NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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559698 |
2m22   |
18892 | cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 164 |
data_2m22_MR_file_constraints
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2m22
_Study_list.ID 1
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_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2m22 1
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save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2m22
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2m22 "Master copy" parsed_2m22
stop_
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2m22
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2m22.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2m22 1
1 2m22.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 518 parsed_2m22 1
1 2m22.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 42 parsed_2m22 1
1 2m22.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 164 parsed_2m22 1
1 2m22.mr . . XPLOR/CNS 5 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2m22 1
1 2m22.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2m22 1
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save_
save_CNS/XPLOR_dihedral_4
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2m22
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 4
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Torsion_angle_constraint.ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_2
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Seq_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Comp_ID_3
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_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Angle_lower_bound_val
_Torsion_angle_constraint.Angle_upper_bound_val
_Torsion_angle_constraint.Source_experiment_ID
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_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 1 . O3' . 2 . P . 2 . O5' . 2 . C5' parsed_2m22 1
2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 2 . O3' . 3 . P . 3 . O5' . 3 . C5' parsed_2m22 1
3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 3 . O3' . 4 . P . 4 . O5' . 4 . C5' parsed_2m22 1
4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 4 . O3' . 5 . P . 5 . O5' . 5 . C5' parsed_2m22 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 6 . O3' . 7 . P . 7 . O5' . 7 . C5' parsed_2m22 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 7 . O3' . 8 . P . 8 . O5' . 8 . C5' parsed_2m22 1
7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 8 . O3' . 9 . P . 9 . O5' . 9 . C5' parsed_2m22 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 14 . O3' . 15 . P . 15 . O5' . 15 . C5' parsed_2m22 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 15 . O3' . 16 . P . 16 . O5' . 16 . C5' parsed_2m22 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 16 . O3' . 17 . P . 17 . O5' . 17 . C5' parsed_2m22 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 18 . O3' . 19 . P . 19 . O5' . 19 . C5' parsed_2m22 1
12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 19 . O3' . 20 . P . 20 . O5' . 20 . C5' parsed_2m22 1
13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 20 . O3' . 21 . P . 21 . O5' . 21 . C5' parsed_2m22 1
14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 21 . O3' . 22 . P . 22 . O5' . 22 . C5' parsed_2m22 1
15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.1 -32.1 . . 22 . O3' . 23 . P . 23 . O5' . 23 . C5' parsed_2m22 1
16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -209.9 -149.9 . . 2 . P . 2 . O5' . 2 . C5' . 2 . C4' parsed_2m22 1
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18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -209.9 -149.9 . . 4 . P . 4 . O5' . 4 . C5' . 4 . C4' parsed_2m22 1
