NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype | item_count |
|
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570349 |
2lun   |
18532 | cing | 2-parsed | STAR | distance | NOE | simple | 298 |
data_2lun_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2lun
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2lun 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2lun
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2lun "Master copy" parsed_2lun
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2lun
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2lun.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lun 1
1 2lun.mr . . XPLOR/CNS 2 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 224 parsed_2lun 1
1 2lun.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 63 parsed_2lun 1
1 2lun.mr . . XPLOR/CNS 4 distance NOE simple 298 parsed_2lun 1
1 2lun.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lun 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_4
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2lun
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 4
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2lun 1
2 1 . . . parsed_2lun 1
3 1 . . . parsed_2lun 1
4 1 . . . parsed_2lun 1
5 1 . . . parsed_2lun 1
6 1 . . . parsed_2lun 1
7 1 . . . parsed_2lun 1
8 1 . . . parsed_2lun 1
9 1 . . . parsed_2lun 1
10 1 . . . parsed_2lun 1
11 1 . . . parsed_2lun 1
12 1 . . . parsed_2lun 1
13 1 . . . parsed_2lun 1
14 1 . . . parsed_2lun 1
15 1 . . . parsed_2lun 1
16 1 . . . parsed_2lun 1
17 1 . . . parsed_2lun 1
18 1 . . . parsed_2lun 1
19 1 . . . parsed_2lun 1
20 1 . . . parsed_2lun 1
21 1 . . . parsed_2lun 1
22 1 . . . parsed_2lun 1
23 1 . . . parsed_2lun 1
24 1 . . . parsed_2lun 1
25 1 . . . parsed_2lun 1
26 1 . . . parsed_2lun 1
27 1 . . . parsed_2lun 1
28 1 . . . parsed_2lun 1
29 1 . . . parsed_2lun 1
30 1 . . . parsed_2lun 1
31 1 . . . parsed_2lun 1
32 1 . . . parsed_2lun 1
33 1 . . . parsed_2lun 1
34 1 . . . parsed_2lun 1
35 1 . . . parsed_2lun 1
36 1 . . . parsed_2lun 1
37 1 . . . parsed_2lun 1
38 1 . . . parsed_2lun 1
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40 1 . . . parsed_2lun 1
41 1 . . . parsed_2lun 1
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46 1 . . . parsed_2lun 1
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48 1 . . . parsed_2lun 1
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51 1 . . . parsed_2lun 1
52 1 . . . parsed_2lun 1
53 1 . . . parsed_2lun 1
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55 1 . . . parsed_2lun 1
56 1 . . . parsed_2lun 1
57 1 . . . parsed_2lun 1
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63 1 . . . parsed_2lun 1
64 1 . . . parsed_2lun 1
65 1 . . . parsed_2lun 1
66 1 . . . parsed_2lun 1
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69 1 . . . parsed_2lun 1
70 1 . . . parsed_2lun 1
71 1 . . . parsed_2lun 1
