NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
392080 | 1pqx | 5844 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1pqx save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1304 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 273 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 169.124 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.538 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0139 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0013 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0620 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 1 MET 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 2 LYS 0.085 0.042 6 0 "[ . 1]" 1 3 ILE 0.223 0.085 7 0 "[ . 1]" 1 4 ILE 0.246 0.115 4 0 "[ . 1]" 1 5 SER 0.290 0.115 4 0 "[ . 1]" 1 6 ILE 1.093 0.538 10 1 "[ . +]" 1 7 SER 1.197 0.538 10 1 "[ . +]" 1 8 GLU 2.950 0.363 2 0 "[ . 1]" 1 9 THR 2.788 0.363 2 0 "[ . 1]" 1 10 PRO 0.496 0.164 7 0 "[ . 1]" 1 11 ASN 0.552 0.137 6 0 "[ . 1]" 1 12 HIS 0.126 0.056 8 0 "[ . 1]" 1 13 ASN 0.509 0.105 8 0 "[ . 1]" 1 14 THR 1.039 0.227 7 0 "[ . 1]" 1 15 MET 0.260 0.086 2 0 "[ . 1]" 1 16 LYS 0.360 0.086 2 0 "[ . 1]" 1 17 ILE 0.346 0.079 6 0 "[ . 1]" 1 18 THR 0.186 0.052 5 0 "[ . 1]" 1 19 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 20 SER 0.649 0.127 9 0 "[ . 1]" 1 21 GLU 0.627 0.127 9 0 "[ . 1]" 1 22 SER 0.625 0.458 6 0 "[ . 1]" 1 23 ARG 0.507 0.458 6 0 "[ . 1]" 1 24 GLU 0.222 0.084 7 0 "[ . 1]" 1 25 GLY 0.172 0.084 7 0 "[ . 1]" 1 26 MET 0.113 0.068 9 0 "[ . 1]" 1 27 THR 0.355 0.105 4 0 "[ . 1]" 1 28 SER 0.242 0.105 4 0 "[ . 1]" 1 29 ASP 0.254 0.066 1 0 "[ . 1]" 1 30 THR 0.020 0.020 8 0 "[ . 1]" 1 31 TYR 0.139 0.086 10 0 "[ . 1]" 1 32 THR 0.150 0.122 2 0 "[ . 1]" 1 33 LYS 0.759 0.438 8 0 "[ . 1]" 1 34 VAL 1.703 0.438 8 0 "[ . 1]" 1 35 ASP 0.773 0.143 1 0 "[ . 1]" 1 36 ASP 0.033 0.033 4 0 "[ . 1]" 1 37 SER 0.086 0.053 7 0 "[ . 1]" 1 38 GLN 0.588 0.103 10 0 "[ . 1]" 1 39 PRO 0.273 0.045 2 0 "[ . 1]" 1 40 ALA 0.017 0.017 3 0 "[ . 1]" 1 41 PHE 0.066 0.030 4 0 "[ . 1]" 1 42 ILE 0.261 0.049 4 0 "[ . 1]" 1 43 ASN 1.083 0.096 7 0 "[ . 1]" 1 44 ASP 0.017 0.017 3 0 "[ . 1]" 1 45 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 46 LEU 0.103 0.103 10 0 "[ . 1]" 1 47 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 48 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 49 GLU 0.063 0.063 1 0 "[ . 