NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | in_dress | stage | program | type | subtype | subsubtype |
373858 | 1e3y | 4333 | cing | dress | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1e3y save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1023 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 263 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 23.054 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.577 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0553 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0225 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0877 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 4 MET 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 5 GLY 0.120 0.120 1 0 "[ ]" 1 6 GLU 0.492 0.135 1 0 "[ ]" 1 7 GLU 0.400 0.120 1 0 "[ ]" 1 8 ASP 0.468 0.134 1 0 "[ ]" 1 9 LEU 0.450 0.134 1 0 "[ ]" 1 10 CYS 0.284 0.108 1 0 "[ ]" 1 11 ALA 0.611 0.283 1 0 "[ ]" 1 12 ALA 0.213 0.131 1 0 "[ ]" 1 13 PHE 0.351 0.112 1 0 "[ ]" 1 14 ASN 0.207 0.085 1 0 "[ ]" 1 15 VAL 0.494 0.247 1 0 "[ ]" 1 16 ILE 0.477 0.245 1 0 "[ ]" 1 17 CYS 0.580 0.247 1 0 "[ ]" 1 18 ASP 0.243 0.113 1 0 "[ ]" 1 19 ASN 0.940 0.307 1 0 "[ ]" 1 20 VAL 0.563 0.170 1 0 "[ ]" 1 21 GLY 0.221 0.168 1 0 "[ ]" 1 22 LYS 0.338 0.148 1 0 "[ ]" 1 23 ASP 0.322 0.156 1 0 "[ ]" 1 24 TRP 0.572 0.277 1 0 "[ ]" 1 25 ARG 0.405 0.239 1 0 "[ ]" 1 26 ARG 0.562 0.277 1 0 "[ ]" 1 27 LEU 0.230 0.157 1 0 "[ ]" 1 28 ALA 0.267 0.165 1 0 "[ ]" 1 29 ARG 0.381 0.151 1 0 "[ ]" 1 30 GLN 0.789 0.204 1 0 "[ ]" 1 31 LEU 0.231 0.077 1 0 "[ ]" 1 32 LYS 0.086 0.048 1 0 "[ ]" 1 33 VAL 0.404 0.145 1 0 "[ ]" 1 34 SER 0.169 0.145 1 0 "[ ]" 1 35 ASP 0.717 0.577 1 1 [+] 1 36 THR 0.858 0.577 1 1 [+] 1 37 LYS 0.869 0.354 1 0 "[ ]" 1 38 ILE 0.109 0.080 1 0 "[ ]" 1 39 ASP 0.208 0.092 1 0 "[ ]" 1 40 SER 0.710 0.371 1 0 "[ ]" 1 41 ILE 0.789 0.371 1 0 "[ ]" 1 42 GLU 0.599 0.278 1 0 "[ ]" 1 43 ASP 0.346 0.278 1 0 "[ ]" 1 44 ARG 0.277 0.122 1 0 "[ ]" 1 45 TYR 0.175 0.067 1 0 "[ ]" 1 46 PRO 0.108 0.068 1 0 "[ ]" 1 47 ARG 0.068 0.068 1 0 "[ ]" 1 48 ASN 0.214 0.139 1 0 "[ ]" 1 49 LEU 0.467 0.170 1 0 "[ ]" 1 50 THR 0.501 0.115 1 0 "[ ]" 1 51 GLU 0.061 0.031 1 0 "[ ]" 1 52 ARG 0.044 0.034 1 0 "[ ]" 1 53 VAL 0.128 0.070 1 0 "[ ]" 1 54 ARG 0.103 0.097 1 0 "[ ]" 1 55 GLU 0.206 0.130 1 0 "[ ]" 1 56 SER 0.655 0.397 1 0 "[ ]" 1 57 LEU 0.669 0.143 1 0 "[ ]" 1 58 ARG 0.293 0.130 1 0 "[ ]" 1 59 ILE 0.426 0.236 1 0 "[ ]" 1 60 TRP 1.021 0.397 1 0 "[ ]" 1 61 LYS 0.129 0.114 1 0 "[ ]" 1 62 ASN 0.031 0.016 1 0 "[ ]" 1 63 THR 0.253 0.150 1 0 "[ ]" 1 64 GLU 0.503 0.160 1 0 "[ ]" 1 65 LYS 0.397 0.160 1 0 "[ ]" 1 66 GLU 0.283 0.092 1 0 "[ ]" 1 67 ASN 0.191 0.133 1 0 "[ ]" 1 68 ALA 0.458 0.202 1 0 "[ ]" 1 69 THR 0.348 0.202 1 0 "[ ]" 1 70 VAL 0.137 0.065 1 0 "[ ]" 1 71 ALA 0.364 0.160 1 0 "[ ]" 1 72 HIS 0.364 0.224 1 0 "[ ]" 1 73 LEU 0.877 0.248 1 0 "[ ]" 1 74 VAL 0.826 0.160 1 0 "[ ]" 1 75 GLY 0.165 0.161 1 0 "[ ]" 1 76 ALA 0.274 0.138 1 0 "[ ]" 1 77 LEU 0.457 0.265 1 0 "[ ]" 1 78 ARG 0.152 0.049 1 0 "[ ]" 1 79 SER 0.158 0.101 1 0 "[ ]" 1 80 CYS 0.115 0.099 1 0 "[ ]" 1 81 GLN 0.343 0.164 1 0 "[ ]" 1 82 MET 0.342 0.164 1 0 "[ ]" 1 83 ASN 0.109 0.105 1 0 "[ ]" 1 84 LEU 0.567 0.154 1 0 "[ ]" 1 85 VAL 1.017 0.373 1 0 "[ ]" 1 86 ALA 1.048 0.373 1 0 "[ ]" 1 87 ASP 0.168 0.087 1 0 "[ ]" 1 88 LEU 1.126 0.251 1 0 "[ ]" 1 89 VAL 1.208 0.283 1 0 "[ ]" 1 90 GLN 0.260 0.153 1 0 "[ ]" 1 91 GLU 0.057 0.039 1 0 "[ ]" 1 92 VAL 0.684 0.302 1 0 "[ ]" 1 93 GLN 0.539 0.302 1 0 "[ ]" 1 94 GLN 0.234 0.128 1 0 "[ ]" 1 95 ALA 0.074 0.074 1 0 "[ ]" 1 96 ARG 0.186 0.120 1 0 "[ ]" 1 97 ASP 0.164 0.120 1 0 "[ ]" 1 98 LEU 0.192 0.140 1 0 "[ ]" 1 99 GLN 0.318 0.166 1 0 "[ ]" 1 100 ASN 0.185 0.081 1 0 "[ ]" 1 101 ARG 0.018 0.018 1 0 "[ ]" 1 102 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 103 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 4 MET HA 1 5 GLY H 3.500 . 