NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
|
Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
49206 |
2jrg   |
15331 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 729 |
data_2jrg_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2jrg
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2jrg 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2jrg
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2jrg "Master copy" parsed_2jrg
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2jrg
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2jrg.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2jrg 1
1 2jrg.mr . . XPLOR/CNS 2 distance "hydrogen bond" simple 28 parsed_2jrg 1
1 2jrg.mr . . XPLOR/CNS 3 planarity "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2jrg 1
1 2jrg.mr . . XPLOR/CNS 4 distance NOE simple 576 parsed_2jrg 1
1 2jrg.mr . . XPLOR/CNS 5 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 125 parsed_2jrg 1
1 2jrg.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2jrg 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2jrg
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA 26-JUN-07 2JRG
*TITLE NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE ANTICODON OF E. COLI TRNA-
*TITLE 2 VAL3 WITH 2 MODIFICATIONS (CMO5U34 M6A37)
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: 5'-R(*CP*CP*UP*CP*CP*CP*UP*(CM0)P*AP*CP*(6MZ)
*COMPND 3 P*AP*GP*GP*AP*GP*G)-3';
*COMPND 4 CHAIN: A;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES
*KEYWDS E.COLI, VALINE, TRNA, ANTICODON STEM LOOP, TRNA DOMAIN, RNA
*KEYWDS 2 HAIRPIN, URIDINE 5-OXYACETIC ACID, CMO5U, N6-
*KEYWDS 3 METHYLADENOSINE, M6A
*EXPDTA NMR, 11 STRUCTURES
*AUTHOR F.A.P.VENDEIX, A.DZIERGOWSKA, E.M.GUSTILO, W.D.GRAHAM,
*AUTHOR 2 B.SPROAT, A.MALKIEWICZ, P.F.AGRIS
*REVDAT 1 24-JUL-07 2JRG 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2jrg
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2jrg 1
2 1 . . . parsed_2jrg 1
3 1 . . . parsed_2jrg 1
4 1 . . . parsed_2jrg 1
5 1 . . . parsed_2jrg 1
6 1 . . . parsed_2jrg 1
7 1 . . . parsed_2jrg 1
8 1 . . . parsed_2jrg 1
9 1 . . . parsed_2jrg 1
10 1 . . . parsed_2jrg 1
11 1 . . . parsed_2jrg 1
12 1 . . . parsed_2jrg 1
13 1 . . . parsed_2jrg 1
14 1 . . . parsed_2jrg 1
15 1 . . . parsed_2jrg 1
16 1 . . . parsed_2jrg 1
17 1 . . . parsed_2jrg 1
18 1 . . . parsed_2jrg 1
19 1 . . . parsed_2jrg 1
20 1 . . . parsed_2jrg 1
21 1 . . . parsed_2jrg 1
22 1 . . . parsed_2jrg 1
23 1 . . . parsed_2jrg 1
24 1 . . . parsed_2jrg 1
25 1 . . . parsed_2jrg 1
26 1 . . . parsed_2jrg 1
27 1 . . . parsed_2jrg 1
28 1 . . . parsed_2jrg 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 43 . N1 parsed_2jrg 1
1 1 2 . . . . . . . . . 27 . N3 parsed_2jrg 1
2 1 1 . . . . . . . . . 43 . O6 parsed_2jrg 1
2 1 2 . . . . . . . . . 27 . N4 parsed_2jrg 1
