NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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45036 |
2dmn   |
10291 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1829 |
data_2dmn_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2dmn
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2dmn 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2dmn
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2dmn "Master copy" parsed_2dmn
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2dmn
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2dmn.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2dmn 1
1 2dmn.mr . . DYANA/DIANA 2 distance NOE simple 1737 parsed_2dmn 1
1 2dmn.mr . . DYANA/DIANA 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 92 parsed_2dmn 1
1 2dmn.mr . . "MR format" 4 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2dmn 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2dmn
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER TRANSCRIPTION 22-APR-06 2DMN
*TITLE THE SOLUTION STRUCTURE OF THE HOMEOBOX DOMAIN OF HUMAN
*TITLE 2 HOMEOBOX PROTEIN TGIF2LX
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: HOMEOBOX PROTEIN TGIF2LX;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: HOMEOBOX DOMAIN;
*COMPND 5 SYNONYM: TGFB-INDUCED FACTOR 2-LIKE PROTEIN, X- LINKED,
*COMPND 6 TGFBETA, INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR 2-LIKE PROTEIN, TGIF-
*COMPND 7 LIKE ON THE X;
*COMPND 8 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606;
*SOURCE 5 GENE: TGIF2LX, TGIFLX;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: CELL FREE SYNTHESIS;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: P050530-26;
*SOURCE 9 OTHER_DETAILS: CELL-FREE PROTEIN SYNTHESIS
*KEYWDS TGFB-INDUCED FACTOR 2-LIKE PROTEIN, X-LINKED TGF(BETA)
*KEYWDS 2 INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR 2-LIKE PROTEIN, TGIF-LIKE ON
*KEYWDS 3 THE X, STRUCTURAL GENOMICS, NPPSFA, NATIONAL PROJECT ON
*KEYWDS 4 PROTEIN STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ANALYSES, RIKEN
*KEYWDS 5 STRUCTURAL GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE, RSGI
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 20
*AUTHOR N.TOCHIO, S.OHNISHI, A.SASAGAWA, K.SAITO, S.KOSHIBA,
*AUTHOR 2 M.INOUE, T.KIGAWA, S.YOKOYAMA, RIKEN STRUCTURAL
*AUTHOR 3 GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE (RSGI)
*REVDAT 1 12-MAY-09 2DMN 0
**************************************************************
During the CYANA calculations automatic implicit swapping of restraints
involving diastereotopic substitutents was applied for prochrial groups
without stereospecific assignment. Diastereotopic substitents were
swapped individually in each conformer to calculate the minimal target
function and restraint violations.
The optimal swapping for a given prochiral group may differ among
the 20 conformers that represent the solution structure. The swapping
is therefore performed implicitly in the program and is not reflected
in the distance restraint file deposited in the PDB.