72 1 . . . parsed_2lun 1
73 1 . . . parsed_2lun 1
74 1 . . . parsed_2lun 1
75 1 . . . parsed_2lun 1
76 1 . . . parsed_2lun 1
77 1 . . . parsed_2lun 1
78 1 . . . parsed_2lun 1
79 1 . . . parsed_2lun 1
80 1 . . . parsed_2lun 1
81 1 . . . parsed_2lun 1
82 1 . . . parsed_2lun 1
83 1 . . . parsed_2lun 1
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85 1 . . . parsed_2lun 1
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88 1 . . . parsed_2lun 1
89 1 . . . parsed_2lun 1
90 1 . . . parsed_2lun 1
91 1 . . . parsed_2lun 1
92 1 . . . parsed_2lun 1
93 1 . . . parsed_2lun 1
94 1 . . . parsed_2lun 1
95 1 . . . parsed_2lun 1
96 1 . . . parsed_2lun 1
97 1 . . . parsed_2lun 1
98 1 . . . parsed_2lun 1
99 1 . . . parsed_2lun 1
100 1 . . . parsed_2lun 1
101 1 . . . parsed_2lun 1
102 1 . . . parsed_2lun 1
103 1 . . . parsed_2lun 1
104 1 . . . parsed_2lun 1
105 1 . . . parsed_2lun 1
106 1 . . . parsed_2lun 1
107 1 . . . parsed_2lun 1
108 1 . . . parsed_2lun 1
109 1 . . . parsed_2lun 1
110 1 . . . parsed_2lun 1
111 1 . . . parsed_2lun 1
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116 1 . . . parsed_2lun 1
117 1 . . . parsed_2lun 1
118 1 . . . parsed_2lun 1
119 1 . . . parsed_2lun 1
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121 1 . . . parsed_2lun 1
122 1 . . . parsed_2lun 1
123 1 . . . parsed_2lun 1
124 1 . . . parsed_2lun 1
125 1 . . . parsed_2lun 1
126 1 . . . parsed_2lun 1
127 1 . . . parsed_2lun 1
128 1 . . . parsed_2lun 1
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131 1 . . . parsed_2lun 1
132 1 . . . parsed_2lun 1
133 1 . . . parsed_2lun 1
134 1 . . . parsed_2lun 1
135 1 . . . parsed_2lun 1
136 1 . . . parsed_2lun 1
137 1 . . . parsed_2lun 1
138 1 . . . parsed_2lun 1
139 1 . . . parsed_2lun 1
140 1 . . . parsed_2lun 1
141 1 . . . parsed_2lun 1
142 1 . . . parsed_2lun 1
143 1 . . . parsed_2lun 1
144 1 . . . parsed_2lun 1
145 1 . . . parsed_2lun 1
146 1 . . . parsed_2lun 1
147 1 . . . parsed_2lun 1
148 1 . . . parsed_2lun 1
149 1 . . . parsed_2lun 1
150 1 . . . parsed_2lun 1
151 1 . . . parsed_2lun 1
152 1 . . . parsed_2lun 1
153 1 . . . parsed_2lun 1
154 1 . . . parsed_2lun 1
155 1 . . . parsed_2lun 1
156 1 . . . parsed_2lun 1
157 1 . . . parsed_2lun 1
158 1 . . . parsed_2lun 1
159 1 . . . parsed_2lun 1
160 1 . . . parsed_2lun 1
161 1 . . . parsed_2lun 1
162 1 . . . parsed_2lun 1
163 1 . . . parsed_2lun 1
164 1 . . . parsed_2lun 1
165 1 . . . parsed_2lun 1
166 1 . . . parsed_2lun 1
167 1 . . . parsed_2lun 1
168 1 . . . parsed_2lun 1
169 1 . . . parsed_2lun 1
170 1 . . . parsed_2lun 1
171 1 . . . parsed_2lun 1
172 1 . . . parsed_2lun 1
173 1 . . . parsed_2lun 1
174 1 . . . parsed_2lun 1
175 1 . . . parsed_2lun 1
176 1 . . . parsed_2lun 1
177 1 . . . parsed_2lun 1
178 1 . . . parsed_2lun 1
179 1 . . . parsed_2lun 1
180 1 . . . parsed_2lun 1
181 1 . . . parsed_2lun 1
182 1 . . . parsed_2lun 1
183 1 . . . parsed_2lun 1
184 1 . . . parsed_2lun 1
