NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
34918 |
1kpz   |
5278 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 368 |
data_1kpz_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1kpz
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1kpz 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1kpz
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1kpz "Master copy" parsed_1kpz
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1kpz
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1kpz.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1kpz 1
1 1kpz.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 330 parsed_1kpz 1
1 1kpz.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 38 parsed_1kpz 1
1 1kpz.mr . . "MR format" 4 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1kpz 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1kpz
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA 03-JAN-02 1KPZ
*TITLE PEMV-1 P1-P2 FRAMESHIFTING PSEUDOKNOT REGULARIZED AVERAGE
*TITLE 2 STRUCTURE
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: P1-P2 FRAMESHIFTING PSEUDOKNOT;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES;
*COMPND 5 OTHER_DETAILS: PEA ENATION MOSAIC VIRUS TYPE I RNA
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES;
*SOURCE 3 OTHER_DETAILS: NATURALLY OCCURING SEQUENCE OF THE P1-P2
*SOURCE 4 FRAMESHIFTING PSEUDOKNOT FROM PEA ENATION MOSAIC VIRUS
*SOURCE 5 TYPE I. IN VITRO SP6 TRANSCRIPTION.
*KEYWDS PSEUDOKNOT, NMR, FRAMESHIFTING, LUTEOVIRUS, TRIPLE HELIX,
*KEYWDS 2 PROTONATED CYTIDINE, RIBONUCLEIC ACID
*EXPDTA NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE
*AUTHOR P.L.NIXON, D.P.GIEDROC
*REVDAT 1 11-JAN-02 1KPZ 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1kpz
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1kpz 1
2 1 . . . parsed_1kpz 1
3 1 . . . parsed_1kpz 1
4 1 . . . parsed_1kpz 1
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6 1 . . . parsed_1kpz 1
7 1 . . . parsed_1kpz 1
8 1 . . . parsed_1kpz 1
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10 1 . . . parsed_1kpz 1
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14 1 . . . parsed_1kpz 1
15 1 . . . parsed_1kpz 1
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18 1 . . . parsed_1kpz 1
19 1 . . . parsed_1kpz 1
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21 1 . . . parsed_1kpz 1
22 1 . . . parsed_1kpz 1
23 1 . . . parsed_1kpz 1
24 1 . . . parsed_1kpz 1
25 1 . . . parsed_1kpz 1
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28 1 . . . parsed_1kpz 1
29 1 . . . parsed_1kpz 1
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36 1 . . . parsed_1kpz 1
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39 1 . . . parsed_1kpz 1
40 1 . . . parsed_1kpz 1
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43 1 . . . parsed_1kpz 1
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54 1 . . . parsed_1kpz 1
55 1 . . . parsed_1kpz 1
56 1 . . . parsed_1kpz 1
57 1 . . . parsed_1kpz 1
58 1 . . . parsed_1kpz 1
59 1 . . . parsed_1kpz 1
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115 1 . . . parsed_1kpz 1
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129 1 . . . parsed_1kpz 1
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131 1 . . . parsed_1kpz 1
132 1 . . . parsed_1kpz 1
133 1 . . . parsed_1kpz 1
134 1 . . . parsed_1kpz 1
135 1 . . . parsed_1kpz 1
136 1 . . . parsed_1kpz 1
137 1 . . . parsed_1kpz 1
138 1 . . . parsed_1kpz 1
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stop_
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_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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6 1 2 . . . . . . . . . 1 . H2 parsed_1kpz 1
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1 1 2 . . . . . . . . . 19 . N1 parsed_1kpz 2
2 1 1 . . . . . . . . . 4 . O4 parsed_1kpz 2
2 1 2 . . . . . . . . . 19 . N6 parsed_1kpz 2
3 1 1 . . . . . . . . . 5 . N3 parsed_1kpz 2
3 1 2 . . . . . . . . . 18 . N1 parsed_1kpz 2
4 1 1 . . . . . . . . . 5 . N4 parsed_1kpz 2
4 1 2 . . . . . . . . . 18 . O6 parsed_1kpz 2
5 1 1 . . . . . . . . . 5 . O2 parsed_1kpz 2
5 1 2 . . . . . . . . . 18 . N2 parsed_1kpz 2
6 1 1 . . . . . . . . . 6 . N3 parsed_1kpz 2
6 1 2 . . . . . . . . . 17 . N1 parsed_1kpz 2
7 1 1 . . . . . . . . . 6 . N4 parsed_1kpz 2
7 1 2 . . . . . . . . . 17 . O6 parsed_1kpz 2
8 1 1 . . . . . . . . . 6 . O2 parsed_1kpz 2
8 1 2 . . . . . . . . . 17 . N2 parsed_1kpz 2
