 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 759 parsed_2lrk 1
1 2lrk.mr . . unknown 8 "chemical shift" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lrk 1
1 2lrk.mr . . "MR format" 9 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lrk 1
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_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2lrk
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_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER TRANSFERASE 06-APR-12 2LRK
*TITLE SOLUTION STRUCTURES OF THE IIA(CHITOBIOSE)-HPR COMPLEX OF THE N,N'-
*TITLE 2 DIACETYLCHITOBIOSE
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: PHOSPHOCARRIER PROTEIN HPR;
*COMPND 3 CHAIN: D;
*COMPND 4 SYNONYM: HISTIDINE-CONTAINING PROTEIN;
*COMPND 5 EC: 2.7.11.-;
*COMPND 6 ENGINEERED: YES;
*COMPND 7 MOL_ID: 2;
*COMPND 8 MOLECULE: N,N'-DIACETYLCHITOBIOSE-SPECIFIC PHOSPHOTRANSFERASE ENZYME
*COMPND 9 IIA COMPONENT;
*COMPND 10 CHAIN: A, B, C;
*COMPND 11 FRAGMENT: PTS EIIA TYPE-3 RESIDUES 14-116;
*COMPND 12 SYNONYM: EIIA-CHB, EIII-CHB, PTS SYSTEM N,N'-DIACETYLCHITOBIOSE-
*COMPND 13 SPECIFIC EIIA COMPONENT;
*COMPND 14 EC: 2.7.1.-;
*COMPND 15 ENGINEERED: YES;
*COMPND 16 MUTATION: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 83333;
*SOURCE 4 STRAIN: K12;
*SOURCE 5 GENE: PTSH, HPR, B2415, JW2408;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR: PET11;
*SOURCE 9 MOL_ID: 2;
*SOURCE 10 ORGANISM_SCIENTIFIC: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 11 ORGANISM_TAXID: 83333;
*SOURCE 12 STRAIN: K12;
*SOURCE 13 GENE: CHBA, CELC, B1736, JW1725;
*SOURCE 14 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 15 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562;
*SOURCE 16 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR: PET11
*KEYWDS PROTEIN-PROTEIN COMPLEX, TRANSFERASE
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 21
*AUTHOR M.CAI, Y.JUNG, M.CLORE
*REVDAT 1 16-MAY-12 2LRK 0
;
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_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2lrk
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_Org_constr_file_comment.Block_ID 2
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
!EXPERIMENTAL RESTRAINTS FOR IIAChb-HPr COMPLEX (with one HPr bound per trimer, interacting with subunits A and C of IIAChb)
!The intermolecular NOE data and the additional torsional angle restraints for HPr (active site and interfacial sidechains) are new data.
!The NOE, dihedral, RDC and Calpha/Cbeta chemical shift restraints for IIAChb are those from Tang, Williams, Ghirlando & Clore (2005) J. Biol. Chem.
280, 11880-11780 used to determine the solution NMR structure of IIAChb.
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2lrk
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
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loop_
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1
;
INTERMOLECULAR NOES BETWEEN IIAchb (subunits A and C) and HPr
!! IIA-H76E 2H13C15N [methyl 1H13C] / HPr [1H uniformely labeled]; IIA-HPr.WURSTfilter.800.311001
;
1 1 3 100 parsed_2lrk 1
2 "!! HPr 13C15N / IIA [L,M,Y labeled]; HPr-IIA.WURSTfilter.900.15" 35 1 35 69 parsed_2lrk 1
3 "!! HPr 2H13C15N [methyl 1H13C] / IIA [Ile labeled]; HPr-IIA.WURSTfilter.800.311003" 56 1 56 85 parsed_2lrk 1
4
;
IIAchb NOEs
Chain A
A1
E2
E3
L4
E5
;
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5 "A.371 at 2.15e+07" 78 101 78 121 parsed_2lrk 1
6
;
A.361 at 1.92e+06
E6
;
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7 "A.363 at 2.91e+06" 82 101 82 121 parsed_2lrk 1
8
;
A.364 at 2.47e+06
V7
;
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10
;
A.377 at 4.05e+06
V8
;
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12
;
A.350 at 6.17e+06
M9
;
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14
;
A.353 at 2.06e+06
G10
;
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;
A.352 at 5.98e+05
L11
;
101 101 103 6 parsed_2lrk 1
19 "A.345 at 1.27e+07" 104 101 104 121 parsed_2lrk 1
20
;
A.337 at 2.87e+06
I12
;
105 101 107 6 parsed_2lrk 1
21
;
A.339 at 1.42e+07
I13
N14
;
108 101 112 6 parsed_2lrk 1
22
;
A.334 at 1.56e+07
S15
;
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;
A.328 at 5.16e+06
G16
;
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;
A.330 at 7.55e+05
Q17
;
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26
;
A.326 at 2.41e+06
A18
;
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27
;
A.322 at 1.05e+07
R19
;
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29 "A.311 at 2.29e+06" 130 101 130 121 parsed_2lrk 1
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;
A.304 at 8.53e+05
S20
;
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;
A.317 at 1.00e+06
L21
;
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;
A.314 at 1.74e+06
A22
;
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;
A.307 at 2.75e+06
Y23
;
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;
A.300 at 7.19e+05
A24
;
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41
;
A.298 at 2.35e+06
A25
;
152 101 154 6 parsed_2lrk 1
42 "A.288 at 9.43e+06" 155 101 155 121 parsed_2lrk 1
43 L26 158 1 158 6 parsed_2lrk 1
44 K27 162 1 162 6 parsed_2lrk 1
45 Q28 165 1 165 6 parsed_2lrk 1
46
;
A.281 at 1.01e+07
A29
;
166 101 168 6 parsed_2lrk 1
47 K30 174 1 174 6 parsed_2lrk 1
48 "A.268 at 1.23e+07" 175 101 175 121 parsed_2lrk 1
49 Q31 180 1 180 7 parsed_2lrk 1
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;
A.10 at 1.66e+06
G32
;
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;
A.7 at 5.28e+06
D33
;
