NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
639789 |
6gzk   |
26842 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 2580 |
data_6gzk_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_6gzk
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_6gzk 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_6gzk
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 6gzk "Master copy" parsed_6gzk
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_6gzk
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 6gzk.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6gzk 1
1 6gzk.mr . . DYANA/DIANA 2 distance "hydrogen bond" simple 489 parsed_6gzk 1
1 6gzk.mr . . DYANA/DIANA 3 distance NOE simple 1495 parsed_6gzk 1
1 6gzk.mr . . DYANA/DIANA 4 distance "hydrogen bond" simple 240 parsed_6gzk 1
1 6gzk.mr . . DYANA/DIANA 5 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 356 parsed_6gzk 1
1 6gzk.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6gzk 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_6gzk
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA 04-JUL-18 6GZK
*TITLE SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE TETRAMETHYLRHODAMINE (TMR) APTAMER 3 IN
*TITLE 2 COMPLEX WITH 5-TAMRA
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: TMR3 (48-MER);
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: SYNTHETIC CONSTRUCT;
*SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 32630;
*SOURCE 4 EXPRESSION_SYSTEM: IN VITRO TRANSCRIPTION VECTOR PT7-TP(DELTAI);
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 905931
*KEYWDS RNA APTAMER, RNA-LIGAND COMPLEX, THREE-WAY JUNCTION, RNA
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 10
*AUTHOR E.DUCHARDT-FERNER,O.OHLENSCHLAGER,C.R.KREUTZ,J.WOHNERT
*REVDAT 1 17-JUL-19 6GZK 0
;
save_
save_DYANA/DIANA_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6gzk
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_6gzk 1
2 1 . . . parsed_6gzk 1
3 1 . . . parsed_6gzk 1
4 1 . . . parsed_6gzk 1
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11 1 . . . parsed_6gzk 1
12 1 . . . parsed_6gzk 1
13 1 . . . parsed_6gzk 1
14 1 . . . parsed_6gzk 1
15 1 . . . parsed_6gzk 1
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18 1 . . . parsed_6gzk 1
19 1 . . . parsed_6gzk 1
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21 1 . . . parsed_6gzk 1
22 1 . . . parsed_6gzk 1
23 1 . . . parsed_6gzk 1
24 1 . . . parsed_6gzk 1
25 1 . . . parsed_6gzk 1
26 1 . . . parsed_6gzk 1
27 1 . . . parsed_6gzk 1
28 1 . . . parsed_6gzk 1
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131 1 . . . parsed_6gzk 1
132 1 . . . parsed_6gzk 1
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stop_
loop_
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_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
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_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
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26 ALPHA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -90.0 -50.0 . . 19 G . . . . . . . . . . . . . parsed_6gzk 1
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132 NU2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35.0 41.0 . . 10 A . . . . . . . . . . . . . parsed_6gzk 1
133 NU1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -34.0 -14.0 . . 10 A . . . . . . . . . . . . . parsed_6gzk 1
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237 BETA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130.0 170.0 . . 48 C . . . . . . . . . . . . . parsed_6gzk 1
238 GAMMA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40.0 80.0 . . 2 G . . . . . . . . . . . . . parsed_6gzk 1
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