NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
532267 |
2lkr   |
17961 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1607 |
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_Study_list.Entry_ID parsed_2lkr
_Study_list.ID 1
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2lkr 1
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_Entry.Sf_category entry_information
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_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
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_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
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loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2lkr "Master copy" parsed_2lkr
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2lkr
_Constraint_stat_list.ID 1
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_Constraint_file.Constraint_filename
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_Constraint_file.Software_label
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2lkr.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . XPLOR/CNS 2 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 368 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . XPLOR/CNS 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 160 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . XPLOR/CNS 4 distance NOE simple 831 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . XPLOR/CNS 5 planarity "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . XPLOR/CNS 6 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 17 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . XPLOR/CNS 7 distance "hydrogen bond" simple 182 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . XPLOR/CNS 8 distance "general distance" simple 10 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . XPLOR/CNS 9 distance "general distance" simple 39 parsed_2lkr 1
1 2lkr.mr . . "MR format" 10 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2lkr 1
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_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA 19-OCT-11 2LKR
*TITLE YEAST U2/U6 COMPLEX
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: RNA (111-MER);
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES
*KEYWDS 3-HELIX JUNCTION, RNA
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 10
*AUTHOR J.E.BURKE, D.G.SASHITAL, X.ZUO, Y.WANG, S.E.BUTCHER
*REVDAT 1 22-FEB-12 2LKR 0
;
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save_CNS/XPLOR_dihedral_2
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2lkr
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 2
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_2
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_3
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_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Source_experiment_ID
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_Torsion_angle_constraint.Auth_seq_ID_3
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_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
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4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -88.6 -58.6 . . 1 . C3' . 1 . O3' . 2 . P . 2 . O5' parsed_2lkr 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -77.1 -47.1 . . 1 . O3' . 2 . P . 2 . O5' . 2 . C5' parsed_2lkr 1
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7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32.44 62.44 . . 2 . O5' . 2 . C5' . 2 . C4' . 2 . C3' parsed_2lkr 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68.45 98.45 . . 2 . C5' . 2 . C4' . 2 . C3' . 2 . O3' parsed_2lkr 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -166.7 -136.7 . . 2 . C4' . 2 . C3' . 2 . O3' . 3 . P parsed_2lkr 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -88.6 -58.6 . . 2 . C3' . 2 . O3' . 3 . P . 3 . O5' parsed_2lkr 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -77.1 -47.1 . . 2 . O3' . 3 . P . 3 . O5' . 3 . C5' parsed_2lkr 1
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! Output from nmr_structure_tools
! Created 2011-05-05 10:03:18.747000
! 863 nonexchangeable atoms selected in u2u6-xplor-no-rigid_0046_5_0.pdb for measuring inter-atomic distances
! Results: 4350 possible NOEs of <5.5 A
;
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loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1
;
# Helix 3 #:
Gua 1 Cyt 111
;
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4 "Ade 4 Uri 108" 24 1 25 25 parsed_2lkr 2
5 "Ade 5 Uri 106" 30 1 31 24 parsed_2lkr 2
6 "Ade 105 Uri 6" 36 1 37 24 parsed_2lkr 2
7 "Ade 7 Uri 104" 42 1 43 24 parsed_2lkr 2
8 "Gua 103 Cyt 8" 48 1 49 24 parsed_2lkr 2
9
;
# Helix 1 #:
Ade 96 Uri 14
;
57 1 59 24 parsed_2lkr 2
10 "Gua 15 Cyt 95" 64 1 65 24 parsed_2lkr 2
11 "Ade 16 Uri 94" 72 1 73 24 parsed_2lkr 2
12 "Ade 93 Uri 17" 78 1 79 24 parsed_2lkr 2
13 "Gua 92 Cyt 18" 84 1 85 24 parsed_2lkr 2
14 "Ade 19 Uri 89" 92 1 93 24 parsed_2lkr 2
15 "Gua 20 Cyt 88" 98 1 99 24 parsed_2lkr 2
16 "Gua 87 Cyt 21" 106 1 107 24 parsed_2lkr 2
17
;
# U6 ISL #:
Gua 23 Cyt 44
;
115 1 117 24 parsed_2lkr 2
18 "Ade 43 Uri 24" 124 1 125 24 parsed_2lkr 2
19 "Ade 42 Uri 25" 130 1 131 24 parsed_2lkr 2
20 "Gua 41 Cyt 26" 136 1 137 24 parsed_2lkr 2
21 "Gua 38 Cyt 28" 144 1 145 24 parsed_2lkr 2
22 "Gua 37 Cyt 29" 152 1 153 24 parsed_2lkr 2
23 "Ade 36 Uri 30" 160 1 161 24 parsed_2lkr 2
24
;
# Helix 2 #:
Gua 79 Cyt 52
;
167 1 169 24 parsed_2lkr 2
25 "Ade 53 Uri 78" 176 1 177 24 parsed_2lkr 2
26 "Ade 54 Uri 77" 182 1 183 24 parsed_2lkr 2
27 "Ade 55 Uri 76" 188 1 189 24 parsed_2lkr 2
28 "Gua 56 Cyt 75" 194 1 195 24 parsed_2lkr 2
29 "Ade 57 Uri 74" 202 1 203 24 parsed_2lkr 2
30 "Gua 58 Cyt 73" 208 1 209 24 parsed_2lkr 2
31 "Ade 59 Uri 72" 216 1 217 24 parsed_2lkr 2
32 "Ade 71 Uri 60" 222 1 223 24 parsed_2lkr 2
33 "Ade 70 Uri 61" 228 1 229 24 parsed_2lkr 2
34 "Gua 69 Uri 62" 234 1 235 25 parsed_2lkr 2
35 "Gua 68 Cyt 63" 240 1 241 24 parsed_2lkr 2
36 "UUCG UG pair" 249 1 249 14 parsed_2lkr 2
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save_
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_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2lkr
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1
;
--------------------------------------------
Global restraints
--------------------------------------------
;
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save_
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_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2lkr
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_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 9
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
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_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
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_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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stop_
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_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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