1]" 1 50 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 51 VAL 0.326 0.326 3 0 "[ . 1]" 1 52 LYS 0.748 0.269 7 0 "[ . 1]" 1 53 SER 0.951 0.269 7 0 "[ . 1]" 1 54 ILE 0.139 0.086 10 0 "[ . 1]" 1 55 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 56 HIS 0.254 0.066 1 0 "[ . 1]" 1 57 VAL 0.202 0.112 10 0 "[ . 1]" 1 58 MET 0.441 0.112 10 0 "[ . 1]" 1 59 ASP 0.264 0.099 2 0 "[ . 1]" 1 60 PHE 0.025 0.021 6 0 "[ . 1]" 1 61 ILE 0.117 0.046 10 0 "[ . 1]" 1 62 SER 0.023 0.023 7 0 "[ . 1]" 1 63 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 64 ASP 0.990 0.227 7 0 "[ . 1]" 1 65 LYS 0.276 0.105 8 0 "[ . 1]" 1 66 GLU 0.033 0.023 6 0 "[ . 1]" 1 67 ASN 0.025 0.016 9 0 "[ . 1]" 1 68 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 69 ALA 0.020 0.020 6 0 "[ . 1]" 1 70 ASN 0.038 0.020 6 0 "[ . 1]" 1 71 TRP 0.145 0.056 8 0 "[ . 1]" 1 72 GLU 0.017 0.017 3 0 "[ . 1]" 1 73 THR 0.139 0.051 1 0 "[ . 1]" 1 74 VAL 0.088 0.021 5 0 "[ . 1]" 1 75 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 76 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 77 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 78 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 79 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 80 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" 1 81 VAL 0.295 0.070 1 0 "[ . 1]" 1 82 PHE 0.477 0.082 1 0 "[ . 1]" 1 83 GLU 0.213 0.066 5 0 "[ . 1]" 1 84 LEU 0.494 0.086 4 0 "[ . 1]" 1 85 GLU 0.440 0.091 5 0 "[ . 1]" 1 86 HIS 0.141 0.091 5 0 "[ . 1]" 1 87 HIS 0.000 0.000 . 0 "[ . 1]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 1 MET HA 1 1 MET HG2 4.000 . 5.000 2.871 2.248 3.624 . 0 0 "[ . 1]" 1 2 1 1 MET HA 1 1 MET HG3 4.000 . 5.000 2.611 2.296 3.116 . 0 0 "[ . 1]" 1 3 1 1 MET HA 1 2 LYS H 3.000 . 3.500 2.454 2.166 3.305 . 0 0 "[ . 1]" 1 4 1 1 MET HA 1 20 SER QB 4.000 . 6.000 3.810 2.506 4.926 . 0 0 "[ . 1]" 1 5 1 1 MET HA 1 26 MET ME 4.000 . 6.000 4.674 4.309 4.930 . 0 0 "[ . 1]" 1 6 1 1 MET QB 1 82 PHE QD 4.000 . 8.000 4.470 2.837 5.649 . 0 0 "[ . 1]" 1 7 1 1 MET QG 1 2 LYS H 4.000 . 6.000 4.272 3.611 4.510 . 0 0 "[ . 1]" 1 8 1 1 MET QG 1 19 LEU MD2 4.000 . 7.000 4.110 3.393 4.807 . 0 0 "[ . 1]" 1 9 1 1 MET QG 1 20 SER H 4.000 . 6.000 4.414 3.431 5.419 . 0 0 "[ . 1]" 1 10 1 1 MET HG2 1 26 MET ME 4.000 . 6.000 3.467 2.667 4.520 . 0 0 "[ . 1]" 1 11 1 1 MET HG3 1 26 MET ME 4.000 . 6.000 3.970 3.044 5.048 . 0 0 "[ . 