185 1 . . . parsed_2lun 1
186 1 . . . parsed_2lun 1
187 1 . . . parsed_2lun 1
188 1 . . . parsed_2lun 1
189 1 . . . parsed_2lun 1
190 1 . . . parsed_2lun 1
191 1 . . . parsed_2lun 1
192 1 . . . parsed_2lun 1
193 1 . . . parsed_2lun 1
194 1 . . . parsed_2lun 1
195 1 . . . parsed_2lun 1
196 1 . . . parsed_2lun 1
197 1 . . . parsed_2lun 1
198 1 . . . parsed_2lun 1
199 1 . . . parsed_2lun 1
200 1 . . . parsed_2lun 1
201 1 . . . parsed_2lun 1
202 1 . . . parsed_2lun 1
203 1 . . . parsed_2lun 1
204 1 . . . parsed_2lun 1
205 1 . . . parsed_2lun 1
206 1 . . . parsed_2lun 1
207 1 . . . parsed_2lun 1
208 1 . . . parsed_2lun 1
209 1 . . . parsed_2lun 1
210 1 . . . parsed_2lun 1
211 1 . . . parsed_2lun 1
212 1 . . . parsed_2lun 1
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214 1 . . . parsed_2lun 1
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261 1 . . . parsed_2lun 1
262 1 . . . parsed_2lun 1
263 1 . . . parsed_2lun 1
264 1 . . . parsed_2lun 1
265 1 . . . parsed_2lun 1
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272 1 . . . parsed_2lun 1
273 1 . . . parsed_2lun 1
274 1 . . . parsed_2lun 1
275 1 . . . parsed_2lun 1
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292 1 . . . parsed_2lun 1
293 1 . . . parsed_2lun 1
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297 1 . . . parsed_2lun 1
298 1 . . . parsed_2lun 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 1 . H8 parsed_2lun 1
1 1 2 . . . . . . . . . 1 . H1' parsed_2lun 1
2 1 1 . . . . . . . . . 1 . H1' parsed_2lun 1
2 1 2 . . . . . . . . . 2 . H8 parsed_2lun 1
3 1 1 . . . . . . . . . 2 . H8 parsed_2lun 1
3 1 2 . . . . . . . . . 2 . H1' parsed_2lun 1
4 1 1 . . . . . . . . . 2 . H1' parsed_2lun 1
4 1 2 . . . . . . . . . 3 . H8 parsed_2lun 1
5 1 1 . . . . . . . . . 3 . H8 parsed_2lun 1
5 1 2 . . . . . . . . . 3 . H1' parsed_2lun 1
6 1 1 . . . . . . . . . 3 . H1' parsed_2lun 1
6 1 2 . . . . . . . . . 4 . H6 parsed_2lun 1
7 1 1 . . . . . . . . . 4 . H6 parsed_2lun 1
7 1 2 . . . . . . . . . 4 . H1' parsed_2lun 1
8 1 1 . . . . . . . . . 4 . H1' parsed_2lun 1
8 1 2 . . . . . . . . . 5 . H8 parsed_2lun 1
9 1 1 . . . . . . . . . 5 . H8 parsed_2lun 1
9 1 2 . . . . . . . . . 5 . H1' parsed_2lun 1
10 1 1 . . . . . . . . . 5 . H1' parsed_2lun 1
10 1 2 . . . . . . . . . 6 . H8 parsed_2lun 1
11 1 1 . . . . . . . . . 6 . H8 parsed_2lun 1
11 1 2 . . . . . . . . . 6 . H1' parsed_2lun 1
12 1 1 . . . . . . . . . 6 . H1' parsed_2lun 1
12 1 2 . . . . . . . . . 7 . H6 parsed_2lun 1
13 1 1 . . . . . . . . . 7 . H6 parsed_2lun 1
13 1 2 . . . . . . . . . 7 . H1' parsed_2lun 1
14 1 1 . . . . . . . . . 7 . H1' parsed_2lun 1
14 1 2 . . . . . . . . . 8 . H8 parsed_2lun 1
15 1 1 . . . . . . . . . 8 . H8 parsed_2lun 1
15 1 2 . . . . . . . . . 8 . H1' parsed_2lun 1
16 1 1 . . . . . . . . . 8 . H1' parsed_2lun 1
16 1 2 . . . . . . . . . 9 . H8 parsed_2lun 1
17 1 1 . . . . . . . . . 9 . H8 parsed_2lun 1