9 1 1 . . . . . . . . . 7 . N1 parsed_1kpz 2
9 1 2 . . . . . . . . . 16 . N3 parsed_1kpz 2
10 1 1 . . . . . . . . . 7 . O6 parsed_1kpz 2
10 1 2 . . . . . . . . . 16 . N4 parsed_1kpz 2
11 1 1 . . . . . . . . . 7 . N2 parsed_1kpz 2
11 1 2 . . . . . . . . . 16 . O2 parsed_1kpz 2
12 1 1 . . . . . . . . . 8 . N1 parsed_1kpz 2
12 1 2 . . . . . . . . . 15 . N3 parsed_1kpz 2
13 1 1 . . . . . . . . . 8 . O6 parsed_1kpz 2
13 1 2 . . . . . . . . . 15 . N4 parsed_1kpz 2
14 1 1 . . . . . . . . . 8 . N2 parsed_1kpz 2
14 1 2 . . . . . . . . . 15 . O2 parsed_1kpz 2
15 1 1 . . . . . . . . . 13 . N3 parsed_1kpz 2
15 1 2 . . . . . . . . . 28 . N1 parsed_1kpz 2
16 1 1 . . . . . . . . . 13 . N4 parsed_1kpz 2
16 1 2 . . . . . . . . . 28 . O6 parsed_1kpz 2
17 1 1 . . . . . . . . . 13 . O2 parsed_1kpz 2
17 1 2 . . . . . . . . . 28 . N2 parsed_1kpz 2
18 1 1 . . . . . . . . . 13 . O2 parsed_1kpz 2
18 1 2 . . . . . . . . . 28 . H21 parsed_1kpz 2
19 1 1 . . . . . . . . . 13 . H41 parsed_1kpz 2
19 1 2 . . . . . . . . . 28 . O6 parsed_1kpz 2
20 1 1 . . . . . . . . . 12 . N1 parsed_1kpz 2
20 1 2 . . . . . . . . . 29 . N3 parsed_1kpz 2
21 1 1 . . . . . . . . . 12 . N6 parsed_1kpz 2
21 1 2 . . . . . . . . . 29 . O4 parsed_1kpz 2
22 1 1 . . . . . . . . . 12 . N6 parsed_1kpz 2
22 1 2 . . . . . . . . . 10 . O2 parsed_1kpz 2
23 1 1 . . . . . . . . . 11 . N1 parsed_1kpz 2
23 1 2 . . . . . . . . . 30 . N3 parsed_1kpz 2
24 1 1 . . . . . . . . . 11 . O6 parsed_1kpz 2
24 1 2 . . . . . . . . . 30 . N4 parsed_1kpz 2
25 1 1 . . . . . . . . . 11 . N2 parsed_1kpz 2
25 1 2 . . . . . . . . . 30 . O2 parsed_1kpz 2
26 1 1 . . . . . . . . . 10 . N3 parsed_1kpz 2
26 1 2 . . . . . . . . . 28 . O6 parsed_1kpz 2
27 1 1 . . . . . . . . . 10 . N4 parsed_1kpz 2
27 1 2 . . . . . . . . . 28 . N7 parsed_1kpz 2
28 1 1 . . . . . . . . . 9 . N3 parsed_1kpz 2
28 1 2 . . . . . . . . . 27 . N7 parsed_1kpz 2
29 1 1 . . . . . . . . . 9 . O4 parsed_1kpz 2
29 1 2 . . . . . . . . . 27 . N6 parsed_1kpz 2
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30 1 2 . . . . . . . . . 27 . N7 parsed_1kpz 2
31 1 1 . . . . . . . . . 15 . O2' parsed_1kpz 2
31 1 2 . . . . . . . . . 27 . N1 parsed_1kpz 2
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32 1 2 . . . . . . . . . 27 . N1 parsed_1kpz 2
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33 1 2 . . . . . . . . . 25 . N1 parsed_1kpz 2
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34 1 2 . . . . . . . . . 25 . N1 parsed_1kpz 2
35 1 1 . . . . . . . . . 8 . H22 parsed_1kpz 2
35 1 2 . . . . . . . . . 26 . N1 parsed_1kpz 2
36 1 1 . . . . . . . . . 8 . N3 parsed_1kpz 2
36 1 2 . . . . . . . . . 26 . H61 parsed_1kpz 2
37 1 1 . . . . . . . . . 8 . N3 parsed_1kpz 2
37 1 2 . . . . . . . . . 26 . N6 parsed_1kpz 2
38 1 1 . . . . . . . . . 8 . N2 parsed_1kpz 2
38 1 2 . . . . . . . . . 26 . N1 parsed_1kpz 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
_Dist_constraint_value.Intensity_lower_val_err
_Dist_constraint_value.Intensity_upper_val_err
_Dist_constraint_value.Distance_val
_Dist_constraint_value.Distance_lower_bound_val
_Dist_constraint_value.Distance_upper_bound_val
_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . . . 2.8 2.70 2.90 parsed_1kpz 2
2 1 . . . . . 2.8 2.70 2.90 parsed_1kpz 2
3 1 . . . . . 2.95 2.85 3.05 parsed_1kpz 2
4 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_1kpz 2
5 1 . . . . . 2.86 2.76 2.96 parsed_1kpz 2
6 1 . . . . . 2.95 2.85 3.05 parsed_1kpz 2
7 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_1kpz 2
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9 1 . . . . . 2.95 2.85 3.05 parsed_1kpz 2
10 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_1kpz 2
11 1 . . . . . 2.86 2.76 2.96 parsed_1kpz 2
12 1 . . . . . 2.95 2.85 3.05 parsed_1kpz 2
13 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_1kpz 2
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22 1 . . . . . 1.90 1.80 2.00 parsed_1kpz 2
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24 1 . . . . . 2.91 2.81 3.01 parsed_1kpz 2
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31 1 . . . . . 2.9 2.80 3.00 parsed_1kpz 2
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33 1 . . . . . 2.9 2.80 3.00 parsed_1kpz 2
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stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1 "assign (residue 13 and name N3 )(residue 28 and anem H1 ) 1.90 0.10 0.10" 18 1 18 78 parsed_1kpz 2
stop_
save_
Contact the webmaster for help, if required. Sunday, April 28, 2024 7:52:52 PM GMT (wattos1)