NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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31129 |
1duf   |
cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 156 |
data_1duf_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1duf
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1duf 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1duf
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1duf "Master copy" parsed_1duf
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1duf
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1duf.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1duf 1
1 1duf.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE ambi 162 parsed_1duf 1
1 1duf.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 32 parsed_1duf 1
1 1duf.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 156 parsed_1duf 1
1 1duf.mr . . XPLOR/CNS 5 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1duf 1
1 1duf.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1duf 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_dihedral_4
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_1duf
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 4
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Torsion_angle_constraint.ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_1
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_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Seq_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Comp_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Seq_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Comp_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Seq_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Comp_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Angle_lower_bound_val
_Torsion_angle_constraint.Angle_upper_bound_val
_Torsion_angle_constraint.Source_experiment_ID
_Torsion_angle_constraint.Auth_asym_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Auth_seq_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Auth_comp_ID_1
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_Torsion_angle_constraint.Auth_asym_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Auth_seq_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Auth_comp_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Auth_asym_ID_3
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_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Auth_asym_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Auth_seq_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Auth_comp_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 1 . O3' . 2 . P . 2 . O5' . 2 . C5' parsed_1duf 1
2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 2 . O3' . 3 . P . 3 . O5' . 3 . C5' parsed_1duf 1
3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 3 . O3' . 4 . P . 4 . O5' . 4 . C5' parsed_1duf 1
4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 4 . O3' . 5 . P . 5 . O5' . 5 . C5' parsed_1duf 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 5 . O3' . 6 . P . 6 . O5' . 6 . C5' parsed_1duf 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 6 . O3' . 7 . P . 7 . O5' . 7 . C5' parsed_1duf 1
7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 7 . O3' . 8 . P . 8 . O5' . 8 . C5' parsed_1duf 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 8 . O3' . 9 . P . 9 . O5' . 9 . C5' parsed_1duf 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 9 . O3' . 10 . P . 10 . O5' . 10 . C5' parsed_1duf 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 10 . O3' . 11 . P . 11 . O5' . 11 . C5' parsed_1duf 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 11 . O3' . 12 . P . 12 . O5' . 12 . C5' parsed_1duf 1
12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 13 . O3' . 14 . P . 14 . O5' . 14 . C5' parsed_1duf 1
13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 14 . O3' . 15 . P . 15 . O5' . 15 . C5' parsed_1duf 1
14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 15 . O3' . 16 . P . 16 . O5' . 16 . C5' parsed_1duf 1
15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 16 . O3' . 17 . P . 17 . O5' . 17 . C5' parsed_1duf 1
16 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 17 . O3' . 18 . P . 18 . O5' . 18 . C5' parsed_1duf 1
17 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 18 . O3' . 19 . P . 19 . O5' . 19 . C5' parsed_1duf 1
18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 19 . O3' . 20 . P . 20 . O5' . 20 . C5' parsed_1duf 1
19 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 20 . O3' . 21 . P . 21 . O5' . 21 . C5' parsed_1duf 1
20 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 21 . O3' . 22 . P . 22 . O5' . 22 . C5' parsed_1duf 1
21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 22 . O3' . 23 . P . 23 . O5' . 23 . C5' parsed_1duf 1
22 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.0 -31.0 . . 23 . O3' . 24 . P . 24 . O5' . 24 . C5' parsed_1duf 1
23 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 2 . P . 2 . O5' . 2 . C5' . 2 . C4' parsed_1duf 1
24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 3 . P . 3 . O5' . 3 . C5' . 3 . C4' parsed_1duf 1
25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 4 . P . 4 . O5' . 4 . C5' . 4 . C4' parsed_1duf 1
26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 5 . P . 5 . O5' . 5 . C5' . 5 . C4' parsed_1duf 1
27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 6 . P . 6 . O5' . 6 . C5' . 6 . C4' parsed_1duf 1
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29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 8 . P . 8 . O5' . 8 . C5' . 8 . C4' parsed_1duf 1
30 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 9 . P . 9 . O5' . 9 . C5' . 9 . C4' parsed_1duf 1
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32 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 11 . P . 11 . O5' . 11 . C5' . 11 . C4' parsed_1duf 1
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37 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 17 . P . 17 . O5' . 17 . C5' . 17 . C4' parsed_1duf 1
38 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 18 . P . 18 . O5' . 18 . C5' . 18 . C4' parsed_1duf 1
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40 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 20 . P . 20 . O5' . 20 . C5' . 20 . C4' parsed_1duf 1