17 1 2 . . . . . . . . . 9 . H1' parsed_2lun 1
18 1 1 . . . . . . . . . 9 . H1' parsed_2lun 1
18 1 2 . . . . . . . . . 10 . H6 parsed_2lun 1
19 1 1 . . . . . . . . . 10 . H6 parsed_2lun 1
19 1 2 . . . . . . . . . 10 . H1' parsed_2lun 1
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20 1 2 . . . . . . . . . 11 . H8 parsed_2lun 1
21 1 1 . . . . . . . . . 11 . H8 parsed_2lun 1
21 1 2 . . . . . . . . . 11 . H1' parsed_2lun 1
22 1 1 . . . . . . . . . 11 . H1' parsed_2lun 1
22 1 2 . . . . . . . . . 12 . H6 parsed_2lun 1
23 1 1 . . . . . . . . . 12 . H6 parsed_2lun 1
23 1 2 . . . . . . . . . 12 . H1' parsed_2lun 1
24 1 1 . . . . . . . . . 12 . H1' parsed_2lun 1
24 1 2 . . . . . . . . . 13 . H6 parsed_2lun 1
25 1 1 . . . . . . . . . 13 . H6 parsed_2lun 1
25 1 2 . . . . . . . . . 13 . H1' parsed_2lun 1
26 1 1 . . . . . . . . . 13 . H1' parsed_2lun 1
26 1 2 . . . . . . . . . 14 . H6 parsed_2lun 1
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28 1 1 . . . . . . . . . 13 . H1' parsed_2lun 1
28 1 2 . . . . . . . . . 16 . H8 parsed_2lun 1
29 1 1 . . . . . . . . . 14 . H6 parsed_2lun 1
29 1 2 . . . . . . . . . 14 . H1' parsed_2lun 1
30 1 1 . . . . . . . . . 14 . H1' parsed_2lun 1
30 1 2 . . . . . . . . . 15 . H6 parsed_2lun 1
31 1 1 . . . . . . . . . 14 . H1' parsed_2lun 1
31 1 2 . . . . . . . . . 16 . H8 parsed_2lun 1
32 1 1 . . . . . . . . . 15 . H6 parsed_2lun 1
32 1 2 . . . . . . . . . 15 . H1' parsed_2lun 1
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stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
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_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1
;
Modified by jwang
a summarize noed table combined by hhnoeDH.tbl and hbnoe.tbl
Same as Selex28_A5_noe_v5.tbl
H2O NOESY AMINOS (List)
--------------------------------------------------------------------------------
distance H20 Noesy 2D DATA
semiquantitative interproton distances s=4 m=5 w=6 vw=7
in xplor in xplor-nih also could be
s=4 2.2 0 2.9 1.1 1.1
m=5 3.2 0 3.4 1.6 1.6
w=6 4.2 0 3.9 2.1 2.1
vw=7 5.2 0 4.4 2.6 2.6
--------------------------------------------------------------------------------
Base to 1' region
;
1 1 22 2 parsed_2lun 1
2 M 23 67 23 75 parsed_2lun 1
3 M 24 67 24 69 parsed_2lun 1
4 W 25 67 25 70 parsed_2lun 1
5 W 26 67 26 70 parsed_2lun 1
6 W 27 67 27 69 parsed_2lun 1
7 W 28 67 28 70 parsed_2lun 1
8 W 29 67 29 70 parsed_2lun 1
9 M 30 67 30 69 parsed_2lun 1
10 W 31 67 31 70 parsed_2lun 1
11 W 32 67 32 70 parsed_2lun 1
12 W 33 67 33 70 parsed_2lun 1
13 VW 34 67 34 71 parsed_2lun 1
14 W 35 67 35 70 parsed_2lun 1
15 VW 36 67 36 70 parsed_2lun 1
16 S 37 67 37 70 parsed_2lun 1
17 M 38 67 38 70 parsed_2lun 1
18 W 39 67 39 70 parsed_2lun 1
19 W 40 68 40 71 parsed_2lun 1
20 VW 41 69 41 72 parsed_2lun 1
21 W 42 69 42 72 parsed_2lun 1
22 W 43 69 43 72 parsed_2lun 1
23 M 44 69 44 72 parsed_2lun 1
24 M 45 69 45 71 parsed_2lun 1
