NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype | item_count |
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36099 |
1mxk   |
cing | 2-parsed | STAR | distance | NOE | ambi | 418 |
data_1mxk_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1mxk
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1mxk 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1mxk
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1mxk "Master copy" parsed_1mxk
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1mxk
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1mxk.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1mxk 1
1 1mxk.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE ambi 418 parsed_1mxk 1
1 1mxk.mr . . "MR format" 3 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1mxk 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1mxk
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1mxk 1
2 1 . . . parsed_1mxk 1
3 1 . . . parsed_1mxk 1
4 1 . . . parsed_1mxk 1
5 1 . . . parsed_1mxk 1
6 1 . . . parsed_1mxk 1
7 1 . . . parsed_1mxk 1
8 1 . . . parsed_1mxk 1
9 1 . . . parsed_1mxk 1
10 1 . . . parsed_1mxk 1
11 1 . . . parsed_1mxk 1
12 1 . . . parsed_1mxk 1
13 1 . . . parsed_1mxk 1
14 1 . . . parsed_1mxk 1
15 1 . . . parsed_1mxk 1
16 1 . . . parsed_1mxk 1
17 1 . . . parsed_1mxk 1
18 1 . . . parsed_1mxk 1
19 1 . . . parsed_1mxk 1
20 1 . . . parsed_1mxk 1
21 1 . . . parsed_1mxk 1
22 1 . . . parsed_1mxk 1
23 1 . . . parsed_1mxk 1
24 1 . . . parsed_1mxk 1
25 1 . . . parsed_1mxk 1
26 1 . . . parsed_1mxk 1
27 1 . . . parsed_1mxk 1
28 1 . . . parsed_1mxk 1
29 1 . . . parsed_1mxk 1
30 1 . . . parsed_1mxk 1
31 1 . . . parsed_1mxk 1
32 1 . . . parsed_1mxk 1
33 1 . . . parsed_1mxk 1
34 1 . . . parsed_1mxk 1
35 1 . . . parsed_1mxk 1
36 1 . . . parsed_1mxk 1
37 1 . . . parsed_1mxk 1
38 1 . . . parsed_1mxk 1
39 1 . . . parsed_1mxk 1
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41 1 . . . parsed_1mxk 1
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43 1 . . . parsed_1mxk 1
44 1 . . . parsed_1mxk 1
45 1 . . . parsed_1mxk 1
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49 1 . . . parsed_1mxk 1
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51 1 . . . parsed_1mxk 1
52 1 . . . parsed_1mxk 1
53 1 . . . parsed_1mxk 1
54 1 . . . parsed_1mxk 1
55 1 . . . parsed_1mxk 1
56 1 . . . parsed_1mxk 1
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58 1 . . . parsed_1mxk 1
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63 1 . . . parsed_1mxk 1
64 1 . . . parsed_1mxk 1
65 1 . . . parsed_1mxk 1
66 1 . . . parsed_1mxk 1
67 1 . . . parsed_1mxk 1
68 1 . . . parsed_1mxk 1
69 1 . . . parsed_1mxk 1
70 1 . . . parsed_1mxk 1
71 1 . . . parsed_1mxk 1
72 1 . . . parsed_1mxk 1
73 1 . . . parsed_1mxk 1
74 1 . . . parsed_1mxk 1
