NMR Restraints Grid

Result table
 (Save to zip file containing files for each block)

image mrblock_id pdb_id bmrb_id cing stage program type subtype subsubtype item_count
621834 5j7j 30062 cing 2-parsed STAR distance NOE simple 29


data_5j7j_MR_file_constraints


save_Conversion_project
    _Study_list.Sf_category  study_list 
    _Study_list.Entry_ID     parsed_5j7j 
    _Study_list.ID           1 

    loop_
        _Study.ID 
        _Study.Name 
        _Study.Type 
        _Study.Details 
        _Study.Entry_ID 
        _Study.Study_list_ID 

        1   "Conversion project"    NMR   .   parsed_5j7j   1   
    stop_

save_


save_entry_information
    _Entry.Sf_category                  entry_information 
    _Entry.ID                           parsed_5j7j 
    _Entry.Title                       "Original constraint list(s)" 
    _Entry.Version_type                 original 
    _Entry.Submission_date              . 
    _Entry.Accession_date               . 
    _Entry.Last_release_date            . 
    _Entry.Original_release_date        . 
    _Entry.Origination                  . 
    _Entry.NMR_STAR_version             3.1 
    _Entry.Original_NMR_STAR_version    . 
    _Entry.Experimental_method          NMR 
    _Entry.Experimental_method_subtype  . 

    loop_
        _Related_entries.Database_name 
        _Related_entries.Database_accession_code 
        _Related_entries.Relationship 
        _Related_entries.Entry_ID 

        PDB   5j7j   "Master copy"    parsed_5j7j   
    stop_

save_


save_global_Org_file_characteristics
    _Constraint_stat_list.Sf_category  constraint_statistics 
    _Constraint_stat_list.Entry_ID     parsed_5j7j 
    _Constraint_stat_list.ID           1 

    loop_
        _Constraint_file.ID 
        _Constraint_file.Constraint_filename 
        _Constraint_file.Software_ID 
        _Constraint_file.Software_label 
        _Constraint_file.Software_name 
        _Constraint_file.Block_ID 
        _Constraint_file.Constraint_type 
        _Constraint_file.Constraint_subtype 
        _Constraint_file.Constraint_subsubtype 
        _Constraint_file.Constraint_number 
        _Constraint_file.Entry_ID 
        _Constraint_file.Constraint_stat_list_ID 

        1   5j7j.mr   .   .   "MR format"    1    comment                  "Not applicable"    "Not applicable"     0   parsed_5j7j   1   
        1   5j7j.mr   .   .    XPLOR/CNS     2    distance                  NOE                 simple             29   parsed_5j7j   1   
        1   5j7j.mr   .   .    DYANA/DIANA   3   "dipolar coupling"        "Not applicable"    "Not applicable"     0   parsed_5j7j   1   
        1   5j7j.mr   .   .   "MR format"    4   "nomenclature mapping"    "Not applicable"    "Not applicable"     0   parsed_5j7j   1   
    stop_

save_


save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
    _Distance_constraint_list.Sf_category         distance_constraints 
    _Distance_constraint_list.Entry_ID            parsed_5j7j 
    _Distance_constraint_list.ID                  1 
    _Distance_constraint_list.Constraint_type     NOE 
    _Distance_constraint_list.Constraint_file_ID  1 
    _Distance_constraint_list.Block_ID            2 
    _Distance_constraint_list.Details            "Generated by Wattos" 

    loop_
        _Dist_constraint_tree.Constraint_ID 
        _Dist_constraint_tree.Node_ID 
        _Dist_constraint_tree.Down_node_ID 
        _Dist_constraint_tree.Right_node_ID 
        _Dist_constraint_tree.Logic_operation 
        _Dist_constraint_tree.Entry_ID 
        _Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID 

         1   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
         2   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
         3   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
         4   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
         5   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
         6   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
         7   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
         8   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
         9   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        10   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        11   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        12   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        13   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        14   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        15   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        16   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        17   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        18   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        19   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        20   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        21   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        22   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        23   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        24   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        25   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        26   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        27   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        28   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
        29   1   .   .   .   parsed_5j7j   1   
    stop_


    loop_
        _Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID 
        _Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID 
        _Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID 
        _Dist_constraint.Assembly_atom_ID 
        _Dist_constraint.Entity_assembly_ID 
        _Dist_constraint.Entity_ID 
        _Dist_constraint.Comp_index_ID 
        _Dist_constraint.Seq_ID 
        _Dist_constraint.Comp_ID 
        _Dist_constraint.Atom_ID 
        _Dist_constraint.Resonance_ID 
        _Dist_constraint.Auth_asym_ID 
        _Dist_constraint.Auth_seq_ID 
        _Dist_constraint.Auth_comp_ID 
        _Dist_constraint.Auth_atom_ID 
        _Dist_constraint.Entry_ID 
        _Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID 