25 W 46 69 46 71 parsed_2lun 1
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27 W 48 69 48 71 parsed_2lun 1
28 W 49 69 49 71 parsed_2lun 1
29 W 50 69 50 71 parsed_2lun 1
30 S 51 69 51 71 parsed_2lun 1
31 M 52 69 52 71 parsed_2lun 1
32 M 53 69 53 71 parsed_2lun 1
33 M 54 69 54 72 parsed_2lun 1
34 W 55 69 55 71 parsed_2lun 1
35 S 56 69 56 71 parsed_2lun 1
36 W 57 69 57 71 parsed_2lun 1
37 M 58 69 58 72 parsed_2lun 1
38 M 59 69 59 72 parsed_2lun 1
39 M 60 69 60 72 parsed_2lun 1
40 M 61 69 61 72 parsed_2lun 1
41 M 62 69 62 72 parsed_2lun 1
42 W 63 69 63 71 parsed_2lun 1
43 W 64 69 64 72 parsed_2lun 1
44 W 65 69 65 72 parsed_2lun 1
45 W 66 69 66 72 parsed_2lun 1
46 W 67 69 67 72 parsed_2lun 1
47 W 68 69 68 72 parsed_2lun 1
48 W 69 69 69 72 parsed_2lun 1
49 W 70 69 70 72 parsed_2lun 1
50 W 71 69 71 71 parsed_2lun 1
51 M 72 69 72 72 parsed_2lun 1
52 M 73 69 73 72 parsed_2lun 1
53 VW 74 69 74 72 parsed_2lun 1
54 W 75 69 75 71 parsed_2lun 1
55 VW 76 69 76 72 parsed_2lun 1
56 M 77 69 77 72 parsed_2lun 1
57 M 78 69 78 71 parsed_2lun 1
58
;
W
H5-H6 intra-residue for U & C
;
79 69 86 60 parsed_2lun 1
59 VS 87 66 87 70 parsed_2lun 1
60 VS 88 66 88 70 parsed_2lun 1
61 VS 89 68 89 72 parsed_2lun 1
62 VS 90 68 90 72 parsed_2lun 1
63 VS 91 68 91 72 parsed_2lun 1
64 VS 92 68 92 72 parsed_2lun 1
65 VS 93 68 93 72 parsed_2lun 1
66 VS 94 68 94 72 parsed_2lun 1
67 VS 95 68 95 72 parsed_2lun 1
68 VS 96 68 96 72 parsed_2lun 1
69 VS 97 68 97 73 parsed_2lun 1
70 VS 98 68 98 73 parsed_2lun 1
71 VS 99 68 99 72 parsed_2lun 1
72
;
VS
C & U H5-H6/8 (inter)
;
100 68 105 49 parsed_2lun 1
73 VW 106 67 106 72 parsed_2lun 1
74 VW 107 67 107 71 parsed_2lun 1
75 W 108 68 108 71 parsed_2lun 1
76 VW 109 69 109 73 parsed_2lun 1
77 VW 110 69 110 73 parsed_2lun 1
78 W 111 69 111 73 parsed_2lun 1
79
;
VW
Adenosine H2
;
112 69 116 2 parsed_2lun 1
80 W 117 68 117 71 parsed_2lun 1
81 VW 118 68 118 72 parsed_2lun 1
82 W 119 69 119 72 parsed_2lun 1
83 W 120 69 120 72 parsed_2lun 1
84 VW 121 68 121 72 parsed_2lun 1
85 W 122 70 122 73 parsed_2lun 1
86 VW 123 68 123 72 parsed_2lun 1
87 VW 124 69 124 72 parsed_2lun 1
88 M 125 70 125 73 parsed_2lun 1
89 W 126 68 126 71 parsed_2lun 1
90
;
M
H6/8-H6/8 (sequential)
;
127 69 131 66 parsed_2lun 1
91 VW 132 66 132 70 parsed_2lun 1
92 W 133 67 133 70 parsed_2lun 1
93 W 134 68 134 72 parsed_2lun 1
94 W 135 68 135 72 parsed_2lun 1
95 VW 136 68 136 72 parsed_2lun 1
96 VW 137 68 137 72 parsed_2lun 1
97 W 138 68 138 72 parsed_2lun 1
98 VW 139 68 139 72 parsed_2lun 1
99 VW 140 68 140 72 parsed_2lun 1
100 W 141 68 141 72 parsed_2lun 1
101 W 142 68 142 71 parsed_2lun 1
102 VW 143 68 143 72 parsed_2lun 1
103
;
W
H1'-H1'
;
144 68 148 2 parsed_2lun 1
104
;
VW
H1'-H5
;
149 70 153 2 parsed_2lun 1
105 W 154 67 154 71 parsed_2lun 1
106 VW 155 69 155 73 parsed_2lun 1
107
;
VW
base H6/H8 to ribose (inter+intra)
G1-H8
;
156 69 164 2 parsed_2lun 1
