NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
50052 |
2jy8   |
15592 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1115 |
data_2jy8_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2jy8
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2jy8 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2jy8
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2jy8 "Master copy" parsed_2jy8
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2jy8
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2jy8.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 74 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 204 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . XPLOR/CNS 4 distance NOE simple 421 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . XPLOR/CNS 5 distance NOE simple 125 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . XPLOR/CNS 6 distance NOE simple 141 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . XPLOR/CNS 7 distance NOE simple 88 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . XPLOR/CNS 8 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 62 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . XPLOR/CNS 9 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2jy8 1
1 2jy8.mr . . "MR format" 10 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2jy8 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2jy8
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER PROTEIN BINDING 07-DEC-07 2JY8
*TITLE NMR STRUCTURE OF THE UBIQUITIN ASSOCIATED (UBA) DOMAIN OF
*TITLE 2 P62 (SQSTM1) IN COMPLEX WITH UBIQUITIN. RDC REFINED
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: UBIQUITIN-BINDING PROTEIN P62;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: UBA DOMAIN;
*COMPND 5 SYNONYM: SEQUESTOSOME-1, PHOSPHOTYROSINE-INDEPENDENT
*COMPND 6 LIGAND FOR THE LCK SH2 DOMAIN OF 62 KDA, EBI3-ASSOCIATED
*COMPND 7 PROTEIN OF 60 KDA, P60, EBIAP;
*COMPND 8 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;
*SOURCE 4 GENE: SQSTM1, ORCA, OSIL;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: BL21;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_VARIANT: (DE3);
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: VECTOR;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR: PGEX-4T-1
*KEYWDS UBIQUITIN BINDING, UBIQUITIN ASSOCIATED DOMAIN, HELICAL
*KEYWDS 2 BUNDLE, THREE HELICES, ALTERNATIVE SPLICING, APOPTOSIS,
*KEYWDS 3 CYTOPLASM, DIFFERENTIATION, DISEASE MUTATION, ENDOSOME,
*KEYWDS 4 IMMUNE RESPONSE, METAL-BINDING, NUCLEUS, PHOSPHOPROTEIN,
*KEYWDS 5 POLYMORPHISM, ZINC, ZINC-FINGER, PROTEIN BINDING
*EXPDTA NMR, 21 STRUCTURES
*AUTHOR J.E.LONG, R.LAYFIELD, M.S.SEARLE
*REVDAT 1 18-DEC-07 2JY8 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2jy8
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2jy8 1
2 1 . . . parsed_2jy8 1
3 1 . . . parsed_2jy8 1
4 1 . . . parsed_2jy8 1
5 1 . . . parsed_2jy8 1
6 1 . . . parsed_2jy8 1
7 1 . . . parsed_2jy8 1
8 1 . . . parsed_2jy8 1
9 1 . . . parsed_2jy8 1
10 1 . . . parsed_2jy8 1
11 1 . . . parsed_2jy8 1
12 1 . . . parsed_2jy8 1
13 1 . . . parsed_2jy8 1
14 1 . . . parsed_2jy8 1
15 1 . . . parsed_2jy8 1
16 1 . . . parsed_2jy8 1
17 1 . . . parsed_2jy8 1
18 1 . . . parsed_2jy8 1
19 1 . . . parsed_2jy8 1
20 1 . . . parsed_2jy8 1
21 1 . . . parsed_2jy8 1
22 1 . . . parsed_2jy8 1
23 1 . . . parsed_2jy8 1
24 1 . . . parsed_2jy8 1
25 1 . . . parsed_2jy8 1
26 1 . . . parsed_2jy8 1
27 1 . . . parsed_2jy8 1
28 1 . . . parsed_2jy8 1
29 1 . . . parsed_2jy8 1
30 1 . . . parsed_2jy8 1
31 1 . . . parsed_2jy8 1
32 1 . . . parsed_2jy8 1
33 1 . . . parsed_2jy8 1
34 1 . . . parsed_2jy8 1
35 1 . . . parsed_2jy8 1
36 1 . . . parsed_2jy8 1
37 1 . . . parsed_2jy8 1
38 1 . . . parsed_2jy8 1
39 1 . . . parsed_2jy8 1
40 1 . . . parsed_2jy8 1
41 1 . . . parsed_2jy8 1
42 1 . . . parsed_2jy8 1
43 1 . . . parsed_2jy8 1
44 1 . . . parsed_2jy8 1
45 1 . . . parsed_2jy8 1
46 1 . . . parsed_2jy8 1
47 1 . . . parsed_2jy8 1
48 1 . . . parsed_2jy8 1
49 1 . . . parsed_2jy8 1
50 1 . . . parsed_2jy8 1
51 1 . . . parsed_2jy8 1
52 1 . . . parsed_2jy8 1
53 1 . . . parsed_2jy8 1
54 1 . . . parsed_2jy8 1
55 1 . . . parsed_2jy8 1
56 1 . . . parsed_2jy8 1
57 1 . . . parsed_2jy8 1
58 1 . . . parsed_2jy8 1
59 1 . . . parsed_2jy8 1
60 1 . . . parsed_2jy8 1
61 1 . . . parsed_2jy8 1
62 1 . . . parsed_2jy8 1
63 1 . . . parsed_2jy8 1
64 1 . . . parsed_2jy8 1
65 1 . . . parsed_2jy8 1