3 1 1 . . . . . . . . . 43 . N2 parsed_2jrg 1
3 1 2 . . . . . . . . . 27 . O2 parsed_2jrg 1
4 1 1 . . . . . . . . . 43 . H1 parsed_2jrg 1
4 1 2 . . . . . . . . . 27 . N3 parsed_2jrg 1
5 1 1 . . . . . . . . . 43 . O6 parsed_2jrg 1
5 1 2 . . . . . . . . . 27 . H42 parsed_2jrg 1
6 1 1 . . . . . . . . . 43 . H22 parsed_2jrg 1
6 1 2 . . . . . . . . . 27 . O2 parsed_2jrg 1
7 1 1 . . . . . . . . . 42 . N1 parsed_2jrg 1
7 1 2 . . . . . . . . . 28 . N3 parsed_2jrg 1
8 1 1 . . . . . . . . . 42 . O6 parsed_2jrg 1
8 1 2 . . . . . . . . . 28 . N4 parsed_2jrg 1
9 1 1 . . . . . . . . . 42 . N2 parsed_2jrg 1
9 1 2 . . . . . . . . . 28 . O2 parsed_2jrg 1
10 1 1 . . . . . . . . . 42 . H1 parsed_2jrg 1
10 1 2 . . . . . . . . . 28 . N3 parsed_2jrg 1
11 1 1 . . . . . . . . . 42 . O6 parsed_2jrg 1
11 1 2 . . . . . . . . . 28 . H42 parsed_2jrg 1
12 1 1 . . . . . . . . . 42 . H22 parsed_2jrg 1
12 1 2 . . . . . . . . . 28 . O2 parsed_2jrg 1
13 1 1 . . . . . . . . . 41 . N1 parsed_2jrg 1
13 1 2 . . . . . . . . . 29 . N3 parsed_2jrg 1
14 1 1 . . . . . . . . . 41 . N6 parsed_2jrg 1
14 1 2 . . . . . . . . . 29 . O4 parsed_2jrg 1
15 1 1 . . . . . . . . . 41 . N1 parsed_2jrg 1
15 1 2 . . . . . . . . . 29 . H3 parsed_2jrg 1
16 1 1 . . . . . . . . . 41 . H62 parsed_2jrg 1
16 1 2 . . . . . . . . . 29 . O4 parsed_2jrg 1
17 1 1 . . . . . . . . . 40 . N1 parsed_2jrg 1
17 1 2 . . . . . . . . . 30 . N3 parsed_2jrg 1
18 1 1 . . . . . . . . . 40 . O6 parsed_2jrg 1
18 1 2 . . . . . . . . . 30 . N4 parsed_2jrg 1
19 1 1 . . . . . . . . . 40 . N2 parsed_2jrg 1
19 1 2 . . . . . . . . . 30 . O2 parsed_2jrg 1
20 1 1 . . . . . . . . . 40 . H1 parsed_2jrg 1
20 1 2 . . . . . . . . . 30 . N3 parsed_2jrg 1
21 1 1 . . . . . . . . . 40 . O6 parsed_2jrg 1
21 1 2 . . . . . . . . . 30 . H42 parsed_2jrg 1
22 1 1 . . . . . . . . . 40 . H22 parsed_2jrg 1
22 1 2 . . . . . . . . . 30 . O2 parsed_2jrg 1
23 1 1 . . . . . . . . . 39 . N1 parsed_2jrg 1
23 1 2 . . . . . . . . . 31 . N3 parsed_2jrg 1
24 1 1 . . . . . . . . . 39 . O6 parsed_2jrg 1
24 1 2 . . . . . . . . . 31 . N4 parsed_2jrg 1
25 1 1 . . . . . . . . . 39 . N2 parsed_2jrg 1
25 1 2 . . . . . . . . . 31 . O2 parsed_2jrg 1
26 1 1 . . . . . . . . . 39 . H1 parsed_2jrg 1
26 1 2 . . . . . . . . . 31 . N3 parsed_2jrg 1
27 1 1 . . . . . . . . . 39 . O6 parsed_2jrg 1
27 1 2 . . . . . . . . . 31 . H42 parsed_2jrg 1
28 1 1 . . . . . . . . . 39 . H22 parsed_2jrg 1
28 1 2 . . . . . . . . . 31 . O2 parsed_2jrg 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
_Dist_constraint_value.Intensity_lower_val_err
_Dist_constraint_value.Intensity_upper_val_err
_Dist_constraint_value.Distance_val
_Dist_constraint_value.Distance_lower_bound_val
_Dist_constraint_value.Distance_upper_bound_val
_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_2jrg 1
2 1 . . . . . 2.71 2.61 2.81 parsed_2jrg 1