108 S 165 68 165 70 parsed_2lun 1
109 S 166 67 166 69 parsed_2lun 1
110 M 167 67 167 69 parsed_2lun 1
111 S 168 67 168 69 parsed_2lun 1
112
;
M
G2-H8
;
169 68 172 2 parsed_2lun 1
113 S 173 68 173 70 parsed_2lun 1
114 S 174 67 174 69 parsed_2lun 1
115 W 175 67 176 2 parsed_2lun 1
116 S 177 68 177 70 parsed_2lun 1
117 S 178 67 178 69 parsed_2lun 1
118 M 179 67 179 69 parsed_2lun 1
119 S 180 67 180 69 parsed_2lun 1
120
;
M
G3-H8
;
181 68 185 2 parsed_2lun 1
121 S 186 68 186 70 parsed_2lun 1
122 S 187 67 187 69 parsed_2lun 1
123 W 188 67 189 2 parsed_2lun 1
124 S 190 68 190 70 parsed_2lun 1
125 W 191 67 191 69 parsed_2lun 1
126 M 192 67 192 69 parsed_2lun 1
127 S 193 67 193 69 parsed_2lun 1
128
;
M
C4-H6
;
194 68 198 2 parsed_2lun 1
129 S 199 68 199 70 parsed_2lun 1
130 S 200 67 200 69 parsed_2lun 1
131 W 201 67 202 2 parsed_2lun 1
132 W 203 68 203 71 parsed_2lun 1
133 W 204 67 204 70 parsed_2lun 1
134 M 205 67 205 70 parsed_2lun 1
135 S 206 67 206 69 parsed_2lun 1
136
;
M
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~end of stem 4 bps~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
A5-H8
;
207 68 212 2 parsed_2lun 1
137
;
S
assign ( resid 5 and name H8 ) ( resid 4 and name H3' ) 6.0 4.2 0 !W
;
213 68 214 71 parsed_2lun 1
138 M 215 67 216 2 parsed_2lun 1
139 S 217 68 217 70 parsed_2lun 1
140 M 218 67 218 70 parsed_2lun 1
141 M 219 67 219 69 parsed_2lun 1
142 S 220 67 220 69 parsed_2lun 1
143
;
M
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~<(oLo)>~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
G6-H8 |
;
221 68 226 2 parsed_2lun 1
144 M 227 69 227 72 parsed_2lun 1
145 VW 228 68 229 2 parsed_2lun 1
146 M 230 69 230 72 parsed_2lun 1
147 W 231 67 231 70 parsed_2lun 1
148 W 232 67 232 70 parsed_2lun 1
149
;
W
U7-H6
;
233 68 237 2 parsed_2lun 1
150 M 238 70 238 72 parsed_2lun 1
151 W 239 70 241 2 parsed_2lun 1
152 W 242 69 242 72 parsed_2lun 1
153
;
W
G8-H8
;
243 68 248 2 parsed_2lun 1
154 W 249 69 251 2 parsed_2lun 1
155 W 252 68 252 71 parsed_2lun 1
156 W 253 67 253 70 parsed_2lun 1
157
;
VW
A9-H8 Weak A9-U20 bp
;
254 68 257 2 parsed_2lun 1
158 VW 258 69 258 73 parsed_2lun 1
159 W 259 68 260 2 parsed_2lun 1
160 W 261 68 261 71 parsed_2lun 1
161
;
M
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~^
U10-H6 base paired with A19
;
262 68 270 2 parsed_2lun 1
162 S 271 70 271 72 parsed_2lun 1
163 S 272 69 272 71 parsed_2lun 1
164 M 273 69 273 71 parsed_2lun 1
165 M 274 69 274 71 parsed_2lun 1
166
;
M
G11-H8
;
275 70 279 2 parsed_2lun 1
167 S 280 71 280 73 parsed_2lun 1
168 M 281 69 281 71 parsed_2lun 1
169 VW 282 69 282 72 parsed_2lun 1
170 W 283 70 284 2 parsed_2lun 1
171 M 285 70 285 72 parsed_2lun 1
172 S 286 69 286 71 parsed_2lun 1
173 M 287 70 287 72 parsed_2lun 1
174
;
S
C12-H6
;
288 71 293 2 parsed_2lun 1
175 W 294 69 294 71 parsed_2lun 1
176 S 295 70 295 72 parsed_2lun 1
177 M 296 69 296 71 parsed_2lun 1
178 M 297 69 297 71 parsed_2lun 1