1]" 1 12 1 2 LYS H 1 20 SER H 4.000 . 5.000 3.399 2.555 5.007 0.007 10 0 "[ . 1]" 1 13 1 2 LYS HA 1 3 ILE H 2.500 . 2.900 2.595 2.340 2.798 . 0 0 "[ . 1]" 1 14 1 2 LYS QB 1 2 LYS QE 4.000 . 7.000 2.871 2.106 3.556 . 0 0 "[ . 1]" 1 15 1 2 LYS QB 1 3 ILE H 4.000 . 6.000 2.533 1.758 4.011 0.042 6 0 "[ . 1]" 1 16 1 2 LYS QB 1 83 GLU QG 4.000 . 7.000 5.175 4.555 5.547 . 0 0 "[ . 1]" 1 17 1 2 LYS QG 1 82 PHE QB 4.000 . 7.000 3.768 2.285 4.462 . 0 0 "[ . 1]" 1 18 1 2 LYS QD 1 83 GLU QB 4.000 . 7.000 4.989 4.024 5.588 . 0 0 "[ . 1]" 1 19 1 2 LYS QE 1 4 ILE MD 4.000 . 7.000 4.149 2.733 5.039 . 0 0 "[ . 1]" 1 20 1 3 ILE H 1 3 ILE HB 3.000 . 3.500 2.682 2.357 3.585 0.085 7 0 "[ . 1]" 1 21 1 3 ILE H 1 3 ILE HG12 4.000 . 5.000 3.618 3.095 3.826 . 0 0 "[ . 1]" 1 22 1 3 ILE H 1 3 ILE HG13 4.000 . 5.000 2.341 2.110 2.515 . 0 0 "[ . 1]" 1 23 1 3 ILE H 1 3 ILE MG 4.000 . 6.000 3.800 3.727 3.988 . 0 0 "[ . 1]" 1 24 1 3 ILE H 1 3 ILE MD 4.000 . 6.000 3.539 3.122 4.111 . 0 0 "[ . 1]" 1 25 1 3 ILE H 1 19 LEU MD2 4.000 . 6.000 4.344 2.811 4.969 . 0 0 "[ . 1]" 1 26 1 3 ILE H 1 82 PHE HB2 4.000 . 5.000 3.791 3.163 4.750 . 0 0 "[ . 1]" 1 27 1 3 ILE H 1 82 PHE HB3 4.000 . 5.000 4.028 3.299 4.671 . 0 0 "[ . 1]" 1 28 1 3 ILE HA 1 3 ILE HG12 4.000 . 5.000 2.646 2.512 2.784 . 0 0 "[ . 1]" 1 29 1 3 ILE HA 1 3 ILE HG13 4.000 . 5.000 2.869 2.688 3.297 . 0 0 "[ . 1]" 1 30 1 3 ILE HA 1 3 ILE MD 4.000 . 6.000 3.842 3.749 3.888 . 0 0 "[ . 1]" 1 31 1 3 ILE HA 1 4 ILE H 3.000 . 3.500 2.162 2.143 2.198 . 0 0 "[ . 1]" 1 32 1 3 ILE HA 1 4 ILE HB 4.000 . 5.000 4.778 4.349 5.012 0.012 10 0 "[ . 1]" 1 33 1 3 ILE HA 1 5 SER H 4.000 . 5.000 3.820 3.348 4.699 . 0 0 "[ . 1]" 1 34 1 3 ILE HA 1 17 ILE MG 4.000 . 6.000 2.770 2.369 3.216 . 0 0 "[ . 1]" 1 35 1 3 ILE HA 1 19 LEU MD2 4.000 . 6.000 3.431 2.723 3.881 . 0 0 "[ . 1]" 1 36 1 3 ILE QG 1 4 ILE H 4.000 . 6.000 4.214 3.939 4.389 . 0 0 "[ . 1]" 1 37 1 3 ILE QG 1 4 ILE MD 4.000 . 7.000 4.817 4.369 5.000 . 0 0 "[ . 1]" 1 38 1 3 ILE QG 1 17 ILE QG 4.000 . 7.000 3.635 3.185 4.266 . 0 0 "[ . 1]" 1 39 1 3 ILE QG 1 17 ILE MG 4.000 . 7.000 2.271 2.028 2.485 . 0 0 "[ . 1]" 1 40 1 3 ILE QG 1 19 LEU MD2 4.000 . 7.000 3.864 3.331 4.371 . 0 0 "[ . 1]" 1 41 1 3 ILE QG 1 82 PHE H 4.000 . 6.000 4.978 4.493 5.254 . 0 0 "[ . 1]" 1 42 1 3 ILE QG 1 82 PHE HB2 4.000 . 6.000 3.406 2.714 3.911 . 0 0 "[ . 1]" 1 43 1 3 ILE QG 1 82 PHE HB3 4.000 . 6.000 4.074 3.678 4.598 . 