66 1 . . . parsed_2jy8 1
67 1 . . . parsed_2jy8 1
68 1 . . . parsed_2jy8 1
69 1 . . . parsed_2jy8 1
70 1 . . . parsed_2jy8 1
71 1 . . . parsed_2jy8 1
72 1 . . . parsed_2jy8 1
73 1 . . . parsed_2jy8 1
74 1 . . . parsed_2jy8 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 9 . HN parsed_2jy8 1
1 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
2 1 1 . . . . . . . . . 10 . HA parsed_2jy8 1
2 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
3 1 1 . . . . . . . . . 10 . HB1 parsed_2jy8 1
3 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
4 1 1 . . . . . . . . . 10 . HD2# parsed_2jy8 1
4 1 2 . . . . . . . . . 38 . HD# parsed_2jy8 1
5 1 1 . . . . . . . . . 10 . HN parsed_2jy8 1
5 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
6 1 1 . . . . . . . . . 17 . HE# parsed_2jy8 1
6 1 2 . . . . . . . . . 17 . HG1 parsed_2jy8 1
7 1 1 . . . . . . . . . 17 . HE# parsed_2jy8 1
7 1 2 . . . . . . . . . 17 . HG2 parsed_2jy8 1
8 1 1 . . . . . . . . . 17 . HE# parsed_2jy8 1
8 1 2 . . . . . . . . . 29 . HD2# parsed_2jy8 1
9 1 1 . . . . . . . . . 20 . HE# parsed_2jy8 1
9 1 2 . . . . . . . . . 17 . HN parsed_2jy8 1
10 1 1 . . . . . . . . . 20 . HE# parsed_2jy8 1
10 1 2 . . . . . . . . . 20 . HG2 parsed_2jy8 1
11 1 1 . . . . . . . . . 20 . HE# parsed_2jy8 1
11 1 2 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
12 1 1 . . . . . . . . . 20 . HE# parsed_2jy8 1
12 1 2 . . . . . . . . . 22 . HE# parsed_2jy8 1
13 1 1 . . . . . . . . . 20 . HN parsed_2jy8 1
13 1 2 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
14 1 1 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
14 1 2 . . . . . . . . . 17 . HE# parsed_2jy8 1
15 1 1 . . . . . . . . . 22 . HE# parsed_2jy8 1
15 1 2 . . . . . . . . . 17 . HE# parsed_2jy8 1
16 1 1 . . . . . . . . . 22 . HZ parsed_2jy8 1
16 1 2 . . . . . . . . . 17 . HE# parsed_2jy8 1
17 1 1 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
17 1 2 . . . . . . . . . 20 . HB2 parsed_2jy8 1
18 1 1 . . . . . . . . . 22 . HA parsed_2jy8 1
18 1 2 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
19 1 1 . . . . . . . . . 22 . HB1 parsed_2jy8 1
19 1 2 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
20 1 1 . . . . . . . . . 22 . HE# parsed_2jy8 1
20 1 2 . . . . . . . . . 22 . HB1 parsed_2jy8 1
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21 1 2 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
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22 1 2 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
23 1 1 . . . . . . . . . 22 . HN parsed_2jy8 1
23 1 2 . . . . . . . . . 22 . HE# parsed_2jy8 1
24 1 1 . . . . . . . . . 22 . HZ parsed_2jy8 1
24 1 2 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
25 1 1 . . . . . . . . . 22 . HZ parsed_2jy8 1
25 1 2 . . . . . . . . . 22 . HE# parsed_2jy8 1
26 1 1 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
26 1 2 . . . . . . . . . 23 . HN parsed_2jy8 1
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27 1 2 . . . . . . . . . 23 . HA parsed_2jy8 1
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28 1 2 . . . . . . . . . 25 . HG2 parsed_2jy8 1
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31 1 2 . . . . . . . . . 44 . HD1# parsed_2jy8 1
32 1 1 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
32 1 2 . . . . . . . . . 48 . HB2 parsed_2jy8 1
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33 1 2 . . . . . . . . . 22 . HE# parsed_2jy8 1
34 1 1 . . . . . . . . . 25 . HN parsed_2jy8 1
34 1 2 . . . . . . . . . 22 . HD# parsed_2jy8 1
35 1 1 . . . . . . . . . 28 . HH2 parsed_2jy8 1
35 1 2 . . . . . . . . . 17 . HE# parsed_2jy8 1
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36 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
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37 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
38 1 1 . . . . . . . . . 34 . HN parsed_2jy8 1
38 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
39 1 1 . . . . . . . . . 35 . HN parsed_2jy8 1
39 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
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41 1 2 . . . . . . . . . 38 . HD# parsed_2jy8 1
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42 1 2 . . . . . . . . . 9 . HB1 parsed_2jy8 1
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44 1 1 . . . . . . . . . 38 . HD# parsed_2jy8 1
44 1 2 . . . . . . . . . 10 . HD1# parsed_2jy8 1
45 1 1 . . . . . . . . . 38 . HD# parsed_2jy8 1