179 W 298 70 299 2 parsed_2lun 1
180 W 300 70 300 72 parsed_2lun 1
181 W 301 69 301 72 parsed_2lun 1
182 M 302 70 302 72 parsed_2lun 1
183 M 303 70 303 72 parsed_2lun 1
184
;
M
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~UUCG tetra-loop~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
U13-H6
;
304 71 308 2 parsed_2lun 1
185 M 309 70 309 72 parsed_2lun 1
186 M 310 69 310 72 parsed_2lun 1
187 W 311 69 312 2 parsed_2lun 1
188 W 313 70 313 72 parsed_2lun 1
189 S 314 69 314 71 parsed_2lun 1
190 S 315 69 315 71 parsed_2lun 1
191
;
S
U14-H6
;
316 70 320 2 parsed_2lun 1
192 W 321 70 321 72 parsed_2lun 1
193 VW 322 69 322 72 parsed_2lun 1
194 W 323 69 324 2 parsed_2lun 1
195 S 325 70 325 72 parsed_2lun 1
196 W 326 69 326 72 parsed_2lun 1
197 M 327 69 327 72 parsed_2lun 1
198 W 328 69 328 71 parsed_2lun 1
199
;
VW
C15-H6
;
329 70 333 2 parsed_2lun 1
200 S 334 71 334 73 parsed_2lun 1
201 S 335 70 335 72 parsed_2lun 1
202 M 336 71 336 73 parsed_2lun 1
203 M 337 70 337 72 parsed_2lun 1
204 M 338 71 338 73 parsed_2lun 1
205 S 339 69 339 71 parsed_2lun 1
206 M 340 69 340 71 parsed_2lun 1
207 VS 341 70 341 73 parsed_2lun 1
208 S 342 69 342 71 parsed_2lun 1
209
;
S
G16-H8
;
343 70 346 2 parsed_2lun 1
210 W 347 69 347 71 parsed_2lun 1
211 M 348 69 348 71 parsed_2lun 1
212 S 349 69 349 71 parsed_2lun 1
213 M 350 70 350 72 parsed_2lun 1
214 M 352 69 352 71 parsed_2lun 1
215
;
S
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~end of tetra-loop~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
G17-H8
;
353 70 359 2 parsed_2lun 1
216 S 360 70 360 72 parsed_2lun 1
217 S 361 71 362 2 parsed_2lun 1
218 S 363 70 363 72 parsed_2lun 1
219 S 364 69 364 71 parsed_2lun 1
220 M 365 69 365 71 parsed_2lun 1
221 M 366 69 366 72 parsed_2lun 1
222
;
S
C18-H6
;
367 70 370 2 parsed_2lun 1
223 S 371 70 371 72 parsed_2lun 1
224 S 372 69 372 71 parsed_2lun 1
225 M 373 69 374 2 parsed_2lun 1
226 M 375 70 375 72 parsed_2lun 1
227 S 376 69 376 71 parsed_2lun 1
228 VW 377 69 377 72 parsed_2lun 1
229 S 378 69 378 71 parsed_2lun 1
230
;
M
A19-H8 base paired with U10
;
379 70 383 2 parsed_2lun 1
231 S 384 71 384 73 parsed_2lun 1
232 M 385 69 385 71 parsed_2lun 1
233 VW 386 69 386 72 parsed_2lun 1
234 W 387 70 388 2 parsed_2lun 1
235 M 389 70 389 72 parsed_2lun 1
236 S 390 69 390 72 parsed_2lun 1
237 M 391 70 391 72 parsed_2lun 1
238
;
S
U20-H6 Weak A9-U20 bp
;
392 71 395 2 parsed_2lun 1
239 M 396 70 396 72 parsed_2lun 1
240 W 397 70 397 73 parsed_2lun 1
241
;
W
A21-H8
;
398 70 401 2 parsed_2lun 1
242 M 402 70 403 2 parsed_2lun 1
243 W 404 70 404 73 parsed_2lun 1
244 M 405 69 405 71 parsed_2lun 1
245 M 406 69 406 72 parsed_2lun 1
246
;
M
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
U22-H6 U22~~U7~~A9 ???? |
V
;
407 70 411 86 parsed_2lun 1
247 W 412 69 412 72 parsed_2lun 1
248 W 413 69 414 2 parsed_2lun 1
249 W 415 70 415 72 parsed_2lun 1
250
;
M
C23-H6 C23~~G6~~G8 ????