3 1 . . . . . 3.08 2.98 3.18 parsed_2jrg 1
4 1 . . . . . 1.89 1.79 1.99 parsed_2jrg 1
5 1 . . . . . 1.71 1.61 1.81 parsed_2jrg 1
6 1 . . . . . 2.08 1.98 2.18 parsed_2jrg 1
7 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_2jrg 1
8 1 . . . . . 2.71 2.61 2.81 parsed_2jrg 1
9 1 . . . . . 3.08 2.98 3.18 parsed_2jrg 1
10 1 . . . . . 1.89 1.79 1.99 parsed_2jrg 1
11 1 . . . . . 1.71 1.61 1.81 parsed_2jrg 1
12 1 . . . . . 2.08 1.98 2.18 parsed_2jrg 1
13 1 . . . . . 2.95 2.85 3.05 parsed_2jrg 1
14 1 . . . . . 2.83 2.73 2.93 parsed_2jrg 1
15 1 . . . . . 1.93 1.83 2.03 parsed_2jrg 1
16 1 . . . . . 1.82 1.72 1.92 parsed_2jrg 1
17 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_2jrg 1
18 1 . . . . . 2.71 2.61 2.81 parsed_2jrg 1
19 1 . . . . . 3.08 2.98 3.18 parsed_2jrg 1
20 1 . . . . . 1.89 1.79 1.99 parsed_2jrg 1
21 1 . . . . . 1.71 1.61 1.81 parsed_2jrg 1
22 1 . . . . . 2.08 1.98 2.18 parsed_2jrg 1
23 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_2jrg 1
24 1 . . . . . 2.71 2.61 2.81 parsed_2jrg 1
25 1 . . . . . 3.08 2.98 3.18 parsed_2jrg 1
26 1 . . . . . 1.89 1.79 1.99 parsed_2jrg 1
27 1 . . . . . 1.71 1.61 1.81 parsed_2jrg 1
28 1 . . . . . 2.08 1.98 2.18 parsed_2jrg 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1
;
Stem restraints
for C27/ G43 base pair
;
1 1 3 26 parsed_2jrg 1
2 "for C28/ G42 base pair" 11 1 12 26 parsed_2jrg 1
3 "for U29/ A41 base pair" 20 1 21 25 parsed_2jrg 1
4 "for C30/ G40 base pair" 27 1 28 26 parsed_2jrg 1
5 "for C31/ G39 base pair" 36 1 37 26 parsed_2jrg 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_4
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2jrg
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 4
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2jrg 2
2 1 . . . parsed_2jrg 2
3 1 . . . parsed_2jrg 2
4 1 . . . parsed_2jrg 2
5 1 . . . parsed_2jrg 2
6 1 . . . parsed_2jrg 2
7 1 . . . parsed_2jrg 2
8 1 . . . parsed_2jrg 2
9 1 . . . parsed_2jrg 2
10 1 . . . parsed_2jrg 2
11 1 . . . parsed_2jrg 2
12 1 . . . parsed_2jrg 2
13 1 . . . parsed_2jrg 2
14 1 . . . parsed_2jrg 2
15 1 . . . parsed_2jrg 2
16 1 . . . parsed_2jrg 2
17 1 . . . parsed_2jrg 2
18 1 . . . parsed_2jrg 2
19 1 . . . parsed_2jrg 2
20 1 . . . parsed_2jrg 2
21 1 . . . parsed_2jrg 2
22 1 . . . parsed_2jrg 2
23 1 . . . parsed_2jrg 2
24 1 . . . parsed_2jrg 2
25 1 . . . parsed_2jrg 2
26 1 . . . parsed_2jrg 2
27 1 . . . parsed_2jrg 2
28 1 . . . parsed_2jrg 2
29 1 . . . parsed_2jrg 2
30 1 . . . parsed_2jrg 2
31 1 . . . parsed_2jrg 2
32 1 . . . parsed_2jrg 2
33 1 . . . parsed_2jrg 2
34 1 . . . parsed_2jrg 2
35 1 . . . parsed_2jrg 2
36 1 . . . parsed_2jrg 2
37 1 . . . parsed_2jrg 2
38 1 . . . parsed_2jrg 2
39 1 . . . parsed_2jrg 2
40 1 . . . parsed_2jrg 2
41 1 . . . parsed_2jrg 2
42 1 . . . parsed_2jrg 2
43 1 . . . parsed_2jrg 2
44 1 . . . parsed_2jrg 2