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60 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -103.6 -43.6 . . 19 . C3' . 19 . O3' . 20 . P . 20 . O5' parsed_2m22 1
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62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -103.6 -43.6 . . 21 . C3' . 21 . O3' . 22 . P . 22 . O5' parsed_2m22 1
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65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.27 67.27 . . 2 . C1' . 2 . C2' . 2 . C3' . 2 . C4' parsed_2m22 1
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67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.27 67.27 . . 4 . C1' . 4 . C2' . 4 . C3' . 4 . C4' parsed_2m22 1
68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.27 67.27 . . 5 . C1' . 5 . C2' . 5 . C3' . 5 . C4' parsed_2m22 1
69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.27 67.27 . . 7 . C1' . 7 . C2' . 7 . C3' . 7 . C4' parsed_2m22 1
70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7.27 67.27 . . 8 . C1' . 8 . C2' . 8 . C3' . 8 . C4' parsed_2m22 1
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163 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52.0 112.0 . . 22 . C5' . 22 . C4' . 22 . C3' . 22 . O3' parsed_2m22 1
164 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52.0 112.0 . . 23 . C5' . 23 . C4' . 23 . C3' . 23 . O3' parsed_2m22 1
stop_
loop_
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1
;
backbone dihedral angles for bases 1-23
to constrain 1-5, 7-9, 15-17, 19-23 to an ideal A form RNA helix
A-form backbone dihedral angles for the stem region as Watson-Crick stem
;
1 1 3 75 parsed_2m22 1
2 *alpha* 10 59 10 59 parsed_2m22 1
3 *alpha* 15 59 15 59 parsed_2m22 1
4 *alpha* 20 59 20 59 parsed_2m22 1
5 *alpha* 25 59 25 59 parsed_2m22 1
6 *alpha* 30 59 30 59 parsed_2m22 1
7 *alpha* 35 59 35 59 parsed_2m22 1
8 *alpha* 40 59 40 59 parsed_2m22 1
9 *alpha* 45 59 45 59 parsed_2m22 1
10 *alpha* 50 59 50 59 parsed_2m22 1
11 *alpha* 55 59 55 59 parsed_2m22 1
12 *alpha* 60 59 60 59 parsed_2m22 1
13 *alpha* 65 60 65 60 parsed_2m22 1
14 *alpha* 70 60 70 60 parsed_2m22 1
15 *alpha* 75 60 75 60 parsed_2m22 1
16 *alpha* 80 59 80 59 parsed_2m22 1
17 *beta* 87 59 87 59 parsed_2m22 1
18 *beta* 92 59 92 59 parsed_2m22 1
19 *beta* 97 59 97 59 parsed_2m22 1
20 *beta* 102 59 102 59 parsed_2m22 1
21 *beta* 107 59 107 59 parsed_2m22 1
22 *beta* 112 59 112 59 parsed_2m22 1
23 *beta* 117 59 117 59 parsed_2m22 1
24 *beta* 122 59 122 59 parsed_2m22 1
25 *beta* 127 60 127 60 parsed_2m22 1
26 *beta* 132 60 132 60 parsed_2m22 1
27 *beta* 137 60 137 60 parsed_2m22 1
28 *beta* 142 59 142 59 parsed_2m22 1
29 *beta* 147 59 147 59 parsed_2m22 1
30 *beta* 152 59 152 59 parsed_2m22 1
31 *beta* 157 59 157 59 parsed_2m22 1
32 *gamma* 164 59 164 59 parsed_2m22 1
33 *gamma* 169 59 169 59 parsed_2m22 1
34 *gamma* 174 59 174 59 parsed_2m22 1
35 *gamma* 179 59 179 59 parsed_2m22 1
36 *gamma* 184 59 184 59 parsed_2m22 1
37 *gamma* 189 59 189 59 parsed_2m22 1
38 *gamma* 194 59 194 59 parsed_2m22 1
39 *gamma* 199 59 199 59 parsed_2m22 1
40 *gamma* 204 59 204 59 parsed_2m22 1
41 *gamma* 209 60 209 60 parsed_2m22 1
42 *gamma* 214 60 214 60 parsed_2m22 1
43 *gamma* 219 60 219 60 parsed_2m22 1
44 *gamma* 224 60 224 60 parsed_2m22 1
45 *gamma* 229 60 229 60 parsed_2m22 1
46 *gamma* 234 59 234 59 parsed_2m22 1
47 *gamma* 239 59 239 59 parsed_2m22 1
48 *gamma* 244 59 244 59 parsed_2m22 1
49 *gamma* 249 59 249 59 parsed_2m22 1
50 *zeta* 256 59 256 59 parsed_2m22 1
51 *zeta* 261 59 261 59 parsed_2m22 1
52 *zeta* 266 59 266 59 parsed_2m22 1
53 *zeta* 271 59 271 59 parsed_2m22 1
54 *zeta* 276 59 276 59 parsed_2m22 1