;
416 70 419 2 parsed_2lun 1
251 S 420 69 420 72 parsed_2lun 1
252 S 421 69 422 2 parsed_2lun 1
253 M 423 70 423 72 parsed_2lun 1
254 M 424 69 424 71 parsed_2lun 1
255
;
W
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~^
A24-H8
;
425 69 431 2 parsed_2lun 1
256 M 432 69 432 71 parsed_2lun 1
257 W 433 70 434 2 parsed_2lun 1
258 S 435 70 435 72 parsed_2lun 1
259 M 436 69 436 72 parsed_2lun 1
260 W 437 69 437 72 parsed_2lun 1
261 W 438 71 438 73 parsed_2lun 1
262
;
W
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Stem 4 bps~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
G25-H8
;
439 70 445 2 parsed_2lun 1
263 M 446 70 446 72 parsed_2lun 1
264 M 447 69 447 71 parsed_2lun 1
265 VW 448 70 448 73 parsed_2lun 1
266 M 450 71 450 73 parsed_2lun 1
267 S 451 70 451 72 parsed_2lun 1
268 S 452 69 452 71 parsed_2lun 1
269
;
M
C26-H6
;
453 70 456 2 parsed_2lun 1
270 S 457 70 457 72 parsed_2lun 1
271 S 458 69 458 71 parsed_2lun 1
272 M 459 69 459 71 parsed_2lun 1
273 VW 460 69 460 72 parsed_2lun 1
274 W 461 70 462 2 parsed_2lun 1
275 M 463 70 463 72 parsed_2lun 1
276 S 464 69 464 72 parsed_2lun 1
277 VW 465 69 465 72 parsed_2lun 1
278 S 466 69 466 71 parsed_2lun 1
279
;
M
U27-H6
;
467 70 470 2 parsed_2lun 1
280 S 471 70 471 72 parsed_2lun 1
281 S 472 69 472 71 parsed_2lun 1
282 M 473 69 473 71 parsed_2lun 1
283 VW 474 69 474 72 parsed_2lun 1
284 W 475 70 476 2 parsed_2lun 1
285 M 477 70 477 72 parsed_2lun 1
286 M 478 70 478 72 parsed_2lun 1
287 VW 479 69 479 72 parsed_2lun 1
288 S 480 69 480 71 parsed_2lun 1
289
;
M
C28-H6
;
481 70 484 2 parsed_2lun 1
290 M 485 70 485 72 parsed_2lun 1
291 S 486 69 486 71 parsed_2lun 1
292 M 487 69 487 71 parsed_2lun 1
293 VW 488 69 488 72 parsed_2lun 1
294 W 489 70 490 2 parsed_2lun 1
295 W 491 71 491 73 parsed_2lun 1
296 M 492 69 492 71 parsed_2lun 1
297 VW 493 69 493 72 parsed_2lun 1
298 S 494 69 494 71 parsed_2lun 1
299 M 495 70 495 72 parsed_2lun 1
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