45 1 . . . parsed_2jrg 2
46 1 . . . parsed_2jrg 2
47 1 . . . parsed_2jrg 2
48 1 . . . parsed_2jrg 2
49 1 . . . parsed_2jrg 2
50 1 . . . parsed_2jrg 2
51 1 . . . parsed_2jrg 2
52 1 . . . parsed_2jrg 2
53 1 . . . parsed_2jrg 2
54 1 . . . parsed_2jrg 2
55 1 . . . parsed_2jrg 2
56 1 . . . parsed_2jrg 2
57 1 . . . parsed_2jrg 2
58 1 . . . parsed_2jrg 2
59 1 . . . parsed_2jrg 2
60 1 . . . parsed_2jrg 2
61 1 . . . parsed_2jrg 2
62 1 . . . parsed_2jrg 2
63 1 . . . parsed_2jrg 2
64 1 . . . parsed_2jrg 2
65 1 . . . parsed_2jrg 2
66 1 . . . parsed_2jrg 2
67 1 . . . parsed_2jrg 2
68 1 . . . parsed_2jrg 2
69 1 . . . parsed_2jrg 2
70 1 . . . parsed_2jrg 2
71 1 . . . parsed_2jrg 2
72 1 . . . parsed_2jrg 2
73 1 . . . parsed_2jrg 2
74 1 . . . parsed_2jrg 2
75 1 . . . parsed_2jrg 2
76 1 . . . parsed_2jrg 2
77 1 . . . parsed_2jrg 2
78 1 . . . parsed_2jrg 2
79 1 . . . parsed_2jrg 2
80 1 . . . parsed_2jrg 2
81 1 . . . parsed_2jrg 2
82 1 . . . parsed_2jrg 2
83 1 . . . parsed_2jrg 2
84 1 . . . parsed_2jrg 2
85 1 . . . parsed_2jrg 2
86 1 . . . parsed_2jrg 2
87 1 . . . parsed_2jrg 2
88 1 . . . parsed_2jrg 2
89 1 . . . parsed_2jrg 2
90 1 . . . parsed_2jrg 2
91 1 . . . parsed_2jrg 2
92 1 . . . parsed_2jrg 2
93 1 . . . parsed_2jrg 2
94 1 . . . parsed_2jrg 2
95 1 . . . parsed_2jrg 2
96 1 . . . parsed_2jrg 2
97 1 . . . parsed_2jrg 2
98 1 . . . parsed_2jrg 2
99 1 . . . parsed_2jrg 2
100 1 . . . parsed_2jrg 2
101 1 . . . parsed_2jrg 2
102 1 . . . parsed_2jrg 2
103 1 . . . parsed_2jrg 2
104 1 . . . parsed_2jrg 2
105 1 . . . parsed_2jrg 2
106 1 . . . parsed_2jrg 2
107 1 . . . parsed_2jrg 2
108 1 . . . parsed_2jrg 2
109 1 . . . parsed_2jrg 2
110 1 . . . parsed_2jrg 2
111 1 . . . parsed_2jrg 2
112 1 . . . parsed_2jrg 2
113 1 . . . parsed_2jrg 2
114 1 . . . parsed_2jrg 2
115 1 . . . parsed_2jrg 2
116 1 . . . parsed_2jrg 2
117 1 . . . parsed_2jrg 2
118 1 . . . parsed_2jrg 2
119 1 . . . parsed_2jrg 2
120 1 . . . parsed_2jrg 2
121 1 . . . parsed_2jrg 2
122 1 . . . parsed_2jrg 2
123 1 . . . parsed_2jrg 2
124 1 . . . parsed_2jrg 2
125 1 . . . parsed_2jrg 2
126 1 . . . parsed_2jrg 2
127 1 . . . parsed_2jrg 2
128 1 . . . parsed_2jrg 2
129 1 . . . parsed_2jrg 2
130 1 . . . parsed_2jrg 2
131 1 . . . parsed_2jrg 2
132 1 . . . parsed_2jrg 2
133 1 . . . parsed_2jrg 2
134 1 . . . parsed_2jrg 2
135 1 . . . parsed_2jrg 2
136 1 . . . parsed_2jrg 2
137 1 . . . parsed_2jrg 2
138 1 . . . parsed_2jrg 2
139 1 . . . parsed_2jrg 2
140 1 . . . parsed_2jrg 2
141 1 . . . parsed_2jrg 2
142 1 . . . parsed_2jrg 2
143 1 . . . parsed_2jrg 2
144 1 . . . parsed_2jrg 2
145 1 . . . parsed_2jrg 2
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stop_
loop_
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1
;
--------------------------------
Torsion Angles
--------------------------------
Loop
C32 C3' endo
;
1 1 8 17 parsed_2jrg 1
2 "C33 C3' endo" 24 1 25 81 parsed_2jrg 1