186 101 188 6 parsed_2lrk 1
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;
A.20 at 1.64e+06
F34
;
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;
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A36
;
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;
A.246 at 1.82e+07
A37
;
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;
A.243 at 1.44e+07
K38
;
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;
A.236 at 2.00e+06
A39
;
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;
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M40
;
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;
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M41
;
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;
A.233 at 4.84e+06
D42
;
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;
A.227 at 1.28e+07
Q43
;
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;
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;
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;
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R45
;
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;
A.217 at 1.47e+06
M46
;
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;
A.214 at 1.17e+07
A47
;
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;
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L48
;
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;
A.207 at 4.91e+06
N49
E50
;
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;
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A51
;
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;
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H52
;
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;
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L53
;
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;
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V54
;
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;
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Q55
T56
;
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;
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K57
;
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L58
;
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;
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I59
;
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;
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E60
;
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;
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G61
;
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;
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D62
;
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@ BEGIN_XPLR_NOE_FILE
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stop_
loop_
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stop_
loop_
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DIHEDRAL RESTRAINTS
IIACHB restraints
L4 Dihedrals
;
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3
;
L4 Talos Psi
E5 Dihedrals
;
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4 "E5 Talos Phi" 12 104 12 118 parsed_2lrk 1
5
;
E5 Talos Psi
E6 Dihedrals
;
14 103 16 15 parsed_2lrk 1
6 "E6 Talos Phi" 18 104 18 118 parsed_2lrk 1
7
;
E6 Talos Psi
V7 Dihedrals
;
20 103 22 15 parsed_2lrk 1
8 "V7 Talos Phi" 24 104 24 118 parsed_2lrk 1
9
;
V7 Talos Psi
V8 Dihedrals
;
26 103 28 15 parsed_2lrk 1
10 "V8 Talos Phi" 30 104 30 118 parsed_2lrk 1
11
;
V8 Talos Psi
M9 Dihedrals
;
32 103 34 15 parsed_2lrk 1
12 "M9 Talos Phi" 36 104 36 118 parsed_2lrk 1
13
;
M9 Talos Psi
G10 Dihedrals
;
38 103 40 16 parsed_2lrk 1
14 "G10 Talos Phi" 42 104 42 119 parsed_2lrk 1
15
;
G10 Talos Psi
L11 Dihedrals
;
44 103 46 16 parsed_2lrk 1
16 "L11 Talos Phi" 48 104 48 119 parsed_2lrk 1
17
;
L11 Talos Psi
I12 Dihedrals
;
50 103 52 16 parsed_2lrk 1
18 "2I12 Talos Phi/loosened!!!" 54 104 54 132 parsed_2lrk 1
19
;
I12 Talos Psi
I13 Dihedrals
;
56 103 58 16 parsed_2lrk 1
20 "I13 Talos Phi" 60 104 60 119 parsed_2lrk 1
21
;
I13 Talos Psi
N14 Dihedrals
;
62 103 64 16 parsed_2lrk 1
22 "N14 Talos Phi" 66 104 66 119 parsed_2lrk 1
23
;
N14 Talos Psi
S15 Dihedrals
;
68 103 70 16 parsed_2lrk 1
24 "S15 Talos Phi" 72 104 72 119 parsed_2lrk 1
25
;
S15 Talos Psi
G16 Dihedrals
;
74 103 76 16 parsed_2lrk 1
26 "G16 Talos Phi" 78 104 78 119 parsed_2lrk 1
27
;
G16 Talos Psi
Q17 Dihedrals
;
80 103 82 16 parsed_2lrk 1
28 "Q17 Talos Phi" 84 104 84 119 parsed_2lrk 1
29
;
Q17 Talos Psi
A18 Dihedrals
;
86 103 88 16 parsed_2lrk 1
30 "A18 Talos Phi" 90 104 90 119 parsed_2lrk 1
31
;
A18 Talos Psi
R19 Dihedrals
;
92 103 94 16 parsed_2lrk 1
32 "R19 Talos Phi" 96 104 96 119 parsed_2lrk 1
33
;
R19 Talos Psi
S20 Dihedrals
;
98 103 100 16 parsed_2lrk 1
34 "S20 Talos Phi" 102 104 102 119 parsed_2lrk 1
35
;
S20 Talos Psi
L21 Dihedrals
;
104 103 106 16 parsed_2lrk 1
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37
;
L21 Talos Psi
A22 Dihedrals
;
110 103 112 16 parsed_2lrk 1
38 "A22 Talos Phi" 114 104 114 119 parsed_2lrk 1
39
;
A22 Talos Psi
Y23 Dihedrals
;
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41
;
Y23 Talos Psi
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;
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43
;
A24 Talos Psi
A25 Dihedrals
;
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45
;
A25 Talos Psi
L26 Dihedrals
;
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47
;
L26 Talos Psi
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;
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49
;
K27 Talos Psi
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;
