NMR Restraints Grid

Result table
 (Save to zip file containing files for each block)

image mrblock_id pdb_id bmrb_id cing stage position program type subtype subsubtype
634288 6gvt 34290 cing 1-original 3 DYANA/DIANA distance NOE simple


############################################ Restraints file 3: hybrid-structure-inter-restraints-cyana.rstr
####################################################
####################################################
#Intermolecular NOEs HYBRID STRUCTURE
####################################################
####################################################


####################################################
#R311 ##############################################  

  5 GUA H4'     311 ARG  QG     5.10 #

  5 GUA H1'     311 ARG  QG     4.60 #

  5 GUA H4'     311 ARG  QD     4.70 #

  5 GUA Q2'     311 ARG  QD     4.60 #

  5 GUA H1'     311 ARG  QD     4.50 #

#END
####################################################


####################################################
#W314 ##############################################

  5 GUA Q2'     314 TRP  QB     4.50 #

  5 GUA H1'     314 TRP  QB     4.10 #

#END
####################################################


####################################################
#H315 ##############################################

  6 CYT Q5'     315 HIS  HE1    4.30 #
  6 CYT H4'     315 HIS  HE1    0.00 #

  6 CYT H3'     315 HIS  HE1    4.40 #

  6 CYT Q2      315 HIS  HE1    5.40 #

#END 
####################################################

 
####################################################
#L318 ##############################################

  7 THY Q7      318 LEU  QD1    5.20 #
 
  6 CYT H4'     318 LEU  QD1    5.40 #

  6 CYT H1'     318 LEU  QD1    5.60 #
  
#END
####################################################


####################################################
#K322 ##############################################

  7 THY Q7      322 LYS  QE     5.60 #

#END
####################################################


####################################################
#W347 ##############################################

  2 THY Q2'      347 TRP  HH2    4.00 #
  3 GUA Q2'	 347 TRP  HH2    0.00 #

  2 THY Q5'      347 TRP  HH2    5.40 #

  2 THY H1'      347 TRP  HH2    5.30 #

  2 THY Q2'      347  TRP HZ2    4.00 #
  3 GUA Q2'      347  TRP HZ2    0.00 #

  2 THY H3'      347 TRP  HH2    4.00 #

  2 THY H3'      347 TRP  HZ2    3.40 #
  3 GUA H3'      347 TRP  HZ2    0.00 #

  3 GUA H8       347 TRP  HZ2    4.00 #
  3 GUA H8       347 TRP  HE1    4.50 #
  3 GUA H8       347 TRP  HH2    4.50 #

#END  
#################################################### 


####################################################
#K351 ##############################################

  2 THY H1'      351 LYS  QE     4.00 #

  2 THY Q2'      351 LYS  QE     4.00 #

#END
####################################################


####################################################
#Y352 ##############################################

  4 THY Q7      352 TYR  HE1    4.90 #

  4 THY Q7      352 TYR  HD1    4.10 #

#END
####################################################


####################################################
#I355 ##############################################

  4 THY Q7      355 ILE  QD1    5.20 #

  2 THY Q2'     355 ILE  QD1    4.00 #

  2 THY Q5'     355 ILE  QD1    5.60 #

  2 THY H3'     355 ILE  QD1    4.90 #

  2 THY H6      355 ILE  QD1    4.80 #

  4 THY Q7      355 ILE  QG2    3.60 #

  2 THY Q7      355 ILE  QG1    5.10 #

  2 THY Q2'     355 ILE  QG1    5.20 #  

  1 CYT H3'     355 ILE  QG1    5.70 #

  2 THY H6      355 ILE  QG1    5.10 #
  4 THY H6      355 ILE  QG2    5.00 #

  4 THY Q7      355 ILE  HB     4.50 #

#END
####################################################


####################################################
#Y367 ##############################################

 7 THY Q7     367 TYR  QD       5.80 #

#END
####################################################


####################################################
#V363 ##############################################
 
  7 THY Q7      363 VAL  QG1    4.70 #

  6 CYT H5      363 VAL  QG2    5.30 #

  6 CYT H1'     363 VAL  QG1    4.60 #

#END
####################################################


####################################################

