NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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31523 |
1eht   |
cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 96 |
data_1eht_MR_file_constraints
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_Study_list.Entry_ID parsed_1eht
_Study_list.ID 1
loop_
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1eht 1
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_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1eht
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_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
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_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1eht "Master copy" parsed_1eht
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1eht
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1eht.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1eht 1
1 1eht.mr . . XPLOR/CNS 2 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 96 parsed_1eht 1
1 1eht.mr . . "MR format" 3 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1eht 1
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_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_1eht
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_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 2
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30.0 40.0 . . 7 . O4' . 7 . C1' . 7 . C2' . 7 . C3' parsed_1eht 1
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4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -40.0 -30.0 . . 22 . C1' . 22 . C2' . 22 . C3' . 22 . C4' parsed_1eht 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30.0 40.0 . . 23 . O4' . 23 . C1' . 23 . C2' . 23 . C3' parsed_1eht 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -40.0 -30.0 . . 23 . C1' . 23 . C2' . 23 . C3' . 23 . C4' parsed_1eht 1
7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30.0 40.0 . . 24 . O4' . 24 . C1' . 24 . C2' . 24 . C3' parsed_1eht 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -40.0 -30.0 . . 24 . C1' . 24 . C2' . 24 . C3' . 24 . C4' parsed_1eht 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30.0 40.0 . . 26 . O4' . 26 . C1' . 26 . C2' . 26 . C3' parsed_1eht 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -40.0 -30.0 . . 26 . C1' . 26 . C2' . 26 . C3' . 26 . C4' parsed_1eht 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -30.0 -10.0 . . 1 . O4' . 1 . C1' . 1 . C2' . 1 . C3' parsed_1eht 1
12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30.0 40.0 . . 1 . C1' . 1 . C2' . 1 . C3' . 1 . C4' parsed_1eht 1
13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -30.0 -10.0 . . 2 . O4' . 2 . C1' . 2 . C2' . 2 . C3' parsed_1eht 1
14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30.0 40.0 . . 2 . C1' . 2 . C2' . 2 . C3' . 2 . C4' parsed_1eht 1
15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -30.0 -10.0 . . 3 . O4' . 3 . C1' . 3 . C2' . 3 . C3' parsed_1eht 1
16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30.0 40.0 . . 3 . C1' . 3 . C2' . 3 . C3' . 3 . C4' parsed_1eht 1
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18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30.0 40.0 . . 4 . C1' . 4 . C2' . 4 . C3' . 4 . C4' parsed_1eht 1
19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -30.0 -10.0 . . 5 . O4' . 5 . C1' . 5 . C2' . 5 . C3' parsed_1eht 1
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70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 6 . O4' . 6 . C1' . 6 . N1 . 6 . C2 parsed_1eht 1
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73 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 9 . O4' . 9 . C1' . 9 . N1 . 9 . C2 parsed_1eht 1
74 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 10 . O4' . 10 . C1' . 10 . N9 . 10 . C4 parsed_1eht 1
75 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 11 . O4' . 11 . C1' . 11 . N9 . 11 . C4 parsed_1eht 1
76 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 12 . O4' . 12 . C1' . 12 . N1 . 12 . C2 parsed_1eht 1
77 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 13 . O4' . 13 . C1' . 13 . N1 . 13 . C2 parsed_1eht 1
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79 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 15 . O4' . 15 . C1' . 15 . N9 . 15 . C4 parsed_1eht 1
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87 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 23 . O4' . 23 . C1' . 23 . N1 . 23 . C2 parsed_1eht 1
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91 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 28 . O4' . 28 . C1' . 28 . N9 . 28 . C4 parsed_1eht 1
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93 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 30 . O4' . 30 . C1' . 30 . N1 . 30 . C2 parsed_1eht 1
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95 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 32 . O4' . 32 . C1' . 32 . N1 . 32 . C2 parsed_1eht 1
96 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 33 . O4' . 33 . C1' . 33 . N1 . 33 . C2 parsed_1eht 1
stop_
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1
;
Torsion angle restraints for sugar pucker in the
GZ33 - Theophylline RNA complex
GRZ 09/17/96
Pucker is defined with ribose torsion angles nu1 and nu2.
nu1 = O4'-C1'-C2'-C3'
nu2 = C1'-C2'-C3'-C4'
"N" C3' endo:
nu1 = -20 +/- 10
nu2 = +35 +/- 5
"S" C2' endo:
nu1 = +35 +/- 5
nu2 = -35 +/- 5
See Saenger page 20.