3.500 2.222 2.222 2.222 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 4 MET HA 1 6 GLU H 5.000 . 5.000 3.458 3.458 3.458 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 4 MET QB 1 5 GLY H 5.000 . 5.000 3.848 3.848 3.848 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 5 GLY QA 1 6 GLU H 2.800 . 2.800 2.920 2.920 2.920 0.120 1 0 "[ ]" 1 5 1 5 GLY H 1 5 GLY QA 2.800 . 2.800 2.378 2.378 2.378 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 5 GLY H 1 6 GLU HA 5.000 . 5.000 4.826 4.826 4.826 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 5 GLY H 1 6 GLU H 2.800 . 2.800 2.114 2.114 2.114 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 6 GLU HA 1 6 GLU QG 3.400 . 3.400 3.310 3.310 3.310 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 6 GLU HA 1 7 GLU H 2.800 . 2.800 2.920 2.920 2.920 0.120 1 0 "[ ]" 1 10 1 6 GLU HA 1 9 LEU QB 3.400 . 3.400 3.053 3.053 3.053 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 6 GLU HA 1 9 LEU H 5.000 . 5.000 4.497 4.497 4.497 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 6 GLU HA 1 10 CYS H 5.000 . 5.000 4.898 4.898 4.898 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 6 GLU QG 1 7 GLU H 5.000 . 5.000 3.387 3.387 3.387 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 6 GLU H 1 6 GLU HA 2.800 . 2.800 2.935 2.935 2.935 0.135 1 0 "[ ]" 1 15 1 6 GLU H 1 6 GLU QB 2.800 . 2.800 2.646 2.646 2.646 . 0 0 "[ ]" 1 16 1 6 GLU H 1 6 GLU QG 2.800 . 2.800 1.877 1.877 1.877 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 6 GLU H 1 7 GLU H 2.800 . 2.800 2.918 2.918 2.918 0.118 1 0 "[ ]" 1 18 1 7 GLU HA 1 7 GLU QG 3.400 . 3.400 3.293 3.293 3.293 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 7 GLU HA 1 8 ASP H 2.800 . 2.800 2.301 2.301 2.301 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 7 GLU HA 1 10 CYS QB 3.400 . 3.400 3.216 3.216 3.216 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 7 GLU HA 1 10 CYS H 3.500 . 3.500 3.608 3.608 3.608 0.108 1 0 "[ ]" 1 22 1 7 GLU QB 1 8 ASP H 2.800 . 2.800 2.855 2.855 2.855 0.055 1 0 "[ ]" 1 23 1 7 GLU QG 1 8 ASP H 5.000 . 5.000 3.594 3.594 3.594 . 0 0 "[ ]" 1 24 1 7 GLU H 1 7 GLU QB 2.800 . 2.800 2.216 2.216 2.216 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 7 GLU H 1 7 GLU QG 2.800 . 2.800 2.748 2.748 2.748 . 0 0 "[ ]" 1 26 1 8 ASP HA 1 9 LEU H 3.500 . 3.500 3.575 3.575 3.575 0.075 1 0 "[ ]" 1 27 1 8 ASP HA 1 10 CYS H 5.000 . 5.000 3.916 3.916 3.916 . 0 0 "[ ]" 1 28 1 8 ASP HA 1 11 ALA MB 3.400 . 3.400 3.363 3.363 3.363 . 0 0 "[ ]" 1 29 1 8 ASP HA 1 11 ALA H 3.500 . 3.500 3.585 3.585 3.585 0.085 1 0 "[ ]" 1 30 1 8 ASP QB 1 9 LEU H 3.400 . 3.400 2.809 2.809 2.809 . 0 0 "[ ]" 1 31 1 8 ASP QB 1 70 VAL MG2 3.700 . 3.700 3.732 3.732 3.732 0.032 1 0 "[ ]" 1 32 1 8 ASP H 1 8 ASP QB 2.800 . 2.800 2.886 2.886 2.886 0.086 1 0 "[ ]" 1 33 1 8 ASP H 1 9 LEU H 3.500 . 3.500 3.634 3.634 3.634 0.134 1 0 "[ ]" 1 34 1 8 ASP H 1 10 CYS H 5.000 . 5.000 3.434 3.434 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