**************************************************************
;
save_
save_DYANA/DIANA_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2dmn
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2dmn 1
2 1 . . . parsed_2dmn 1
3 1 . . . parsed_2dmn 1
4 1 . . . parsed_2dmn 1
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6 1 . . . parsed_2dmn 1
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17 1 . . . parsed_2dmn 1
18 1 . . . parsed_2dmn 1
19 1 . . . parsed_2dmn 1
20 1 . . . parsed_2dmn 1
21 1 . . . parsed_2dmn 1
22 1 . . . parsed_2dmn 1
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stop_
loop_
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_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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746 1 1 . . . . . . . . . 27 TYR HA parsed_2dmn 1
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755 1 2 . . . . . . . . . 53 GLN HB3 parsed_2dmn 1
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757 1 1 . . . . . . . . . 53 GLN HB3 parsed_2dmn 1
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813 1 2 . . . . . . . . . 23 ARG HG2 parsed_2dmn 1
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831 1 1 . . . . . . . . . 53 GLN HA parsed_2dmn 1
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832 1 1 . . . . . . . . . 53 GLN HA parsed_2dmn 1
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853 1 1 . . . . . . . . . 51 LEU HA parsed_2dmn 1
853 1 2 . . . . . . . . . 51 LEU HG parsed_2dmn 1
854 1 1 . . . . . . . . . 14 LEU HA parsed_2dmn 1
854 1 2 . . . . . . . . . 14 LEU HG parsed_2dmn 1
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855 1 2 . . . . . . . . . 66 LEU HG parsed_2dmn 1
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1222 1 1 . . . . . . . . . 25 TRP HE1 parsed_2dmn 1
1222 1 2 . . . . . . . . . 43 LEU QD2 parsed_2dmn 1
1223 1 1 . . . . . . . . . 22 LEU QD1 parsed_2dmn 1
1223 1 2 . . . . . . . . . 43 LEU QD2 parsed_2dmn 1
1224 1 1 . . . . . . . . . 14 LEU HG parsed_2dmn 1
1224 1 2 . . . . . . . . . 57 TRP HA parsed_2dmn 1
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1238 1 2 . . . . . . . . . 51 LEU QD1 parsed_2dmn 1
1239 1 1 . . . . . . . . . 49 LEU HB3 parsed_2dmn 1
1239 1 2 . . . . . . . . . 53 GLN QG parsed_2dmn 1
1240 1 1 . . . . . . . . . 53 GLN QG parsed_2dmn 1
1240 1 2 . . . . . . . . . 54 ILE HN parsed_2dmn 1
1241 1 1 . . . . . . . . . 54 ILE HA parsed_2dmn 1
1241 1 2 . . . . . . . . . 58 PHE QD parsed_2dmn 1
1242 1 1 . . . . . . . . . 54 ILE QG2 parsed_2dmn 1
1242 1 2 . . . . . . . . . 58 PHE HB2 parsed_2dmn 1
1243 1 1 . . . . . . . . . 54 ILE QG2 parsed_2dmn 1
1243 1 2 . . . . . . . . . 57 TRP HE3 parsed_2dmn 1
1244 1 1 . . . . . . . . . 54 ILE QG2 parsed_2dmn 1
1244 1 2 . . . . . . . . . 54 ILE HG12 parsed_2dmn 1
1245 1 1 . . . . . . . . . 54 ILE QD1 parsed_2dmn 1
1245 1 2 . . . . . . . . . 58 PHE QE parsed_2dmn 1
1246 1 1 . . . . . . . . . 53 GLN HB2 parsed_2dmn 1
1246 1 2 . . . . . . . . . 54 ILE QD1 parsed_2dmn 1
1247 1 1 . . . . . . . . . 54 ILE HB parsed_2dmn 1
1247 1 2 . . . . . . . . . 55 SER HA parsed_2dmn 1
1248 1 1 . . . . . . . . . 22 LEU QD1 parsed_2dmn 1
1248 1 2 . . . . . . . . . 57 TRP HA parsed_2dmn 1
1249 1 1 . . . . . . . . . 57 TRP HA parsed_2dmn 1
1249 1 2 . . . . . . . . . 57 TRP HE3 parsed_2dmn 1
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1250 1 2 . . . . . . . . . 57 TRP HE3 parsed_2dmn 1
1251 1 1 . . . . . . . . . 57 TRP HE3 parsed_2dmn 1
