NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
572106 |
2miy   |
19698 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1337 |
data_2miy_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2miy
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2miy 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2miy
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2miy "Master copy" parsed_2miy
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2miy
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2miy.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2miy 1
1 2miy.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 865 parsed_2miy 1
1 2miy.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 122 parsed_2miy 1
1 2miy.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 221 parsed_2miy 1
1 2miy.mr . . XPLOR/CNS 5 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 26 parsed_2miy 1
1 2miy.mr . . XPLOR/CNS 6 unknown "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2miy 1
1 2miy.mr . . XPLOR/CNS 7 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 103 parsed_2miy 1
1 2miy.mr . . "MR format" 8 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2miy 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2miy
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA 20-DEC-13 2MIY
*TITLE SOLUTION NMR STRUCTURE OF A PREQ1 CLASS II RIBOSWITCH FROM
*TITLE 2 STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: RNA_(59-MER);
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES
*KEYWDS PREQ1, RIBOSWITCH, CLASSII, PSEUDOKNOT, STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE, RNA
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 18
*AUTHOR M.KANG, C.D.EICHHORN, J.FEIGON
*REVDAT 1 29-JAN-14 2MIY 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2miy
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2miy 1
2 1 . . . parsed_2miy 1
3 1 . . . parsed_2miy 1
4 1 . . . parsed_2miy 1
5 1 . . . parsed_2miy 1
6 1 . . . parsed_2miy 1
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8 1 . . . parsed_2miy 1
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11 1 . . . parsed_2miy 1
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13 1 . . . parsed_2miy 1
14 1 . . . parsed_2miy 1
15 1 . . . parsed_2miy 1
16 1 . . . parsed_2miy 1
17 1 . . . parsed_2miy 1
18 1 . . . parsed_2miy 1
19 1 . . . parsed_2miy 1
20 1 . . . parsed_2miy 1
21 1 . . . parsed_2miy 1
22 1 . . . parsed_2miy 1
23 1 . . . parsed_2miy 1
24 1 . . . parsed_2miy 1
25 1 . . . parsed_2miy 1
26 1 . . . parsed_2miy 1
27 1 . . . parsed_2miy 1
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29 1 . . . parsed_2miy 1
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31 1 . . . parsed_2miy 1
32 1 . . . parsed_2miy 1
33 1 . . . parsed_2miy 1
34 1 . . . parsed_2miy 1
35 1 . . . parsed_2miy 1
36 1 . . . parsed_2miy 1
37 1 . . . parsed_2miy 1
38 1 . . . parsed_2miy 1
39 1 . . . parsed_2miy 1
40 1 . . . parsed_2miy 1
41 1 . . . parsed_2miy 1
42 1 . . . parsed_2miy 1
43 1 . . . parsed_2miy 1
44 1 . . . parsed_2miy 1
45 1 . . . parsed_2miy 1
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134 1 . . . parsed_2miy 1
135 1 . . . parsed_2miy 1
136 1 . . . parsed_2miy 1
137 1 . . . parsed_2miy 1
138 1 . . . parsed_2miy 1
139 1 . . . parsed_2miy 1
140 1 . . . parsed_2miy 1
141 1 . . . parsed_2miy 1
142 1 . . . parsed_2miy 1
143 1 . . . parsed_2miy 1
144 1 . . . parsed_2miy 1
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173 1 . . . parsed_2miy 1
174 1 . . . parsed_2miy 1
175 1 . . . parsed_2miy 1
176 1 . . . parsed_2miy 1
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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6 1 2 . . . . . . . . . 27 . O2 parsed_2miy 2
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12 1 2 . . . . . . . . . 1 . O2 parsed_2miy 2
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70 1 2 . . . . . . . . . 8 . N3 parsed_2miy 2
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71 1 2 . . . . . . . . . 59 . N3 parsed_2miy 2
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82 1 2 . . . . . . . . . 52 . N7 parsed_2miy 2
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96 1 2 . . . . . . . . . 46 . N3 parsed_2miy 2
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111 1 1 . . . . . . . . . 47 . H21 parsed_2miy 2
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114 1 1 . . . . . . . . . 12 . H21 parsed_2miy 2
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115 1 1 . . . . . . . . . 51 . HO2' parsed_2miy 2
115 1 2 . . . . . . . . . 35 . N1 parsed_2miy 2
116 1 1 . . . . . . . . . 51 . O2' parsed_2miy 2
116 1 2 . . . . . . . . . 35 . N1 parsed_2miy 2
117 1 1 . . . . . . . . . 19 . HO2' parsed_2miy 2
117 1 2 . . . . . . . . . 50 . N1 parsed_2miy 2
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stop_
loop_
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1 "message=on echo=on" 1 1 1 26 parsed_2miy 2
2 "changed from H2'' for use on ribose--jem" 22 38 22 38 parsed_2miy 2
3 "changed from H2'' for use on ribose--jem" 66 38 66 38 parsed_2miy 2
4 "changed from H2'' for use on ribose--jem" 110 38 110 38 parsed_2miy 2
5 "changed from H2'' for use on ribose--jem" 154 38 154 38 parsed_2miy 2
6 "{* keep Gua amino groups flat *}" 179 1 179 34 parsed_2miy 2
7 "{* keep cytosine amino flat *}" 200 1 200 32 parsed_2miy 2
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loop_
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_TA_constraint_parse_err.Torsion_angle_constraint_list_ID
1
;
for $nchir in (1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16) loop chiral
restraints dihedral
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;
3 1 7 11 parsed_2miy 2
2
;
end
end loop chiral
for $nchir in (17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32) loop chiral
restraints dihedral
scale= 1.0
;
43 1 51 11 parsed_2miy 2
3
;
end
end loop chiral
for $nchir in (33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48) loop chiral
restraints dihedral
scale= 1.0
;
87 1 95 11 parsed_2miy 2
4
;
end
end loop chiral
for $nchir in (49 50 51 52 53 54 55 56 57 58) loop chiral
restraints dihedral
scale= 1.0
;
131 1 139 11 parsed_2miy 2
5
;
end
end loop chiral
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for $namin in (-1 4 5 7 12 26 37 39 40 47 53 54 56 59) loop amino
restraints dihedral
scale= 1.0
;
175 1 184 11 parsed_2miy 2
6
;
end
end loop amino
!{* keep cytosine amino flat *}
for $namin2 in (1 8 13 20 22 23 27 34 36 38 45 46 48 49) loop amino2
restraints dihedral
scale= 1.0
;
196 1 205 11 parsed_2miy 2
7
;
end
end loop amino2
!{* keep adenine amino flat *}
for $namin3 in (11 21 24 25 28 30 33 35 41 43 44 50 51 52 55 57 58) loop amino3
restraints dihedral
scale= 1.0
;
218 1 227 11 parsed_2miy 2
8
;
end
end loop amino3
;
240 1 242 15 parsed_2miy 2
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_RDC_constraint_list.Sf_category RDC_constraints
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_RDC_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
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_RDC_constraint.Entity_ID_2
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_RDC_constraint.Atom_ID_2
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_RDC_constraint.RDC_constraint_list_ID
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20 . . . . . . . . . . . . . . . . 26.731 24.212 29.250 . . . 5 . C8 . 5 . H8 parsed_2miy 1
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23 . . . . . . . . . . . . . . . . 10.254 7.735 12.773 . . . 11 . C8 . 11 . H8 parsed_2miy 1
24 . . . . . . . . . . . . . . . . 2.608 0.089 5.127 . . . 12 . C8 . 12 . H8 parsed_2miy 1
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