NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
406538 | 1xpa | 4249 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1xpa save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1119 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 31 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 1.680 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.206 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0119 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0015 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0542 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 2 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 3 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 4 ASP 0.058 0.058 1 0 "[ ]" 1 5 TYR 0.058 0.058 1 0 "[ ]" 1 6 VAL 0.151 0.089 1 0 "[ ]" 1 7 ILE 0.089 0.089 1 0 "[ ]" 1 8 CYS 0.029 0.015 1 0 "[ ]" 1 9 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 10 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 11 CYS 0.015 0.015 1 0 "[ ]" 1 12 GLY 0.044 0.044 1 0 "[ ]" 1 13 LYS 0.044 0.044 1 0 "[ ]" 1 14 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 15 PHE 0.014 0.014 1 0 "[ ]" 1 16 MET 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 17 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 18 SER 0.021 0.021 1 0 "[ ]" 1 19 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 20 LEU 0.013 0.013 1 0 "[ ]" 1 21 MET 0.023 0.023 1 0 "[ ]" 1 22 ASN 0.021 0.021 1 0 "[ ]" 1 23 HIS 0.046 0.046 1 0 "[ ]" 1 24 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 25 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 26 LEU 0.060 0.046 1 0 "[ ]" 1 27 PRO 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 28 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 29 CYS 0.021 0.021 1 0 "[ ]" 1 30 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 31 ASN 0.056 0.035 1 0 "[ ]" 1 32 CYS 0.035 0.035 1 0 "[ ]" 1 33 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 34 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 35 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 36 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 37 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 38 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 39 HIS 0.059 0.059 1 0 "[ ]" 1 40 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 41 LEU 0.097 0.067 1 0 "[ ]" 1 42 ILE 0.082 0.048 1 0 "[ ]" 1 43 THR 0.034 0.034 1 0 "[ ]" 1 44 LYS 0.048 0.048 1 0 "[ ]" 1 45 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 46 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 47 ALA 0.021 0.021 1 0 "[ ]" 1 48 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 49 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 50 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 51 TYR 0.154 0.154 1 0 "[ ]" 1 52 LEU 0.136 0.127 1 0 "[ ]" 1 53 LEU 0.287 0.154 1 0 "[ ]" 1 54 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 56 CYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 ASP 0.079 0.079 1 0 "[ ]" 1 58 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 59 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 60 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 61 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 62 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 63 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 64 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 65 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 66 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 67 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 68 ILE 0.176 0.080 1 0 "[ ]" 1 69 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 70 LYS 0.028 0.028 1 0 "[ ]" 1 71 LYS 0.028 0.028 1 0 "[ ]" 1 72 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 73 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 77 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 78 TRP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 79 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 80 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 81 MET 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 82 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 83 LEU 0.080 0.080 1 0 "[ ]" 1 84 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 85 LEU 0.161 0.161 1 0 "[ ]" 1 86 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 87 LEU 0.219 0.161 1 0 "[ ]" 1 88 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 89 ILE 0.021 0.021 1 0 "[ ]" 1 90 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 91 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 92 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 93 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 94 LEU 0.020 0.020 1 0 "[ ]" 1 95 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 96 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 97 TRP 0.077 0.045 1 0 "[ ]" 1 98 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 99 SER 0.020 0.020 1 0 "[ ]" 1 100 GLN 0.063 0.063 1 0 "[ ]" 1 101 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 102 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 103 LEU 0.095 0.063 1 0 "[ ]" 1 104 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 105 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 106 ALA 0.127 0.127 1 0 "[ ]" 1 107 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 108 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 109 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 110 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 111 GLN 0.206 0.206 1 0 "[ ]" 1 112 GLU 0.206 0.206 1 0 "[ ]" 1 113 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 3 PHE HA 1 3 PHE QD 3.000 . 5.000 2.815 2.815 2.815 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 3 PHE HA 1 6 VAL MG2 4.000 . 5.000 3.650 3.650 3.650 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 2 GLU HA 1 3 PHE H 3.000 . 3.000 2.381 2.381 2.381 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 3 PHE H 1 3 PHE HA 3.000 . 3.000 2.979 2.979 2.979 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 3 PHE H 1 3 PHE QB 3.000 . 3.600 2.598 2.598 2.598 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 4 ASP H 1 4 ASP QB 3.000 . 3.600 2.595 2.595 2.595 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 3 PHE HA 1 4 ASP H 3.000 . 3.000 2.192 2.192 2.192 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 3 PHE QB 1 4 ASP H 3.000 . 4.000 3.402 3.402 3.402 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 4 ASP H 1 5 TYR H 4.000 . 4.000 2.183 2.183 2.183 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 3 PHE QD 1 4 ASP HA 5.000 . 7.400 5.742 5.742 5.742 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 4 ASP HA 1 5 TYR QD 4.000 . 6.400 4.108 4.108 4.108 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 4 ASP HA 1 15 PHE HA 5.000 . 5.000 4.985 4.985 4.985 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 5 TYR HA 1 6 VAL MG2 5.000 . 6.000 4.411 4.411 4.411 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 4 ASP HA 1 5 TYR H 3.000 . 3.000 3.058 3.058 3.058 0.058 1 0 "[ ]" 1 15 1 4 ASP QB 1 5 TYR H 3.000 . 4.000 3.670 3.670 3.670 . 0 0 "[ ]" 1 16 1 5 TYR H 1 6 VAL MG1 5.000 . 6.000 5.039 5.039 5.039 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 5 TYR H 1 6 VAL MG2 5.000 . 6.000 2.638 2.638 2.638 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 5 TYR H 1 6 VAL H 4.000 . 4.000 2.205 2.205 2.205 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 5 TYR H 1 5 TYR QB 3.000 . 3.600 3.225 3.225 3.225 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 5 TYR H 1 5 TYR HA 3.000 . 3.000 2.946 2.946 2.946 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 6 VAL HA 1 6 VAL HB 3.000 . 3.000 3.027 3.027 3.027 0.027 1 0 "[ ]" 1 22 1 6 VAL HA 1 21 MET ME 4.000 . 5.000 4.030 4.030 4.030 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 6 VAL HA 1 6 VAL MG2 3.000 . 3.600 2.458 2.458 2.458 . 0 0 "[ ]" 1 24 1 6 VAL HA 1 6 VAL MG1 3.000 . 3.600 2.325 2.325 2.325 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 6 VAL HB 1 27 PRO HA 5.000 . 5.000 5.012 5.012 5.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 26 1 6 VAL HB 1 21 MET QG 4.000 . 5.000 3.775 3.775 3.775 . 0 0 "[ ]" 1 27 1 6 VAL MG1 1 16 MET HA 5.000 . 6.000 5.031 5.031 5.031 . 0 0 "[ ]" 1 28 1 6 VAL MG1 1 21 MET QB 5.000 . 7.000 2.652 2.652 2.652 . 0 0 "[ ]" 1 29 1 5 TYR QE 1 6 VAL MG1 5.000 . 8.400 5.770 5.770 5.770 . 0 0 "[ ]" 1 30 1 6 VAL MG1 1 27 PRO HA 4.000 . 5.000 2.390 2.390 2.390 . 0 0 "[ ]" 1 31 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