1251 1 2 . . . . . . . . . 58 PHE QE parsed_2dmn 1
1252 1 1 . . . . . . . . . 22 LEU HB2 parsed_2dmn 1
1252 1 2 . . . . . . . . . 57 TRP HZ2 parsed_2dmn 1
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1253 1 2 . . . . . . . . . 57 TRP HZ2 parsed_2dmn 1
1254 1 1 . . . . . . . . . 57 TRP HZ2 parsed_2dmn 1
1254 1 2 . . . . . . . . . 69 MET QE parsed_2dmn 1
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1255 1 2 . . . . . . . . . 58 PHE QE parsed_2dmn 1
1256 1 1 . . . . . . . . . 57 TRP HZ3 parsed_2dmn 1
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1257 1 1 . . . . . . . . . 55 SER HA parsed_2dmn 1
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1261 1 2 . . . . . . . . . 59 ILE HG12 parsed_2dmn 1
1262 1 1 . . . . . . . . . 56 ASN HB3 parsed_2dmn 1
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1263 1 1 . . . . . . . . . 59 ILE QD1 parsed_2dmn 1
1263 1 2 . . . . . . . . . 60 ASN HN parsed_2dmn 1
1264 1 1 . . . . . . . . . 56 ASN HN parsed_2dmn 1
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1265 1 2 . . . . . . . . . 60 ASN HB3 parsed_2dmn 1
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1267 1 2 . . . . . . . . . 60 ASN HB2 parsed_2dmn 1
1268 1 1 . . . . . . . . . 59 ILE HB parsed_2dmn 1
1268 1 2 . . . . . . . . . 60 ASN HB3 parsed_2dmn 1
1269 1 1 . . . . . . . . . 60 ASN HB3 parsed_2dmn 1
1269 1 2 . . . . . . . . . 63 ARG QD parsed_2dmn 1
1270 1 1 . . . . . . . . . 60 ASN HB2 parsed_2dmn 1
1270 1 2 . . . . . . . . . 63 ARG QD parsed_2dmn 1
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1271 1 2 . . . . . . . . . 61 ALA QB parsed_2dmn 1
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1272 1 2 . . . . . . . . . 61 ALA QB parsed_2dmn 1
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1273 1 2 . . . . . . . . . 49 LEU QD1 parsed_2dmn 1
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1274 1 2 . . . . . . . . . 15 PRO HD2 parsed_2dmn 1
1275 1 1 . . . . . . . . . 14 LEU HG parsed_2dmn 1
1275 1 2 . . . . . . . . . 15 PRO HD3 parsed_2dmn 1
1276 1 1 . . . . . . . . . 13 ASN HA parsed_2dmn 1
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1279 1 2 . . . . . . . . . 15 PRO HD2 parsed_2dmn 1
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1281 1 1 . . . . . . . . . 14 LEU QD2 parsed_2dmn 1
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1282 1 1 . . . . . . . . . 14 LEU QD2 parsed_2dmn 1
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1285 1 1 . . . . . . . . . 14 LEU QD2 parsed_2dmn 1
1285 1 2 . . . . . . . . . 54 ILE QD1 parsed_2dmn 1
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1289 1 1 . . . . . . . . . 16 ALA QB parsed_2dmn 1
1289 1 2 . . . . . . . . . 19 VAL QG2 parsed_2dmn 1
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1292 1 2 . . . . . . . . . 20 LYS QB parsed_2dmn 1
1293 1 1 . . . . . . . . . 20 LYS HA parsed_2dmn 1
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1294 1 2 . . . . . . . . . 20 LYS HA parsed_2dmn 1
1295 1 1 . . . . . . . . . 20 LYS HA parsed_2dmn 1
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1299 1 1 . . . . . . . . . 20 LYS QB parsed_2dmn 1
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1300 1 1 . . . . . . . . . 20 LYS HG3 parsed_2dmn 1
1300 1 2 . . . . . . . . . 21 ILE HN parsed_2dmn 1
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1301 1 2 . . . . . . . . . 21 ILE HG13 parsed_2dmn 1
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1303 1 1 . . . . . . . . . 21 ILE QD1 parsed_2dmn 1
