NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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498252 |
2l9e   |
17449 | cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 131 |
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1 "Conversion project" NMR . parsed_2l9e 1
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_Entry.Sf_category entry_information
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_Entry.Version_type original
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_Entry.Origination .
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_Entry.Experimental_method NMR
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loop_
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_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2l9e "Master copy" parsed_2l9e
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
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_Constraint_stat_list.ID 1
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_Constraint_file.Constraint_type
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2l9e.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2l9e 1
1 2l9e.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 526 parsed_2l9e 1
1 2l9e.mr . . XPLOR/CNS 3 planarity "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2l9e 1
1 2l9e.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 131 parsed_2l9e 1
1 2l9e.mr . . n/a 5 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2l9e 1
1 2l9e.mr . . XPLOR/CNS 6 distance "hydrogen bond" simple 0 parsed_2l9e 1
1 2l9e.mr . . "MR format" 7 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2l9e 1
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_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2l9e
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_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 4
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
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_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
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1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -98.0 -38.0 . . 31 . O3' . 32 . P . 32 . O5' . 32 . C5' parsed_2l9e 1
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12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148.0 208.0 . . 36 . P . 36 . O5' . 36 . C5' . 36 . C4' parsed_2l9e 1
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stop_
loop_
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_TA_constraint_comment_org.Torsion_angle_constraint_list_ID
1
;
=====================================================
Loop
=====================================================
*******
alpha
*******
C32
;
1 1 10 81 parsed_2l9e 1
2 U33 16 1 17 81 parsed_2l9e 1
3 mcm5s2U34 24 1 25 81 parsed_2l9e 1
4 U35 31 1 32 81 parsed_2l9e 1
5 U36 39 1 40 81 parsed_2l9e 1
6 ms2t6A37 46 1 47 81 parsed_2l9e 1
7 A38 53 1 54 81 parsed_2l9e 1
8
;
************
beta
************
C32
;
60 1 66 81 parsed_2l9e 1
9 U33 72 1 73 81 parsed_2l9e 1
10 U34 80 1 81 81 parsed_2l9e 1
11 U35 89 1 90 81 parsed_2l9e 1
12 U36 98 1 99 81 parsed_2l9e 1
13 A37 105 1 106 81 parsed_2l9e 1
14 A38 113 1 114 81 parsed_2l9e 1
15
;
*********
Chi
*********
C32
;
121 1 125 5 parsed_2l9e 1
16 U33 131 1 131 5 parsed_2l9e 1
17 mcm5s2U34 138 1 138 11 parsed_2l9e 1
18 U35 144 1 144 5 parsed_2l9e 1
19 U36 151 1 151 5 parsed_2l9e 1
20 A37 157 1 157 5 parsed_2l9e 1
21 A38 164 1 164 5 parsed_2l9e 1
22
;
*********
Epsilon
*********
C32
;
172 1 176 5 parsed_2l9e 1
23 U33 182 1 182 5 parsed_2l9e 1
24 mcm5s2U34 189 1 189 11 parsed_2l9e 1
25 U35 195 1 195 5 parsed_2l9e 1
26 U36 201 1 201 5 parsed_2l9e 1
27 ms2t6A37 207 1 207 10 parsed_2l9e 1
28 A38 214 1 214 5 parsed_2l9e 1
29
;
*********
Zeta
*********
C32
;
222 1 228 81 parsed_2l9e 1
30
;
U33
;
234 1 236 81 parsed_2l9e 1
31 mcm5s2U34 243 1 244 81 parsed_2l9e 1