  5 GUA  H1     356 THR  QG2    3.20 #

  5 GUA  H1     356 THR  HG1    3.00 #

  5 GUA  H22    313 ASP  HB2    3.80 #
  5 GUA  H21    313 ASP  HB2    0.00 #

  5 GUA  H22    313 ASP  HB3    4.70 #
  5 GUA  H21    313 ASP  HB3    0.00 #

  5 GUA  H22    313 ASP  H      4.70 #
  5 GUA  H21    313 ASP  H      0.00 #
 
  5 GUA  H1     356 THR  HB     4.20 #

  5 GUA  H1     352 TYR  QE     3.50 #

  5 GUA  H22    314 TRP  H      4.20 #
  5 GUA  H21    314 TRP  H      0.00 #

  5 GUA  H1     314 TRP  HE3    4.10 #

  5 GUA  H22    314 TRP  HE3    4.10 #
  5 GUA  H21    314 TRP  HE3    0.00 #

  5 GUA  H1       4 THY  Q7     3.50 #

####################################################


####################################################

  4 THY  H3     352 TYR  HE1    4.40 #

  4 THY  H3     310 SER  QB     3.00 #

  4 THY  H3     310 SER  H      4.70 #

  4 THY  H3     310 SER  HG     4.00 #

#####################################################

 
#####################################################

  3 GUA  H22    340 LYS  H      5.40 #

  3 GUA  H21    340 LYS  H      5.40 #

  3 GUA  H1     340 LYS  QG     4.60 #

  3 GUA  H1     340 LYS  QD     5.20 #

#####################################################


#####################################################

  3 GUA  H1     310 SER  H      5.30 #

  3 GUA  H22    310 SER  H      4.10 #

  3 GUA  H21    310 SER  H      4.50 #

  3 GUA  H22    310 SER  QB     4.50 #
  3 GUA  H21    310 SER  QB     0.00 #

  3 GUA  H22    309 ARG  QD     5.10 #
  3 GUA  H21    309 ARG  QD     0.00 #

  3 GUA  H1     341 ALA  H      5.50 #

#####################################################


#####################################################
#####################################################
#END
#####################################################
#####################################################


##################################################
#Restraints obtained from solid-state experiments#
#only upper limits are defined in this case      #
##################################################
# J.BOUDET, T.WIEGAND, B.MEIER, F.ALLAIN         #
##################################################


##################################################
# pocket 2########################################

410 ATP PG	340 LYS CA	7.0 #
410 ATP PG	342 LYS CA	7.0 #     

410 ATP PG	342 LYS CB	7.0 #
410 ATP PG	342 LYS CG	0.0 #
410 ATP PG	342 LYS CD	0.0 #

410 ATP PA	340 LYS CB	7.0 #
410 ATP PA	340 LYS CG	0.0 #
410 ATP PA	340 LYS CD	0.0 #

342 LYS NZ	410 ATP PG	7.0 #

340 LYS NZ	410 ATP PA	8.0 #


410 ATP PG	340 LYS N	7.0 #
410 ATP PG      341 ALA N       0.0 #
410 ATP PG      342 LYS N       0.0 #

410 ATP PG      347 TRP CE3    10.0 #
410 ATP PG      347 TRP CZ3     0.0 #

410 ATP PB      340 LYS CA      8.0 #

##################################################


##################################################
# pocket1#########################################

400 ATP PG	308 ASP N	7.0 #
400 ATP PG	309 ARG N	0.0 #
400 ATP PG	310 SER	N	0.0 #
400 ATP PG	311 ARG N	0.0 #

400 ATP PB	310 SER CA	8.0 #
400 ATP PB	309 ARG CA	8.0 #

400 ATP PG	340 LYS CB	8.0 #
400 ATP PG	340 LYS CG	0.0 #

400 ATP PG	340 LYS CD	8.0 #

400 ATP PG	340 LYS CA	8.0 #

##################################################


##################################################
#hbd - DNA correlations###########################

366 LYS NZ      9 ADE P         8.0 #

351 LYS NZ      3 GUA P         8.0 #
340 LYS NZ      3 GUA P         0.0 #

##################################################


##################################################
#ambiguous TYR - ATP correlations#################

410 ATP PG	352 TYR CD1	8.0 #
410 ATP PG	352 TYR CD2	0.0 #
410 ATP PA      352 TYR CD1	0.0 #
410 ATP PA	352 TYR CD2	0.0 #

400 ATP PA	319 TYR CD1	8.0 #
400 ATP PA	319 TYR CD2	0.0 #

400 ATP PG	302 TYR CD2	8.0 #
400 ATP PG	319 TYR CD1	0.0 #

##################################################


##################################################
# TRP - DNA correlations##########################

  6 CYT P	314 TRP CE2     7.0 #
  3 GUA P	347 TRP CE2     7.0 #

##################################################


Please acknowledge these references in publications where the data from this site have been utilized.

Contact the webmaster for help, if required. Thursday, May 16, 2024 5:19:52 PM GMT (wattos1)