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1304 1 1 . . . . . . . . . 17 GLU QG parsed_2dmn 1
1304 1 2 . . . . . . . . . 21 ILE QD1 parsed_2dmn 1
1305 1 1 . . . . . . . . . 22 LEU QD1 parsed_2dmn 1
1305 1 2 . . . . . . . . . 58 PHE HA parsed_2dmn 1
1306 1 1 . . . . . . . . . 22 LEU HA parsed_2dmn 1
1306 1 2 . . . . . . . . . 22 LEU QD1 parsed_2dmn 1
1307 1 1 . . . . . . . . . 22 LEU QD1 parsed_2dmn 1
1307 1 2 . . . . . . . . . 54 ILE QG2 parsed_2dmn 1
1308 1 1 . . . . . . . . . 23 ARG HA parsed_2dmn 1
1308 1 2 . . . . . . . . . 23 ARG HD2 parsed_2dmn 1
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1311 1 1 . . . . . . . . . 23 ARG QB parsed_2dmn 1
1311 1 2 . . . . . . . . . 26 MET QB parsed_2dmn 1
1312 1 1 . . . . . . . . . 19 VAL QG2 parsed_2dmn 1
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1314 1 2 . . . . . . . . . 65 ILE QD1 parsed_2dmn 1
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1315 1 2 . . . . . . . . . 23 ARG HD3 parsed_2dmn 1
1316 1 1 . . . . . . . . . 23 ARG HD2 parsed_2dmn 1
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1317 1 1 . . . . . . . . . 23 ARG HD3 parsed_2dmn 1
1317 1 2 . . . . . . . . . 69 MET QE parsed_2dmn 1
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1318 1 2 . . . . . . . . . 25 TRP HE3 parsed_2dmn 1
1319 1 1 . . . . . . . . . 25 TRP HA parsed_2dmn 1
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1321 1 2 . . . . . . . . . 29 HIS HD2 parsed_2dmn 1
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1322 1 2 . . . . . . . . . 33 ALA QB parsed_2dmn 1
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1325 1 2 . . . . . . . . . 33 ALA HA parsed_2dmn 1
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1327 1 1 . . . . . . . . . 26 MET QE parsed_2dmn 1
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1329 1 2 . . . . . . . . . 27 TYR HA parsed_2dmn 1
1330 1 1 . . . . . . . . . 26 MET QB parsed_2dmn 1
1330 1 2 . . . . . . . . . 27 TYR HA parsed_2dmn 1
1331 1 1 . . . . . . . . . 29 HIS HB3 parsed_2dmn 1
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1332 1 1 . . . . . . . . . 30 ARG HB3 parsed_2dmn 1
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1333 1 1 . . . . . . . . . 26 MET QG parsed_2dmn 1
1333 1 2 . . . . . . . . . 66 LEU HA parsed_2dmn 1
1334 1 1 . . . . . . . . . 33 ALA QB parsed_2dmn 1
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1335 1 1 . . . . . . . . . 33 ALA QB parsed_2dmn 1
1335 1 2 . . . . . . . . . 62 ARG HG3 parsed_2dmn 1
1336 1 1 . . . . . . . . . 34 TYR HA parsed_2dmn 1
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1338 1 1 . . . . . . . . . 35 PRO HG2 parsed_2dmn 1
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1339 1 2 . . . . . . . . . 40 LYS QD parsed_2dmn 1
1340 1 1 . . . . . . . . . 37 GLU HA parsed_2dmn 1
1340 1 2 . . . . . . . . . 40 LYS HG3 parsed_2dmn 1
1341 1 1 . . . . . . . . . 36 SER HA parsed_2dmn 1
1341 1 2 . . . . . . . . . 37 GLU HA parsed_2dmn 1
1342 1 1 . . . . . . . . . 37 GLU HA parsed_2dmn 1
1342 1 2 . . . . . . . . . 40 LYS HN parsed_2dmn 1
1343 1 1 . . . . . . . . . 37 GLU HB2 parsed_2dmn 1
1343 1 2 . . . . . . . . . 38 GLU HN parsed_2dmn 1
1344 1 1 . . . . . . . . . 37 GLU HB3 parsed_2dmn 1
1344 1 2 . . . . . . . . . 38 GLU HN parsed_2dmn 1
1345 1 1 . . . . . . . . . 23 ARG HA parsed_2dmn 1
1345 1 2 . . . . . . . . . 23 ARG HG3 parsed_2dmn 1
1346 1 1 . . . . . . . . . 38 GLU HA parsed_2dmn 1
1346 1 2 . . . . . . . . . 38 GLU HG2 parsed_2dmn 1