75 1 . . . parsed_1mxk 1
76 1 . . . parsed_1mxk 1
77 1 . . . parsed_1mxk 1
78 1 . . . parsed_1mxk 1
79 1 . . . parsed_1mxk 1
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81 1 . . . parsed_1mxk 1
82 1 . . . parsed_1mxk 1
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84 1 . . . parsed_1mxk 1
85 1 . . . parsed_1mxk 1
86 1 . . . parsed_1mxk 1
87 1 . . . parsed_1mxk 1
88 1 . . . parsed_1mxk 1
89 1 . . . parsed_1mxk 1
90 1 . . . parsed_1mxk 1
91 1 . . . parsed_1mxk 1
92 1 . . . parsed_1mxk 1
93 1 . . . parsed_1mxk 1
94 1 . . . parsed_1mxk 1
95 1 . . . parsed_1mxk 1
96 1 . . . parsed_1mxk 1
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98 1 . . . parsed_1mxk 1
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101 1 . . . parsed_1mxk 1
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109 1 . . . parsed_1mxk 1
110 1 . . . parsed_1mxk 1
111 1 . . . parsed_1mxk 1
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115 1 . . . parsed_1mxk 1
116 1 . . . parsed_1mxk 1
117 1 . . . parsed_1mxk 1
118 1 . . . parsed_1mxk 1
119 1 . . . parsed_1mxk 1
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121 1 . . . parsed_1mxk 1
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131 1 . . . parsed_1mxk 1
132 1 . . . parsed_1mxk 1
133 1 . . . parsed_1mxk 1
134 1 . . . parsed_1mxk 1
135 1 . . . parsed_1mxk 1
136 1 . . . parsed_1mxk 1
137 1 . . . parsed_1mxk 1
138 1 . . . parsed_1mxk 1
139 1 . . . parsed_1mxk 1
140 1 . . . parsed_1mxk 1
141 1 . . . parsed_1mxk 1
142 1 . . . parsed_1mxk 1
143 1 . . . parsed_1mxk 1
144 1 . . . parsed_1mxk 1
145 1 . . . parsed_1mxk 1
146 1 . . . parsed_1mxk 1
147 1 . . . parsed_1mxk 1
148 1 . . . parsed_1mxk 1
149 1 . . . parsed_1mxk 1
150 1 . . . parsed_1mxk 1
151 1 . . . parsed_1mxk 1
152 1 . . . parsed_1mxk 1
153 1 . . . parsed_1mxk 1
154 1 . . . parsed_1mxk 1
155 1 . . . parsed_1mxk 1
156 1 . . . parsed_1mxk 1
157 1 . . . parsed_1mxk 1
158 1 . . . parsed_1mxk 1
159 1 . . . parsed_1mxk 1
160 1 . . . parsed_1mxk 1
161 1 . . . parsed_1mxk 1
162 1 . . . parsed_1mxk 1
163 1 . . . parsed_1mxk 1
164 1 . . . parsed_1mxk 1
165 1 . . . parsed_1mxk 1
166 1 . . . parsed_1mxk 1
167 1 . . . parsed_1mxk 1
168 1 . . . parsed_1mxk 1
169 1 . . . parsed_1mxk 1
170 1 . . . parsed_1mxk 1
171 1 . . . parsed_1mxk 1
172 1 . . . parsed_1mxk 1
173 1 . . . parsed_1mxk 1
174 1 . . . parsed_1mxk 1
175 1 . . . parsed_1mxk 1
176 1 . . . parsed_1mxk 1
177 1 . . . parsed_1mxk 1
178 1 . . . parsed_1mxk 1
179 1 . . . parsed_1mxk 1
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181 1 . . . parsed_1mxk 1
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187 1 . . . parsed_1mxk 1
188 1 . . . parsed_1mxk 1
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191 1 . . . parsed_1mxk 1