41 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 21 . P . 21 . O5' . 21 . C5' . 21 . C4' parsed_1duf 1
42 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 22 . P . 22 . O5' . 22 . C5' . 22 . C4' parsed_1duf 1
43 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 23 . P . 23 . O5' . 23 . C5' . 23 . C4' parsed_1duf 1
44 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 24 . P . 24 . O5' . 24 . C5' . 24 . C4' parsed_1duf 1
45 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 1 . O5' . 1 . C5' . 1 . C4' . 1 . C3' parsed_1duf 1
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49 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 5 . O5' . 5 . C5' . 5 . C4' . 5 . C3' parsed_1duf 1
50 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 6 . O5' . 6 . C5' . 6 . C4' . 6 . C3' parsed_1duf 1
51 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 7 . O5' . 7 . C5' . 7 . C4' . 7 . C3' parsed_1duf 1
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57 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 13 . O5' . 13 . C5' . 13 . C4' . 13 . C3' parsed_1duf 1
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62 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 18 . O5' . 18 . C5' . 18 . C4' . 18 . C3' parsed_1duf 1
63 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 19 . O5' . 19 . C5' . 19 . C4' . 19 . C3' parsed_1duf 1
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65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 21 . O5' . 21 . C5' . 21 . C4' . 21 . C3' parsed_1duf 1
66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 22 . O5' . 22 . C5' . 22 . C4' . 22 . C3' parsed_1duf 1
67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 23 . O5' . 23 . C5' . 23 . C4' . 23 . C3' parsed_1duf 1
68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27.0 87.0 . . 24 . O5' . 24 . C5' . 24 . C4' . 24 . C3' parsed_1duf 1
69 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102.5 142.5 . . 1 . C5' . 1 . C4' . 1 . C3' . 1 . O3' parsed_1duf 1
70 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101.8 141.8 . . 2 . C5' . 2 . C4' . 2 . C3' . 2 . O3' parsed_1duf 1
71 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104.4 144.4 . . 3 . C5' . 3 . C4' . 3 . C3' . 3 . O3' parsed_1duf 1
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73 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106.7 146.7 . . 5 . C5' . 5 . C4' . 5 . C3' . 5 . O3' parsed_1duf 1
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127 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -121.0 -61.0 . . 18 . C3' . 18 . O3' . 19 . P . 19 . O5' parsed_1duf 1
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129 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -121.0 -61.0 . . 20 . C3' . 20 . O3' . 21 . P . 21 . O5' parsed_1duf 1
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135 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 3 . O4' . 3 . C1' . 3 . N1 . 3 . C2 parsed_1duf 1
136 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 4 . O4' . 4 . C1' . 4 . N9 . 4 . C4 parsed_1duf 1
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138 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 6 . O4' . 6 . C1' . 6 . N9 . 6 . C4 parsed_1duf 1
139 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 7 . O4' . 7 . C1' . 7 . N1 . 7 . C2 parsed_1duf 1
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141 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 9 . O4' . 9 . C1' . 9 . N1 . 9 . C2 parsed_1duf 1
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143 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 11 . O4' . 11 . C1' . 11 . N1 . 11 . C2 parsed_1duf 1
144 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 12 . O4' . 12 . C1' . 12 . N9 . 12 . C4 parsed_1duf 1
145 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 13 . O4' . 13 . C1' . 13 . N1 . 13 . C2 parsed_1duf 1
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147 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 15 . O4' . 15 . C1' . 15 . N1 . 15 . C2 parsed_1duf 1
148 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 16 . O4' . 16 . C1' . 16 . N9 . 16 . C4 parsed_1duf 1
149 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 17 . O4' . 17 . C1' . 17 . N9 . 17 . C4 parsed_1duf 1
150 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 18 . O4' . 18 . C1' . 18 . N9 . 18 . C4 parsed_1duf 1
151 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 19 . O4' . 19 . C1' . 19 . N1 . 19 . C2 parsed_1duf 1
152 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 20 . O4' . 20 . C1' . 20 . N1 . 20 . C2 parsed_1duf 1
153 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 21 . O4' . 21 . C1' . 21 . N1 . 21 . C2 parsed_1duf 1
154 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 22 . O4' . 22 . C1' . 22 . N9 . 22 . C4 parsed_1duf 1
155 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 23 . O4' . 23 . C1' . 23 . N1 . 23 . C2 parsed_1duf 1
156 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.0 -89.0 . . 24 . O4' . 24 . C1' . 24 . N9 . 24 . C4 parsed_1duf 1
stop_
loop_
_TA_constraint_comment_org.ID
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_TA_constraint_comment_org.Torsion_angle_constraint_list_ID
1
;
Ideal dihedral values for a B-DNA
Alpha dihedral
;
1 1 6 2 parsed_1duf 1
2 "Beta dihedral" 119 1 121 2 parsed_1duf 1
3 "Gamma dihedrals" 233 1 235 2 parsed_1duf 1
4
;
Delta dihedrals
Use Bax & Lerner's JMR 79, 429-438 values.
;
358 1 360 45 parsed_1duf 1
5
;
Epsilon dihedrals
Use Sklenar and Bax paper (JACS nov 25, 1987)
assign ( resid 1 and name C4' )
( resid 1 and name C3' )
( resid 1 and name O3' )
( resid 2 and name P ) 1 -158.0 20.0 2
;
483 1 492 58 parsed_1duf 1
6
;
assign ( resid 13 and name C4' )
( resid 13 and name C3' )
( resid 13 and name O3' )
( resid 14 and name P ) 1 -158.0 20.0 2
;
544 1 547 58 parsed_1duf 1
7
;
Zeta dihedral
assign ( resid 1 and name C3' )
( resid 1 and name O3' )
( resid 2 and name P )
( resid 2 and name O5' ) 1 -91.0 30.0 2
;
599 1 607 57 parsed_1duf 1
8
;
assign ( resid 13 and name C3' )
( resid 13 and name O3' )
( resid 14 and name P )
( resid 14 and name O5' ) 1 -91.0 30.0 2
;
659 1 662 57 parsed_1duf 1
9 "Chi dihedral" 714 1 716 2 parsed_1duf 1
stop_
save_
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