32 U35 250 1 251 81 parsed_2l9e 1
33 U36 258 1 259 81 parsed_2l9e 1
34 ms2t6A37 265 1 266 81 parsed_2l9e 1
35 A38 272 1 273 81 parsed_2l9e 1
36
;
************
Sugar Pucker
************
C32 C3' endo
;
280 1 284 81 parsed_2l9e 1
37 "U36 C3' endo" 301 1 302 81 parsed_2l9e 1
38 "A37 C3' endo" 318 1 319 81 parsed_2l9e 1
39 "A38 C3' endo" 335 1 336 81 parsed_2l9e 1
40
;
######################################################
Tosion Angles from the Stem residues
######################################################
*******
alpha
*******
G27 (no constraint: no 5' phosphate in molecular model)
C28
;
352 1 364 81 parsed_2l9e 1
41 A29 371 1 372 81 parsed_2l9e 1
42 G30 378 1 379 81 parsed_2l9e 1
43 A31 385 1 386 81 parsed_2l9e 1
44 U39 393 1 394 81 parsed_2l9e 1
45 C40 400 1 401 81 parsed_2l9e 1
46 U41 407 1 408 81 parsed_2l9e 1
47 G42 415 1 416 81 parsed_2l9e 1
48 C43 422 1 423 81 parsed_2l9e 1
49
;
*************
beta
************
G27 - no 5' phosphate
G28
;
429 1 437 81 parsed_2l9e 1
50 A29 442 1 444 81 parsed_2l9e 1
51 G30 449 1 451 81 parsed_2l9e 1
52 A31 456 1 458 81 parsed_2l9e 1
53 U39 464 1 465 81 parsed_2l9e 1
54 C40 473 1 474 81 parsed_2l9e 1
55 U41 482 1 483 81 parsed_2l9e 1
56 G42 490 1 491 81 parsed_2l9e 1
57 C43 498 1 499 81 parsed_2l9e 1
58
;
************
Chi
************
G28
;
505 1 509 81 parsed_2l9e 1
59 A29 514 1 516 81 parsed_2l9e 1
60 G30 521 1 523 81 parsed_2l9e 1
61 A31 528 1 530 81 parsed_2l9e 1
62 U39 536 1 537 81 parsed_2l9e 1
63 C40 544 1 545 81 parsed_2l9e 1
64 U41 553 1 554 81 parsed_2l9e 1
65 G42 561 1 562 81 parsed_2l9e 1
66 C43 569 1 570 81 parsed_2l9e 1
67
;
************
Epsilon
************
G28
;
576 1 580 81 parsed_2l9e 1
68 A29 585 1 587 81 parsed_2l9e 1
69 G30 592 1 594 81 parsed_2l9e 1
70 A31 599 1 601 81 parsed_2l9e 1
71 U39 607 1 608 81 parsed_2l9e 1
72 C40 615 1 616 81 parsed_2l9e 1
73 U41 624 1 625 81 parsed_2l9e 1
74 G42 632 1 633 81 parsed_2l9e 1
75
;
C43
none
************
Zeta
************
C27
;
640 1 651 81 parsed_2l9e 1
76 C28 657 1 658 81 parsed_2l9e 1
77 A29 665 1 666 81 parsed_2l9e 1
78 G30 672 1 673 81 parsed_2l9e 1
79 A31 679 1 680 81 parsed_2l9e 1
80 U39 686 1 687 81 parsed_2l9e 1
81 C40 693 1 694 81 parsed_2l9e 1
82 U41 700 1 701 81 parsed_2l9e 1
83 G42 708 1 709 81 parsed_2l9e 1
84
;
C43 no 3' phosphate in model
************
Sugar Pucker
************
C28 C3' endo
nu0
;
715 1 723 5 parsed_2l9e 1
85 nu1 730 1 730 5 parsed_2l9e 1
86 nu2 737 1 737 5 parsed_2l9e 1
87 nu3 744 1 744 5 parsed_2l9e 1
88 nu4 750 1 750 5 parsed_2l9e 1
89
;
A29 C3' endo
nu0
;
756 1 757 5 parsed_2l9e 1
90 nu1 764 1 764 5 parsed_2l9e 1
91 nu2 771 1 771 5 parsed_2l9e 1
92 nu3 778 1 778 5 parsed_2l9e 1
93 nu4 784 1 784 5 parsed_2l9e 1
94
;
G30 C3' endo
nu0
;
790 1 791 5 parsed_2l9e 1
95 nu1 798 1 798 5 parsed_2l9e 1
96 nu2 805 1 805 5 parsed_2l9e 1
97 nu3 812 1 812 5 parsed_2l9e 1
98 nu4 818 1 818 5 parsed_2l9e 1
99
;
CYT 31 C3' endo
nu0
;
824 1 825 5 parsed_2l9e 1
100 nu1 832 1 832 5 parsed_2l9e 1
101 nu2 839 1 839 5 parsed_2l9e 1
102 nu3 846 1 846 5 parsed_2l9e 1
103 nu4 852 1 852 5 parsed_2l9e 1
104
;
A39 C3'endo
nu0
;
858 2 859 5 parsed_2l9e 1
105 nu1 866 1 866 5 parsed_2l9e 1
106 nu2 873 1 873 5 parsed_2l9e 1
107 nu3 880 1 880 5 parsed_2l9e 1
108 nu4 886 1 886 5 parsed_2l9e 1
109
;
C40 C3' endo
nu0
;
893 1 894 5 parsed_2l9e 1
110 nu1 901 1 901 5 parsed_2l9e 1
111 nu2 908 1 908 5 parsed_2l9e 1
112 nu3 915 1 915 5 parsed_2l9e 1
113 nu4 921 1 921 5 parsed_2l9e 1
114
;
ADE 41 C3'endo
nu0
;
927 1 928 5 parsed_2l9e 1
115 nu1 935 1 935 5 parsed_2l9e 1
116 nu2 942 1 942 5 parsed_2l9e 1
117 nu3 949 1 949 5 parsed_2l9e 1
118 nu4 955 1 955 5 parsed_2l9e 1
119
;
G42 C3'endo
nu0
;
961 1 962 5 parsed_2l9e 1
120 nu1 969 1 969 5 parsed_2l9e 1
121 nu2 976 1 976 5 parsed_2l9e 1
122 nu3 983 1 983 5 parsed_2l9e 1
123 nu4 989 1 989 5 parsed_2l9e 1
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