         1   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     1   .   HA     parsed_5j7j   1   
         1   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     4   .   HB     parsed_5j7j   1   
         2   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     2   .   HA     parsed_5j7j   1   
         2   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     5   .   HB     parsed_5j7j   1   
         3   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     3   .   HA     parsed_5j7j   1   
         3   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     6   .   HB     parsed_5j7j   1   
         4   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     4   .   HA     parsed_5j7j   1   
         4   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     7   .   HB     parsed_5j7j   1   
         5   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     5   .   HA     parsed_5j7j   1   
         5   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     8   .   HB     parsed_5j7j   1   
         6   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     6   .   HA     parsed_5j7j   1   
         6   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     9   .   HB     parsed_5j7j   1   
         7   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     7   .   HA     parsed_5j7j   1   
         7   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    10   .   HB#    parsed_5j7j   1   
         8   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     8   .   HA     parsed_5j7j   1   
         8   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    11   .   HB#    parsed_5j7j   1   
         9   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B     9   .   HA     parsed_5j7j   1   
         9   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   HB#    parsed_5j7j   1   
        10   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   B    10   .   HA     parsed_5j7j   1   
        10   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    13   .   HB#    parsed_5j7j   1   
        11   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   115   .   HZ#    parsed_5j7j   1   
        11   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    19   .   O2P    parsed_5j7j   1   
        12   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   126   .   NH#    parsed_5j7j   1   
        12   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    17   .   OE#    parsed_5j7j   1   
        13   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   147   .   OXT    parsed_5j7j   1   
        13   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    15   .   HE2#   parsed_5j7j   1   
        14   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   147   .   O      parsed_5j7j   1   
        14   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    15   .   HE2#   parsed_5j7j   1   
        15   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   124   .   CG     parsed_5j7j   1   
        15   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   HH     parsed_5j7j   1   
        16   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   124   .   CE     parsed_5j7j   1   
        16   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   CE1    parsed_5j7j   1   
        17   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   124   .   CE     parsed_5j7j   1   
        17   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   CD1    parsed_5j7j   1   
        18   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   136   .   HG#    parsed_5j7j   1   
        18   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   OH     parsed_5j7j   1   
        19   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   141   .   CE2    parsed_5j7j   1   
        19   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   CD2    parsed_5j7j   1   
        20   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   141   .   CD2    parsed_5j7j   1   
        20   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   CD2    parsed_5j7j   1   
        21   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   141   .   CD2    parsed_5j7j   1   
        21   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   CE2    parsed_5j7j   1   
        22   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   141   .   CE2    parsed_5j7j   1   
        22   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   CE2    parsed_5j7j   1   
        23   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   144   .   CE     parsed_5j7j   1   
        23   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   CE2    parsed_5j7j   1   
        24   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A   144   .   CE     parsed_5j7j   1   
        24   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B    12   .   CD2    parsed_5j7j   1   
        25   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A    55   .   HG2#   parsed_5j7j   1   
        25   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     3   .   HG     parsed_5j7j   1   
        26   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A    63   .   HD1#   parsed_5j7j   1   
        26   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     3   .   HG     parsed_5j7j   1   
        27   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A    63   .   HG2#   parsed_5j7j   1   
        27   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     3   .   HG     parsed_5j7j   1   
        28   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A    63   .   HG1#   parsed_5j7j   1   
        28   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     3   .   HG     parsed_5j7j   1   
        29   1   1   .   .   .   .   .   .   .   .   A    63   .   HB     parsed_5j7j   1   
        29   1   2   .   .   .   .   .   .   .   .   B     3   .   HG     parsed_5j7j   1   
    stop_


    loop_
        _Dist_constraint_value.Constraint_ID 
        _Dist_constraint_value.Tree_node_ID 
        _Dist_constraint_value.Source_experiment_ID 
        _Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID 
        _Dist_constraint_value.Intensity_val 
        _Dist_constraint_value.Intensity_lower_val_err 
        _Dist_constraint_value.Intensity_upper_val_err 
        _Dist_constraint_value.Distance_val 
        _Dist_constraint_value.Distance_lower_bound_val 
        _Dist_constraint_value.Distance_upper_bound_val 
        _Dist_constraint_value.Entry_ID 
        _Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID 

         1   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
         2   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
         3   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
         4   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
         5   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
         6   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
         7   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
         8   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
         9   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
        10   1   .   .   .   .   .   0.0   0.0   2.5   parsed_5j7j   1   
        11   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        12   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        13   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        14   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        15   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        16   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        17   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        18   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        19   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        20   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        21   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        22   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        23   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        24   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        25   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        26   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        27   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        28   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
        29   1   .   .   .   .   .   2.0   0.0   2.0   parsed_5j7j   1   
    stop_


    loop_
        _Dist_constraint_comment_org.ID 
        _Dist_constraint_comment_org.Comment_text 
        _Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line 
        _Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column 
        _Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line 
        _Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column 
        _Dist_constraint_comment_org.Entry_ID 
        _Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID 

        1   
;
!! segid A: Calmodulin
!! segid B: PSD95 (1-19)
;
    2   1    3   26   parsed_5j7j   1   
        2    !!                          17   1   17    8   parsed_5j7j   1   
        3    !!                          20   1   20    5   parsed_5j7j   1   
        4   "!! M124(CaM) - Y12(PSD)"    28   1   28   25   parsed_5j7j   1   
        5   "!! V136(CaM) - Y12(PSD)"    35   1   35   25   parsed_5j7j   1   
        6   "!! M141(CaM) - Y12(PSD)"    38   1   38   25   parsed_5j7j   1   
        7   "!! M144(CaM) - Y12(PSD)"    44   1   44   25   parsed_5j7j   1   
        8   "!! V55(CaM) - C3(PSD)"      48   1   48   24   parsed_5j7j   1   
        9   "!! I63(CaM) - C3(PSD)"      51   1   51   24   parsed_5j7j   1   
    stop_


    loop_
        _Dist_constraint_parse_err.ID 
        _Dist_constraint_parse_err.Content 
        _Dist_constraint_parse_err.Begin_line 
        _Dist_constraint_parse_err.Begin_column 
        _Dist_constraint_parse_err.End_line 
        _Dist_constraint_parse_err.End_column 
        _Dist_constraint_parse_err.Entry_ID 
        _Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID 

        1   "# Restraints file 1: IntermolecularNOE_Data.txt"    1   1   1   47   parsed_5j7j   1   
    stop_

save_





Please acknowledge these references in publications where the data from this site have been utilized.

Contact the webmaster for help, if required. Monday, April 29, 2024 12:16:52 AM GMT (wattos1)