0 0 "[ . 1]" 1 44 1 3 ILE QG 1 82 PHE QD 4.000 . 8.000 2.907 2.346 3.449 . 0 0 "[ . 1]" 1 45 1 3 ILE MG 1 4 ILE H 4.000 . 6.000 2.862 2.451 3.268 . 0 0 "[ . 1]" 1 46 1 3 ILE MG 1 4 ILE HA 4.000 . 6.000 3.868 3.663 4.019 . 0 0 "[ . 1]" 1 47 1 3 ILE MG 1 4 ILE QG 4.000 . 7.000 4.700 4.230 5.096 . 0 0 "[ . 1]" 1 48 1 3 ILE MG 1 5 SER H 4.000 . 6.000 3.066 2.309 4.537 . 0 0 "[ . 1]" 1 49 1 3 ILE MG 1 6 ILE H 4.000 . 6.000 4.334 3.765 4.918 . 0 0 "[ . 1]" 1 50 1 3 ILE MG 1 6 ILE QG 4.000 . 7.000 2.813 2.001 4.074 . 0 0 "[ . 1]" 1 51 1 3 ILE MG 1 18 THR H 4.000 . 6.000 3.766 3.070 4.295 . 0 0 "[ . 1]" 1 52 1 3 ILE MD 1 79 GLU HA 4.000 . 6.000 2.764 2.231 3.283 . 0 0 "[ . 1]" 1 53 1 3 ILE MD 1 79 GLU HG2 4.000 . 6.000 4.038 3.171 4.959 . 0 0 "[ . 1]" 1 54 1 3 ILE MD 1 79 GLU HG3 4.000 . 6.000 3.372 2.238 4.227 . 0 0 "[ . 1]" 1 55 1 3 ILE MD 1 82 PHE H 4.000 . 6.000 4.267 3.847 4.496 . 0 0 "[ . 1]" 1 56 1 3 ILE MD 1 82 PHE HB2 4.000 . 6.000 3.440 3.180 3.705 . 0 0 "[ . 1]" 1 57 1 3 ILE MD 1 82 PHE HB3 4.000 . 6.000 4.640 4.404 4.922 . 0 0 "[ . 1]" 1 58 1 3 ILE MD 1 82 PHE QD 4.000 . 8.000 2.313 2.128 2.672 . 0 0 "[ . 1]" 1 59 1 3 ILE MD 1 82 PHE QE 4.000 . 8.000 2.752 2.391 3.148 . 0 0 "[ . 1]" 1 60 1 3 ILE MD 1 82 PHE HZ 4.000 . 6.000 4.664 4.234 4.850 . 0 0 "[ . 1]" 1 61 1 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"[ . 1]" 1 373 1 28 SER HB3 1 55 PHE QE 4.000 . 7.000 5.164 4.414 6.117 . 0 0 "[ . 1]" 1 374 1 28 SER HB2 1 57 VAL HB 4.000 . 5.000 3.177 2.611 4.013 . 0 0 "[ . 1]" 1 375 1 28 SER HB3 1 57 VAL HB 4.000 . 5.000 3.895 2.747 4.724 . 0 0 "[ . 1]" 1 376 1 28 SER HB2 1 57 VAL MG1 4.000 . 6.000 4.567 4.159 4.920 . 0 0 "[ . 1]" 1 377 1 28 SER HB2 1 57 VAL MG2 4.000 . 6.000 2.677 2.247 3.253 . 0 0 "[ . 1]" 1 378 1 28 SER HB3 1 57 VAL MG1 4.000 . 6.000 4.758 4.201 4.964 . 0 0 "[ . 1]" 1 379 1 28 SER HB3 1 57 VAL MG2 4.000 . 6.000 2.417 2.098 3.128 . 0 0 "[ . 1]" 1 380 1 29 ASP H 1 29 ASP HA 3.000 . 3.500 2.895 2.879 2.912 . 0 0 "[ . 1]" 1 381 1 29 ASP H 1 29 ASP HB2 4.000 . 5.000 2.888 2.821 3.034 . 0 0 "[ . 1]" 1 382 1 29 ASP H 1 29 ASP HB3 4.000 . 5.000 3.846 3.788 3.987 . 0 0 "[ . 1]" 1 383 1 29 ASP H 1 56 HIS H 4.000 . 5.000 3.135 2.894 3.234 . 0 0 "[ . 1]" 1 384 1 29 ASP H 1 56 HIS HB2 4.000 . 5.000 3.926 3.302 4.556 . 0 0 "[ . 1]" 1 385 1 29 ASP H 1 56 HIS HB3 4.000 . 5.000 2.269 1.757 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