C2' endo nucleotides:
Ade 7
;
1 1 18 14 parsed_1eht 1
2 "Cyt 22" 27 1 28 15 parsed_1eht 1
3 "Uri 23" 37 1 38 15 parsed_1eht 1
4 "Uri 24" 47 1 48 15 parsed_1eht 1
5 "Gua 26" 57 1 58 15 parsed_1eht 1
6
;
C3' endo nucleotides: ( everybody else )
Gua 1
;
67 1 71 15 parsed_1eht 1
7 "Gua 2" 80 1 81 15 parsed_1eht 1
8 "Cyt 3" 90 1 91 15 parsed_1eht 1
9 "Gua 4" 100 1 101 15 parsed_1eht 1
10 "Ade 5" 110 1 111 15 parsed_1eht 1
11 "Uri 6" 120 1 121 15 parsed_1eht 1
12
;
Ade 7 is 2' endo
Cyt 8
;
130 1 133 15 parsed_1eht 1
13 "Cyt 9" 142 1 143 15 parsed_1eht 1
14 "Ade 10" 152 1 153 15 parsed_1eht 1
15 "Gua 11" 162 1 163 15 parsed_1eht 1
16 "Cyt 12" 172 1 173 15 parsed_1eht 1
17 "Cyt 13" 182 1 183 15 parsed_1eht 1
18 "Gua 14" 192 1 193 15 parsed_1eht 1
19 "Ade 15" 202 1 203 15 parsed_1eht 1
20 "Ade 16" 212 1 213 15 parsed_1eht 1
21 "Ade 17" 222 1 223 15 parsed_1eht 1
22 "Gua 18" 232 1 233 15 parsed_1eht 1
23 "Gua 19" 242 1 243 15 parsed_1eht 1
24 "Cyt 20" 252 1 253 15 parsed_1eht 1
25 "Cyt 21" 262 1 263 15 parsed_1eht 1
26
;
Cyt 22 is c2' endo
Uri 23 is c2' endo
Uri 24 is c2' endo
Gua 25
;
272 1 277 15 parsed_1eht 1
27
;
Gua 26 is c2' endo
Cyt 27 is c2' endo
but is probably averaged. Left unrestrained
Ade 28
;
286 1 291 15 parsed_1eht 1
28 "Gua 29" 300 1 301 15 parsed_1eht 1
29 "Cyt 30" 310 1 311 15 parsed_1eht 1
30 "Gua 31" 320 1 321 15 parsed_1eht 1
31 "Uri 32" 330 1 331 15 parsed_1eht 1
32 "Cyt 33" 340 1 341 15 parsed_1eht 1
33
;
Torsion angle restraints for the xhi torsion angle in the
GZ33 - Theophylline RNA complex.
Xhi is defined as follows...
Purines = O4'-C1'-N9-C4
Pyrimidines = O4'-C1'-N1-C2
Anti:
Xhi = 180.0 +/- 90.0
including high-anti and excluding high-syn:
Xhi = -150.0 +/- 90.0
Syn:
Xhi = 0.0 +/- 90.0
See Saenger page 22.
There are no syn bases in the GZ33-Theophylline complex.
No large H1'-Haro nOes were observed, and large H3'-Haro
(or H2'-Haro) were observed for all nucleotides.
;
350 1 369 2 parsed_1eht 1
34 "Cyt 27 left unrestrained ( likely averaged )." 448 1 448 49 parsed_1eht 1
stop_
save_
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