55 *zeta* 281 59 281 59 parsed_2m22 1
56 *zeta* 286 59 286 59 parsed_2m22 1
57 *zeta* 291 60 291 60 parsed_2m22 1
58 *zeta* 296 60 296 60 parsed_2m22 1
59 *zeta* 301 60 301 60 parsed_2m22 1
60 *zeta* 306 60 306 60 parsed_2m22 1
61 *zeta* 311 60 311 60 parsed_2m22 1
62 *zeta* 316 59 316 59 parsed_2m22 1
63 *zeta* 321 59 321 59 parsed_2m22 1
64 *zeta* 326 59 326 59 parsed_2m22 1
65 *nu2* 333 59 333 59 parsed_2m22 1
66 *nu2* 338 59 338 59 parsed_2m22 1
67 *nu2* 343 59 343 59 parsed_2m22 1
68 *nu2* 348 59 348 59 parsed_2m22 1
69 *nu2* 353 59 353 59 parsed_2m22 1
70 *nu2* 358 59 358 59 parsed_2m22 1
71 *nu2* 363 59 363 59 parsed_2m22 1
72 *nu2* 368 59 368 59 parsed_2m22 1
73 *nu2* 373 60 373 60 parsed_2m22 1
74 *nu2* 378 60 378 60 parsed_2m22 1
75 *nu2* 383 60 383 60 parsed_2m22 1
76 *nu2* 388 59 388 59 parsed_2m22 1
77 *nu2* 393 59 393 59 parsed_2m22 1
78 *nu2* 398 59 398 59 parsed_2m22 1
79 *nu2* 403 59 403 59 parsed_2m22 1
80 *nu2* 408 59 408 59 parsed_2m22 1
81 alpha 410 1 410 7 parsed_2m22 1
82
;
assign (resi 10 and name O3' )
(resi 11 and name P )
(resi 11 and name O5' )
(resi 11 and name C5' ) 1.0 0.0 120.0 2
;
422 2 425 56 parsed_2m22 1
83
;
assign (resi 13 and name O3' )
(resi 14 and name P )
(resi 14 and name O5' )
(resi 14 and name C5' ) 1.0 0.0 120.0 2
;
437 2 440 56 parsed_2m22 1
84 beta 447 1 447 6 parsed_2m22 1
85 zeta 484 1 484 6 parsed_2m22 1
86
;
assign (resi 11 and name C3' )
(resi 11 and name O3' )
(resi 12 and name P )
(resi 12 and name O5' ) 1.0 0.0 120.0 2
;
495 2 498 56 parsed_2m22 1
87
;
assign (resi 14 and name C3' )
(resi 14 and name O3' )
(resi 15 and name P )
(resi 15 and name O5' ) 1.0 0.0 120.0 2
;
510 2 513 56 parsed_2m22 1
88 "EPSILON - added 01/11/2012 - not in previous calculations" 520 1 520 59 parsed_2m22 1
89
;
chi dihedral restraints for DCLOOP hairpin
All chi angles are restrainted as "anti" or as "syn".
;
632 1 633 56 parsed_2m22 1
90 anti 640 53 640 59 parsed_2m22 1
91 anti 645 53 645 59 parsed_2m22 1
92 anti 650 53 650 59 parsed_2m22 1
93 anti 655 53 655 59 parsed_2m22 1
94 anti 660 53 660 59 parsed_2m22 1
95 anti 665 53 665 59 parsed_2m22 1
96 anti 670 53 670 59 parsed_2m22 1
97 anti 675 53 675 59 parsed_2m22 1
98 anti 680 53 680 59 parsed_2m22 1
99 anti 685 53 685 59 parsed_2m22 1
100 anti 690 53 690 59 parsed_2m22 1
101 anti 695 53 695 59 parsed_2m22 1
102 syn 700 52 700 58 parsed_2m22 1
103 anti 705 53 705 60 parsed_2m22 1
104 anti 710 53 710 59 parsed_2m22 1
105 anti 715 53 715 95 parsed_2m22 1
106 anti 720 53 720 60 parsed_2m22 1
107 anti 725 53 725 59 parsed_2m22 1
108 anti 730 53 730 59 parsed_2m22 1
109 anti 735 53 735 59 parsed_2m22 1
110 anti 740 53 740 59 parsed_2m22 1
111 anti 745 53 745 59 parsed_2m22 1
112
;
anti
delta=sugar pucker North (82),South (145), or Intermediate (120)
;
750 53 754 66 parsed_2m22 1
113 *delta* 759 62 759 62 parsed_2m22 1
114 *delta* 764 62 764 62 parsed_2m22 1
115 *delta* 769 62 769 62 parsed_2m22 1
116 *delta* 774 62 774 62 parsed_2m22 1
117 *delta* 779 62 779 62 parsed_2m22 1
118 *delta* 784 62 784 62 parsed_2m22 1
119 *delta* 789 61 789 61 parsed_2m22 1
120 *delta* 794 61 794 61 parsed_2m22 1
121 *delta* 799 61 799 61 parsed_2m22 1
122 *delta* 804 61 804 61 parsed_2m22 1
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124 *delta* 814 62 814 62 parsed_2m22 1
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128 *delta* 834 63 834 63 parsed_2m22 1
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135 *delta* 869 62 869 62 parsed_2m22 1
stop_
loop_
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1 "Scale = 1.0" 5 2 5 12 parsed_2m22 1
2 "Scale = 1.0" 635 2 635 12 parsed_2m22 1
stop_
save_
Contact the webmaster for help, if required. Monday, April 29, 2024 8:01:42 AM GMT (wattos1)