1347 1 1 . . . . . . . . . 40 LYS HB3 parsed_2dmn 1
1347 1 2 . . . . . . . . . 40 LYS HE2 parsed_2dmn 1
1348 1 1 . . . . . . . . . 35 PRO HG3 parsed_2dmn 1
1348 1 2 . . . . . . . . . 40 LYS HG2 parsed_2dmn 1
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1351 1 2 . . . . . . . . . 40 LYS QD parsed_2dmn 1
1352 1 1 . . . . . . . . . 38 GLU HA parsed_2dmn 1
1352 1 2 . . . . . . . . . 41 GLN HB2 parsed_2dmn 1
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1353 1 2 . . . . . . . . . 42 MET HG2 parsed_2dmn 1
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1354 1 2 . . . . . . . . . 42 MET HG3 parsed_2dmn 1
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1355 1 2 . . . . . . . . . 42 MET HB2 parsed_2dmn 1
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1358 1 1 . . . . . . . . . 43 LEU HA parsed_2dmn 1
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1359 1 1 . . . . . . . . . 43 LEU HB3 parsed_2dmn 1
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1393 1 2 . . . . . . . . . 55 SER HA parsed_2dmn 1
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1430 1 2 . . . . . . . . . 69 MET HG2 parsed_2dmn 1
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1452 1 1 . . . . . . . . . 29 HIS HA parsed_2dmn 1
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1453 1 1 . . . . . . . . . 52 LEU HG parsed_2dmn 1
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1456 1 2 . . . . . . . . . 47 THR HB parsed_2dmn 1
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1460 1 2 . . . . . . . . . 22 LEU QD2 parsed_2dmn 1
1461 1 1 . . . . . . . . . 22 LEU HB2 parsed_2dmn 1
1461 1 2 . . . . . . . . . 23 ARG QB parsed_2dmn 1
1462 1 1 . . . . . . . . . 22 LEU HB2 parsed_2dmn 1
1462 1 2 . . . . . . . . . 23 ARG HG3 parsed_2dmn 1
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1464 1 2 . . . . . . . . . 22 LEU QD2 parsed_2dmn 1
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1465 1 2 . . . . . . . . . 28 LYS HN parsed_2dmn 1
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1467 1 1 . . . . . . . . . 23 ARG QB parsed_2dmn 1
1467 1 2 . . . . . . . . . 24 ASP HA parsed_2dmn 1
1468 1 1 . . . . . . . . . 67 PRO HD2 parsed_2dmn 1
1468 1 2 . . . . . . . . . 68 ASP QB parsed_2dmn 1
1469 1 1 . . . . . . . . . 20 LYS HA parsed_2dmn 1
1469 1 2 . . . . . . . . . 24 ASP HA parsed_2dmn 1
1470 1 1 . . . . . . . . . 20 LYS HA parsed_2dmn 1
1470 1 2 . . . . . . . . . 21 ILE QD1 parsed_2dmn 1
1471 1 1 . . . . . . . . . 18 SER HN parsed_2dmn 1
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loop_
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198 "SUP 0.93 #QF 0.93" 198 38 198 58 parsed_2dmn 1
199 "SUP 0.96 #QF 0.96" 199 38 199 58 parsed_2dmn 1
200 "SUP 0.96 #QF 0.96" 200 38 200 58 parsed_2dmn 1
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21 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -127.5 -67.5 . . 76 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmn 1
22 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89.2 149.2 . . 76 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmn 1
23 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -96.3 -36.3 . . 56 ASN . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmn 1
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57 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -100.3 -40.3 . . 62 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmn 1
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