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;
Q28 Talos Psi
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;
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;
A29 Talos Psi
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;
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;
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;
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Q31 Talos Psi
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;
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D33 Talos Psi
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;
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;
F34 Talos Psi
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;
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A35 Talos Psi
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;
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A36 Talos Psi
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K38 Talos Psi
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A39 Talos Psi
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M40 Talos Psi
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;
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;
M41 Talos Psi
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D42 Talos Psi
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;
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Q43 Talos Psi
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S44 Talos Psi
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R45 Talos Psi
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;
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;
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;
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;
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;
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L53 Talos Psi
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I59 Talos Psi
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G61
D62
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G66
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V73 Talos Psi
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V8 Talos Psi
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M9 Talos Psi
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G10 Talos Psi
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I13 Talos Psi
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N14 Talos Psi
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G16 Talos Psi
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Q17 Talos Psi
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A18 Talos Psi
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R19 Talos Psi
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S20 Talos Psi
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A22 Talos Psi
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Y23 Talos Psi
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A24 Talos Psi
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A25 Talos Psi
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L26 Talos Psi
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K27 Talos Psi
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Q28 Talos Psi
A29 Dihedrals
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A29 Talos Psi
K30 Dihedrals
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233
;
K30 Talos Psi
Q31 Dihedrals
;
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Q31 Talos Psi
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D33 Talos Psi
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A36 Talos Psi
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I59 Talos Psi
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D62
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G66
K67
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R19 Talos Psi
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S20 Talos Psi
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A22 Talos Psi
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A24 Talos Psi
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A25 Talos Psi
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Q28 Talos Psi
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D33 Dihedrals
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D33 Talos Psi
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F34 Talos Psi
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;
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A35 Talos Psi
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A36 Talos Psi
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A37 Talos Psi
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K38 Talos Psi
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M46 Talos Psi
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V54 Talos Psi
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Q55 Talos Psi
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T56 Talos Psi
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I59 Talos Psi
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D62
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G64
E65
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G66
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L79 Talos Psi
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751
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HPR DIHEDRALS
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756
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