3
;
cmo5U34 unrestrained
A35 unrestrained
C36 C3' endo
;
41 1 48 81 parsed_2jrg 1
4
;
6MZ37 unrestrained
A38 C3' endo
;
64 1 69 81 parsed_2jrg 1
5
;
-----------------------------------------------
alpha: O3'-P-O5'-C5'
-----------------------------------------------
C32
;
85 1 88 5 parsed_2jrg 1
6 U33 95 1 95 7 parsed_2jrg 1
7
;
cmo5U34 unrestrained
A35
;
101 1 104 5 parsed_2jrg 1
8 C36 110 1 110 5 parsed_2jrg 1
9 6MZ37 117 1 117 8 parsed_2jrg 1
10 A38 123 1 123 5 parsed_2jrg 1
11
;
-----------------------------------------------------
beta: P-O5'-C5'-C4'
-----------------------------------------------------
C32
;
131 1 135 6 parsed_2jrg 1
12 U33 141 1 141 6 parsed_2jrg 1
13 cmo5U34 147 1 147 10 parsed_2jrg 1
14 A35 153 1 153 5 parsed_2jrg 1
15 C36 160 1 160 5 parsed_2jrg 1
16 6MZ37 166 1 166 7 parsed_2jrg 1
17
;
A38
assign (resid 38 and name P )
(resid 38 and name O5')
(resid 38 and name C5')
(resid 38 and name C4') 1.0 178 30.0 2
---------------------------------------------------
Xhi Purines = O4'-C1'-N9-C4
Pyrimidines = O4'-C1'-N1-C2
--------------------------------------------------
C32
;
173 1 185 5 parsed_2jrg 1
18 U33 191 1 191 5 parsed_2jrg 1
19 cmo5U34 197 1 197 9 parsed_2jrg 1
20 A35 203 1 203 5 parsed_2jrg 1
21 C36 209 1 209 5 parsed_2jrg 1
22 6MZ37 215 1 215 7 parsed_2jrg 1
23 A38 220 1 220 5 parsed_2jrg 1
24
;
-------------------------------------------------------
Epsilon: C4'-C3'-O3'-P
-------------------------------------------------------
C32
;
227 1 232 80 parsed_2jrg 1
25 U33 238 1 239 81 parsed_2jrg 1
26 cmo5U34 245 1 245 87 parsed_2jrg 1
27 A35 252 1 253 81 parsed_2jrg 1
28 C36 259 1 260 81 parsed_2jrg 1
29 6MZ37 267 1 268 81 parsed_2jrg 1
30 A38 274 1 275 81 parsed_2jrg 1
31
;
------------------------------------------
Zeta C3'-O3'-P-O5'
------------------------------------------
C32
;
281 1 284 6 parsed_2jrg 1
32 U33 291 1 291 5 parsed_2jrg 1
33
;
cmo5U34 unrestrained
A35
;
297 1 299 5 parsed_2jrg 1
34 C36 305 1 305 5 parsed_2jrg 1
35
;
6MZ37 unrestrained
A38
;
311 1 314 5 parsed_2jrg 1
36
;
Stem
C27 C3' endo
nu0
;
320 1 323 5 parsed_2jrg 1
37 nu1 330 1 330 5 parsed_2jrg 1
38 nu2 337 1 337 5 parsed_2jrg 1
39 nu3 344 1 344 5 parsed_2jrg 1
40 nu4 350 1 350 5 parsed_2jrg 1
41
;
C28 C3' endo
nu0
;
359 1 360 5 parsed_2jrg 1
42 nu1 367 1 367 5 parsed_2jrg 1
43 nu2 374 1 374 5 parsed_2jrg 1
44 nu3 381 1 381 5 parsed_2jrg 1
45 nu4 387 1 387 5 parsed_2jrg 1
46
;
U29 C3' endo
nu0
;
393 1 394 5 parsed_2jrg 1
47 nu1 401 1 401 5 parsed_2jrg 1
48 nu2 408 1 408 5 parsed_2jrg 1
49 nu3 415 1 415 5 parsed_2jrg 1
50 nu4 421 1 421 5 parsed_2jrg 1
51
;
C30 C3' endo
nu0
;
427 1 428 5 parsed_2jrg 1
52 nu1 435 1 435 5 parsed_2jrg 1
53 nu2 442 1 442 5 parsed_2jrg 1
54 nu3 449 1 449 5 parsed_2jrg 1
55 nu4 455 1 455 5 parsed_2jrg 1
56
;
C31 C3' endo
nu0
;