45 1 2 . . . . . . . . . 14 . HD1# parsed_2jy8 1
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46 1 2 . . . . . . . . . 33 . HD1# parsed_2jy8 1
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47 1 2 . . . . . . . . . 34 . HB2 parsed_2jy8 1
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48 1 2 . . . . . . . . . 36 . HD1 parsed_2jy8 1
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49 1 2 . . . . . . . . . 36 . HD2 parsed_2jy8 1
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50 1 2 . . . . . . . . . 36 . HE2 parsed_2jy8 1
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51 1 2 . . . . . . . . . 37 . HA parsed_2jy8 1
52 1 1 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
52 1 2 . . . . . . . . . 37 . HB2 parsed_2jy8 1
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53 1 2 . . . . . . . . . 38 . HD# parsed_2jy8 1
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55 1 1 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
55 1 2 . . . . . . . . . 38 . HA parsed_2jy8 1
56 1 1 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
56 1 2 . . . . . . . . . 38 . HB1 parsed_2jy8 1
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57 1 2 . . . . . . . . . 38 . HN parsed_2jy8 1
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58 1 2 . . . . . . . . . 38 . HD# parsed_2jy8 1
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59 1 2 . . . . . . . . . 38 . HD# parsed_2jy8 1
60 1 1 . . . . . . . . . 39 . HN parsed_2jy8 1
60 1 2 . . . . . . . . . 38 . HE# parsed_2jy8 1
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61 1 2 . . . . . . . . . 17 . HG1 parsed_2jy8 1
62 1 1 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
62 1 2 . . . . . . . . . 45 . HB1 parsed_2jy8 1
63 1 1 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
63 1 2 . . . . . . . . . 45 . HB2 parsed_2jy8 1
64 1 1 . . . . . . . . . 49 . HA parsed_2jy8 1
64 1 2 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
65 1 1 . . . . . . . . . 49 . HB1 parsed_2jy8 1
65 1 2 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
66 1 1 . . . . . . . . . 49 . HB2 parsed_2jy8 1
66 1 2 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
67 1 1 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
67 1 2 . . . . . . . . . 49 . HE# parsed_2jy8 1
68 1 1 . . . . . . . . . 49 . HE# parsed_2jy8 1
68 1 2 . . . . . . . . . 49 . HB2 parsed_2jy8 1
69 1 1 . . . . . . . . . 49 . HN parsed_2jy8 1
69 1 2 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
70 1 1 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
70 1 2 . . . . . . . . . 50 . HA parsed_2jy8 1
71 1 1 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
71 1 2 . . . . . . . . . 50 . HN parsed_2jy8 1
72 1 1 . . . . . . . . . 49 . HE# parsed_2jy8 1
72 1 2 . . . . . . . . . 50 . HA parsed_2jy8 1
73 1 1 . . . . . . . . . 49 . HE# parsed_2jy8 1
73 1 2 . . . . . . . . . 50 . HB1 parsed_2jy8 1
74 1 1 . . . . . . . . . 50 . HB1 parsed_2jy8 1
74 1 2 . . . . . . . . . 49 . HD# parsed_2jy8 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
_Dist_constraint_value.Intensity_lower_val_err
_Dist_constraint_value.Intensity_upper_val_err
_Dist_constraint_value.Distance_val
_Dist_constraint_value.Distance_lower_bound_val
_Dist_constraint_value.Distance_upper_bound_val
_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . . . 5.0 1.8 7.5 parsed_2jy8 1
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420 1 . . . . . 2.8 1.8 4.8 parsed_2jy8 3
421 1 . . . . . 4.0 1.8 6.5 parsed_2jy8 3
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1 "clas intra" 1 1 1 10 parsed_2jy8 3
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_5
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2jy8
_Distance_constraint_list.ID 4
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 5
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
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_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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5 1 . . . parsed_2jy8 4
6 1 . . . parsed_2jy8 4
7 1 . . . parsed_2jy8 4
8 1 . . . parsed_2jy8 4
9 1 . . . parsed_2jy8 4
10 1 . . . parsed_2jy8 4
11 1 . . . parsed_2jy8 4
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15 1 . . . parsed_2jy8 4
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
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loop_
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