NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | in_recoord | stage | program | type | subtype | subsubtype |
372500 | 1d8v | 4522 | cing | recoord | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1d8v save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 25 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 2 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 0.137 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.084 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0197 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0055 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0686 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 24 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 32 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 33 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 69 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 70 TYR 0.053 0.053 1 0 "[ ]" 1 77 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 85 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 109 TYR 0.084 0.084 1 0 "[ ]" 1 117 HIS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 158 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 161 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 204 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 205 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 218 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 248 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 249 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 253 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 24 THR H 1 24 THR HA 2.500 . 2.900 2.840 2.840 2.840 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 32 TYR H 1 32 TYR HA 2.500 . 2.900 2.353 2.353 2.353 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 33 ASP H 1 33 ASP HA 2.500 . 2.900 2.340 2.340 2.340 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 57 TYR H 1 57 TYR HA 2.500 . 2.900 2.339 2.339 2.339 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 69 VAL H 1 69 VAL HA 2.500 . 2.900 2.370 2.370 2.370 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 77 ARG H 1 77 ARG HA 2.500 . 2.900 2.366 2.366 2.366 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 85 GLU H 1 85 GLU HA 2.500 . 2.900 2.333 2.333 2.333 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 117 HIS H 1 117 HIS HA 2.500 . 2.900 2.354 2.354 2.354 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 204 GLY H 1 204 GLY QA 2.500 . 3.900 2.256 2.256 2.256 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 205 GLY H 1 205 GLY QA 2.500 . 3.900 2.395 2.395 2.395 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 218 GLY H 1 218 GLY QA 2.500 . 3.900 2.417 2.417 2.417 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 248 GLU H 1 248 GLU HA 2.500 . 2.900 2.894 2.894 2.894 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 249 ASN H 1 249 ASN HA 2.500 . 2.900 2.346 2.346 2.346 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 253 THR H 1 253 THR HA 2.500 . 2.900 2.345 2.345 2.345 . 0 0 "[ ]" 1 15 1 70 TYR H 1 70 TYR HB3 2.500 . 2.900 2.953 2.953 2.953 0.053 1 0 "[ ]" 1 16 1 70 TYR H 1 70 TYR HB2 4.000 . 5.000 3.837 3.837 3.837 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 70 TYR H 1 70 TYR QD 3.000 . 5.700 2.194 2.194 2.194 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 109 TYR H 1 109 TYR QB 3.000 . 4.500 2.353 2.353 2.353 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 109 TYR H 1 109 TYR QD 4.000 . 7.700 2.154 2.154 2.154 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 109 TYR H 1 109 TYR HB3 3.000 . 3.500 3.584 3.584 3.584 0.084 1 0 "[ ]" 1 21 1 109 TYR H 1 109 TYR HB2 4.000 . 5.000 2.386 2.386 2.386 . 0 0 "[ ]" 1 22 1 158 GLU H 1 158 GLU HG3 4.000 . 5.000 3.615 3.615 3.615 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 158 GLU H 1 158 GLU HG2 4.000 . 5.000 2.196 2.196 2.196 . 0 0 "[ ]" 1 24 1 161 ARG H 1 161 ARG QB 3.000 . 3.500 2.407 2.407 2.407 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 161 ARG H 1 161 ARG QG 3.000 . 3.500 2.257 2.257 2.257 . 0 0 "[ ]" 1 stop_ save_ save_distance_constraint_statistics_2 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 2 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 3012 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 44 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 2.767 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.271 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0101 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0009 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0629 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details . loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 1 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 2 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 3 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 4 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 5 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 6 LEU 0.109 0.109 1 0 "[ ]" 1 7 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 8 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 9 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 10 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 11 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 12 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 13 THR 0.051 0.051 1 0 "[ ]" 1 14 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 15 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 16 LYS 0.051 0.051 1 0 "[ ]" 1 17 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 18 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 19 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 20 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 21 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 22 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 23 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 24 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 25 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 26 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 27 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 28 SER 0.031 0.031 1 0 "[ ]" 1 29 HIS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 30 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 31 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 32 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 33 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 34 ILE 0.151 0.151 1 0 "[ ]" 1 35 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 36 LEU 0.013 0.013 1 0 "[ ]" 1 37 LEU 0.031 0.031 1 0 "[ ]" 1 38 TYR 0.013 0.013 1 0 "[ ]" 1 39 SER 0.055 0.055 1 0 "[ ]" 1 40 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 41 ILE 0.069 0.069 1 0 "[ ]" 1 42 SER 0.133 0.133 1 0 "[ ]" 1 43 ASP 0.133 0.133 1 0 "[ ]" 1 44 SER 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 45 ARG 0.081 0.069 1 0 "[ ]" 1 46 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 47 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 48 ILE 0.010 0.010 1 0 "[ ]" 1 49 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 50 LEU 0.010 0.010 1 0 "[ ]" 1 51 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 52 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 53 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 54 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 55 TYR 0.109 0.109 1 0 "[ ]" 1 56 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 58 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 59 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 60 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 61 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 62 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 63 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 64 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 65 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 66 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 67 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 68 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 69 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 70 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 71 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 72 VAL 0.122 0.122 1 0 "[ ]" 1 73 ALA 0.122 0.122 1 0 "[ ]" 1 74 TYR 0.168 0.168 1 0 "[ ]" 1 75 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 76 THR 0.060 0.060 1 0 "[ ]" 1 77 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 78 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 79 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 80 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 81 TYR 0.168 0.168 1 0 "[ ]" 1 82 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 83 PHE 0.034 0.034 1 0 "[ ]" 1 84 LYS 0.079 0.045 1 0 "[ ]" 1 85 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 86 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 87 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 88 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 89 GLU 0.173 0.173 1 0 "[ ]" 1 90 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 91 TYR 0.067 0.067 1 0 "[ ]" 1 92 ASN 0.173 0.173 1 0 "[ ]" 1 93 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 94 LEU 0.107 0.067 1 0 "[ ]" 1 95 PHE 0.006 0.006 1 0 "[ ]" 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