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254 1 . . . parsed_1mxk 1
255 1 . . . parsed_1mxk 1
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288 1 . . . parsed_1mxk 1
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345 1 . . . parsed_1mxk 1
346 1 . . . parsed_1mxk 1
347 1 . . . parsed_1mxk 1
348 1 . . . parsed_1mxk 1
349 1 . . . parsed_1mxk 1
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351 1 . . . parsed_1mxk 1
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353 1 . . . parsed_1mxk 1
354 1 . . . parsed_1mxk 1
355 1 . . . parsed_1mxk 1
356 1 . . . parsed_1mxk 1
357 1 . . . parsed_1mxk 1
358 1 . . . parsed_1mxk 1
359 1 . . . parsed_1mxk 1
360 1 . . . parsed_1mxk 1
361 1 . . . parsed_1mxk 1
362 1 . . . parsed_1mxk 1
363 1 . . . parsed_1mxk 1
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365 1 . . . parsed_1mxk 1
366 1 . . . parsed_1mxk 1
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368 1 . . . parsed_1mxk 1
369 1 . . . parsed_1mxk 1
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stop_
loop_
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410 1 . . . . . 2.4 1.8 3.0 parsed_1mxk 1
411 1 . . . . . 3.0 1.8 4.0 parsed_1mxk 1
412 1 . . . . . 2.4 1.8 3.0 parsed_1mxk 1
413 1 . . . . . 3.0 2.5 4.0 parsed_1mxk 1
414 1 . . . . . 2.4 1.8 3.0 parsed_1mxk 1
415 1 . . . . . 4.0 3.5 5.5 parsed_1mxk 1
416 1 . . . . . 2.4 1.8 3.0 parsed_1mxk 1
417 1 . . . . . 2.4 1.8 3.0 parsed_1mxk 1
418 1 . . . . . 3.0 2.5 4.0 parsed_1mxk 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1
;
!FI bleomycin intramolecular NOEs
for distances calculated using H5-H6 as reference
errors: r <= 3 A lower bound 1.8A upper bound 1.1d
errors: 3 A < r <= 3.5A lower bound 1.8A upper bound 1.2d
errors: 3.5 A < r <= 4.5 A lower bound 1.8A upper bound 1.3d
errors: r > 4.5 A lower bound 1.8A upper bound 1.4d
for distances calculated using H5-MH as reference
errors : r <= 3 A lower bound 1.8A upper bound 1.1d + 0.5 A
errors: 3 A < r <= 3.5A lower bound 1.8A upper bound 1.2d + 0.5 A
errors: 3.5 A < r <= 4.5 A lower bound 1.8A upper bound 1.3d + 0.5 A
errors: r > 4.5 A lower bound 1.8A upper bound 1.4d + 0.5 A
for distances of labile proton mutiply by 1.2 to its upper bound
;
1 1 12 66 parsed_1mxk 1
2
;
assign (resid 21 and name H28 )(resid 21 and name HN8B) 4.0 2.2 1.0
assign (resid 21 and name H28 )(resid 21 and name HN3 ) 4.0 2.2 1.0
;
29 1 30 69 parsed_1mxk 1
3 "assign (resid 21 and name H32*)(resid 21 and name H2 ) 4.0 2.2 1.5" 47 1 47 69 parsed_1mxk 1
4 "assign (resid 21 and name H28 )(resid 21 and name HN8A) 4.0 2.2 1.0" 60 1 60 69 parsed_1mxk 1
5 "! DNA Contacts" 112 1 112 16 parsed_1mxk 1
6 ... 142 1 142 6 parsed_1mxk 1
7 "interresidue noes for f1_10_noe ggaagcttcc" 143 1 143 51 parsed_1mxk 1
8
;
intrastrand NOEs
for distances calculated using H5-H6 as reference
