NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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|
39443 |
1t4l   |
cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 2630 |
data_1t4l_MR_file_constraints
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1t4l
_Study_list.ID 1
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_Study.ID
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1t4l 1
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_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1t4l
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1t4l "Master copy" parsed_1t4l
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1t4l
_Constraint_stat_list.ID 1
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_Constraint_file.Constraint_filename
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_Constraint_file.Software_label
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1t4l.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1t4l 1
1 1t4l.mr . . XPLOR/CNS 2 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 227 parsed_1t4l 1
1 1t4l.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 744 parsed_1t4l 1
1 1t4l.mr . . XPLOR/CNS 4 distance NOE simple 1580 parsed_1t4l 1
1 1t4l.mr . . XPLOR/CNS 5 distance NOE ambi 36 parsed_1t4l 1
1 1t4l.mr . . XPLOR/CNS 6 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 43 parsed_1t4l 1
1 1t4l.mr . . "MR format" 7 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1t4l 1
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_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1t4l
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_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA BINDING PROTEIN/RNA 29-APR-04 1T4L
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF DOUBLE-STRANDED RNA BINDING DOMAIN OF
*TITLE 2 S. CEREVISIAE RNASE III (RNT1P) IN COMPLEX WITH THE 5'
*TITLE 3 TERMINAL RNA HAIRPIN OF SNR47 PRECURSOR
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: 5' TERMINAL HAIRPIN OF SNR47 PRECURSOR;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: AGAA TETRALOOP RNA HAIRPIN;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES;
*COMPND 6 MOL_ID: 2;
*COMPND 7 MOLECULE: RIBONUCLEASE III;
*COMPND 8 CHAIN: B;
*COMPND 9 FRAGMENT: DOUBLE-STRANDED RNA BINDING DOMAIN;
*COMPND 10 SYNONYM: RNASE III;
*COMPND 11 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES;
*SOURCE 3 MOL_ID: 2;
*SOURCE 4 ORGANISM_SCIENTIFIC: SACCHAROMYCES CEREVISIAE;
*SOURCE 5 ORGANISM_COMMON: YEAST;
*SOURCE 6 GENE: RNT1, YMR239C, YM9408.01C, YM9959.21;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_COMMON: BACTERIA;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: BL21;
*SOURCE 10 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PGEX-2T
*KEYWDS DSRBD, RNASE III, AGNN TETRALOOP, PROTEIN-RNA COMPLEX
*EXPDTA NMR, 15 STRUCTURES
*AUTHOR H.WU, A.HENRAS, G.CHANFREAU, J.FEIGON
*REVDAT 1 01-JUN-04 1T4L 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_dihedral_2
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_1t4l
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 2
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Torsion_angle_constraint.ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_1
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_3
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_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Seq_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Angle_lower_bound_val
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_Torsion_angle_constraint.Source_experiment_ID
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_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 1 . O4' . 1 . C1' . 1 . N9 . 1 . C4 parsed_1t4l 1
2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 2 . O4' . 2 . C1' . 2 . N9 . 2 . C4 parsed_1t4l 1
3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 3 . O4' . 3 . C1' . 3 . N9 . 3 . C4 parsed_1t4l 1
4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 4 . O4' . 4 . C1' . 4 . N9 . 4 . C4 parsed_1t4l 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 5 . O4' . 5 . C1' . 5 . N1 . 5 . C2 parsed_1t4l 1
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12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 12 . O4' . 12 . C1' . 12 . N1 . 12 . C2 parsed_1t4l 1
13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 13 . O4' . 13 . C1' . 13 . N1 . 13 . C2 parsed_1t4l 1
14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 14 . O4' . 14 . C1' . 14 . N1 . 14 . C2 parsed_1t4l 1
15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -220.0 -100.0 . . 15 . O4' . 15 . C1' . 15 . N9 . 15 . C4 parsed_1t4l 1
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31 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 31 . O4' . 31 . C1' . 31 . N1 . 31 . C2 parsed_1t4l 1
32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -190.0 -130.0 . . 32 . O4' . 32 . C1' . 32 . N1 . 32 . C2 parsed_1t4l 1
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42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 10 . O3' . 11 . P . 11 . O5' . 11 . C5' parsed_1t4l 1
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stop_
loop_
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163 1 2 . . . . . . . . . 377 . HN parsed_1t4l 2
164 1 1 . . . . . . . . . 376 . HN parsed_1t4l 2
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165 1 2 . . . . . . . . . 377 . HD** parsed_1t4l 2
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281 1 1 . . . . . . . . . 384 . HB2 parsed_1t4l 2
281 1 2 . . . . . . . . . 407 . HA2 parsed_1t4l 2
282 1 1 . . . . . . . . . 384 . HD* parsed_1t4l 2
282 1 2 . . . . . . . . . 407 . HA* parsed_1t4l 2
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1359 1 2 . . . . . . . . . 378 . HD1* parsed_1t4l 2
1360 1 1 . . . . . . . . . 441 . HE* parsed_1t4l 2
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1361 1 1 . . . . . . . . . 441 . HE* parsed_1t4l 2
1361 1 2 . . . . . . . . . 383 . HD2* parsed_1t4l 2
1362 1 1 . . . . . . . . . 441 . HE* parsed_1t4l 2
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1430 1 2 . . . . . . . . . 444 . HB* parsed_1t4l 2
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stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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1580 1 . . . . . 4.50 1.80 4.50 parsed_1t4l 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1 "1579 protein noes" 1 1 1 20 parsed_1t4l 2
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_5
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1t4l
_Distance_constraint_list.ID 3
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
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_Distance_constraint_list.Block_ID 5
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loop_
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_Dist_constraint_tree.Node_ID
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_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . parsed_1t4l 3
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4 1 . . . parsed_1t4l 3
5 1 . . . parsed_1t4l 3
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7 1 . . . parsed_1t4l 3
8 1 . . . parsed_1t4l 3
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15 1 . . . parsed_1t4l 3
16 1 . . . parsed_1t4l 3
17 1 . . . parsed_1t4l 3
18 1 . . . parsed_1t4l 3
19 1 . . . parsed_1t4l 3
20 1 . . . parsed_1t4l 3
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27 1 . . . parsed_1t4l 3
28 1 . . . parsed_1t4l 3
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30 1 . . . parsed_1t4l 3
31 1 . . . parsed_1t4l 3
32 1 . . . parsed_1t4l 3
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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5 1 2 . . . . . . . . . 368 . HG* parsed_1t4l 3
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11 1 2 . . . . . . . . . 373 . HA parsed_1t4l 3
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12 1 2 . . . . . . . . . 373 . HA parsed_1t4l 3
12 1 2 . . . . . . . . . 374 . HA parsed_1t4l 3
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loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
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12 1 . . . . . 3.00 1.80 3.00 parsed_1t4l 3
13 1 . . . . . 4.50 1.80 4.50 parsed_1t4l 3
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15 1 . . . . . 4.50 1.80 4.50 parsed_1t4l 3
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20 1 . . . . . 3.00 1.80 3.00 parsed_1t4l 3
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stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
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save_
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