461 1 462 5 parsed_2jrg 1
57 nu1 469 1 469 5 parsed_2jrg 1
58 nu2 476 1 476 5 parsed_2jrg 1
59 nu3 483 1 483 5 parsed_2jrg 1
60 nu4 489 1 489 5 parsed_2jrg 1
61
;
G39 C3'endo
nu0
;
495 2 496 5 parsed_2jrg 1
62 nu1 503 1 503 5 parsed_2jrg 1
63 nu2 510 1 510 5 parsed_2jrg 1
64 nu3 517 1 517 5 parsed_2jrg 1
65 nu4 523 1 523 5 parsed_2jrg 1
66
;
G40 C3' endo
nu0
;
530 1 531 5 parsed_2jrg 1
67 nu1 538 1 538 5 parsed_2jrg 1
68 nu2 545 1 545 5 parsed_2jrg 1
69 nu3 552 1 552 5 parsed_2jrg 1
70 nu4 558 1 558 5 parsed_2jrg 1
71
;
A41 C3'endo
nu0
;
564 1 565 5 parsed_2jrg 1
72 nu1 572 1 572 5 parsed_2jrg 1
73 nu2 579 1 579 5 parsed_2jrg 1
74 nu3 586 1 586 5 parsed_2jrg 1
75 nu4 592 1 592 5 parsed_2jrg 1
76
;
G42 C3'endo
nu0
;
598 1 599 5 parsed_2jrg 1
77 nu1 606 1 606 5 parsed_2jrg 1
78 nu2 613 1 613 5 parsed_2jrg 1
79 nu3 620 1 620 5 parsed_2jrg 1
80 nu4 626 1 626 5 parsed_2jrg 1
81
;
G43 C2'endo
-----------------------------------------------
alpha: O3'-P-O5'-C5' and
-----------------------------------------------
C27 left unconstrained no 5' phosphate for this residue********
C28
;
632 1 640 5 parsed_2jrg 1
82 U29 646 1 646 5 parsed_2jrg 1
83 C30 652 1 652 5 parsed_2jrg 1
84 C31 658 1 658 5 parsed_2jrg 1
85 G39 664 2 664 6 parsed_2jrg 1
86 "GUA 40" 670 1 670 8 parsed_2jrg 1
87 A41 676 1 676 5 parsed_2jrg 1
88 G42 682 1 682 5 parsed_2jrg 1
89 G43 688 1 688 5 parsed_2jrg 1
90
;
-----------------------------------------------------
beta: P-O5'-C5'-C4'
-----------------------------------------------------
C27 no 5' Phosphate
C28
;
694 1 701 5 parsed_2jrg 1
91 U29 707 1 707 5 parsed_2jrg 1
92 C30 713 1 713 5 parsed_2jrg 1
93 C31 719 1 719 6 parsed_2jrg 1
94 G39 725 1 725 5 parsed_2jrg 1
95 "GUA 40" 732 1 732 8 parsed_2jrg 1
96 A41 738 1 738 5 parsed_2jrg 1
97 G42 744 1 744 5 parsed_2jrg 1
98 G43 750 1 750 5 parsed_2jrg 1
99
;
---------------------------------------------------
Xhi Purines = O4'-C1'-N9-C4
Pyrimidines = O4'-C1'-N1-C2
--------------------------------------------------
C27
;
755 1 760 5 parsed_2jrg 1
100 C28 766 1 766 5 parsed_2jrg 1
101 U29 771 1 771 5 parsed_2jrg 1
102 C30 777 1 777 5 parsed_2jrg 1
103 C31 783 1 783 5 parsed_2jrg 1
104 G39 789 1 789 5 parsed_2jrg 1
105 G40 795 1 795 5 parsed_2jrg 1
106 A41 801 1 801 5 parsed_2jrg 1
107 G42 807 1 807 5 parsed_2jrg 1
108 G43 813 1 813 5 parsed_2jrg 1
109
;
----------------------------------------------
Epsilon: C4'-C3'-O3'-P
----------------------------------------------
C27
;
819 1 824 81 parsed_2jrg 1
110 C28 830 1 831 81 parsed_2jrg 1
111 U29 837 1 838 81 parsed_2jrg 1
112 C30 844 1 845 81 parsed_2jrg 1
113 C31 851 1 852 79 parsed_2jrg 1
114 G39 858 1 859 81 parsed_2jrg 1
115 G40 865 1 866 81 parsed_2jrg 1
116 A41 873 1 874 81 parsed_2jrg 1
117 G42 881 1 882 81 parsed_2jrg 1
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