for distances calculated using H5-MH as reference
;
145 1 147 51 parsed_1mxk 1
9
;
NOE classification:
!strong=1.8-2.7 2.4 0.6 0.6
!medium=1.8-4.0 3.0 1.2 1.0
!weak= 1.8-5.0 4.0 2.2 1.0
0.5 A added to upper limits of distances involving methyl groups
;
148 1 152 73 parsed_1mxk 1
10
;
H1'-H2" 20 distances
strand 1
;
155 1 156 10 parsed_1mxk 1
11 "strand 2" 168 1 168 10 parsed_1mxk 1
12
;
h1'-H2': 20 distances:
strand 1
;
181 1 182 10 parsed_1mxk 1
13 "strand 2" 194 1 194 10 parsed_1mxk 1
14
;
h1'-h3'
strand 1
;
207 1 208 10 parsed_1mxk 1
15 "strand 2" 221 1 221 10 parsed_1mxk 1
16 "h1' - h4'" 234 1 234 11 parsed_1mxk 1
17
;
h1'-H6/H8 20 distances
strand 1
;
251 1 252 10 parsed_1mxk 1
18 "strand 2" 264 1 264 10 parsed_1mxk 1
19
;
h3'-H6/H8 20 distances
strand 1
;
277 1 278 10 parsed_1mxk 1
20 "strand 2" 290 1 290 10 parsed_1mxk 1
21
;
h4'-h6/h8
strand 1
;
303 1 305 10 parsed_1mxk 1
22 "strand 2" 318 1 318 10 parsed_1mxk 1
23 "assign (resid 15 and name h4') (resid 15 and name h8) 4.0 0.5 1.0" 323 1 323 67 parsed_1mxk 1
24
;
h2'-H8/h6 : 20 distances
strand 1
;
331 1 332 10 parsed_1mxk 1
25 "strand 2" 344 1 344 10 parsed_1mxk 1
26 "h2'' - h8/h6" 358 1 358 14 parsed_1mxk 1
27 "h2' - h2''" 380 1 380 13 parsed_1mxk 1
28
;
h2'-H3' 12 distances
strand 1
;
387 1 390 10 parsed_1mxk 1
29 "strand 2" 401 1 401 10 parsed_1mxk 1
30
;
H2''-h3' 6 distances
strand 1
;
410 1 411 10 parsed_1mxk 1
31 "strand 2" 419 1 419 10 parsed_1mxk 1
32 "h3' - h4'" 424 1 424 11 parsed_1mxk 1
33 "H6/H8 - MH 4 distances" 440 1 440 24 parsed_1mxk 1
34 "assign (resid 17 and name h6) (resid 17 and name h5#) 3.0 0.5 1.5" 443 1 443 67 parsed_1mxk 1
35 "H6 - H5" 446 1 446 9 parsed_1mxk 1
36 "h6/h8(i) - h6/h8(i+1)" 454 1 454 23 parsed_1mxk 1
37 "assign (resid 6 and name h6) (resid 7 and name h6 ) 4.0 0.5 1.0" 457 1 457 67 parsed_1mxk 1
38
;
h1'(i)-H8/H6(i+1) 15 distances
strand 1
;
462 1 463 10 parsed_1mxk 1
39 "strand 2" 471 1 471 10 parsed_1mxk 1
40 "assign (resid 14 and name h1') (resid 15 and name h8) 4.0 0.5 1.0" 475 1 475 68 parsed_1mxk 1
41 h1'(i)-h5(i+1) 482 1 482 16 parsed_1mxk 1
42
;
h2'(i)-h6/h8(i+1) 8 distances
strand 1
;
485 1 486 10 parsed_1mxk 1
43 "strand 2" 495 1 495 10 parsed_1mxk 1
44
;
H2''(i)-H8/h6(i+1) 4 distances
strand 1
;
499 1 500 10 parsed_1mxk 1
45 "strand 2" 505 1 505 10 parsed_1mxk 1
46 "h3'(i) - h8/h6(i+1)" 512 1 512 21 parsed_1mxk 1
47 "h2'(i) - MH(i+1)" 530 1 530 18 parsed_1mxk 1
48 "h2''(i) - MH(i+1)" 536 1 536 19 parsed_1mxk 1
49 "h5(i) - MH(i+1)" 543 1 546 17 parsed_1mxk 1
50 "H6/H8(i), MH(i+1)" 550 1 550 19 parsed_1mxk 1
51 "H6/H8(i), H5(i+1)" 557 1 557 19 parsed_1mxk 1
52 "labile protons" 564 1 564 16 parsed_1mxk 1
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save_
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