NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
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636372 |
6d37   |
30453 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 269 |
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1 "Conversion project" NMR . parsed_6d37 1
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_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_6d37
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
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_Entry.Origination .
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_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
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_Related_entries.Entry_ID
PDB 6d37 "Master copy" parsed_6d37
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1 6d37.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 269 parsed_6d37 1
1 6d37.mr . . "MR format" 3 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6d37 1
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_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER DE NOVO PROTEIN 14-APR-18 6D37
*TITLE TRP-CAGE TR16B R16NVA : ELIMINATION OF PH DEPENDENT INTERACTIONS
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: ALA-TYR-ALA-GLN-TRP-LEU-ALA-ASP-DAL-GLY-PRO-ALA-SER-DAL-
*COMPND 3 NVA-PRO-PRO-PRO-SER;
*COMPND 4 CHAIN: A;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES;
*SOURCE 3 ORGANISM_SCIENTIFIC: SYNTHETIC CONSTRUCT;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 32630
*KEYWDS MINIPROTEIN, DE NOVO PROTEIN, TRP-CAGE, CIRCULAR PERMUTANT,
*KEYWDS 2 MICROPROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 32
*AUTHOR A.BYRNE,N.H.ANDERSEN
*REVDAT 1 13-MAR-19 6D37 0
;
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save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6d37
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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148 1 2 . . . . . . . . . 10 . ha2 parsed_6d37 1
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153 1 2 . . . . . . . . . 5 . hz3 parsed_6d37 1
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stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
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_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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245 1 . . . . . 4.32 3.46 5.44 parsed_6d37 1
246 1 . . . . . 3.92 3.20 4.59 parsed_6d37 1
247 1 . . . . . 4.09 3.31 5.06 parsed_6d37 1
248 1 . . . . . 3.11 2.64 3.48 parsed_6d37 1
249 1 . . . . . 3.61 2.98 4.35 parsed_6d37 1
250 1 . . . . . 5.25 4.25 6.25 parsed_6d37 1
251 1 . . . . . 3.91 3.29 4.55 parsed_6d37 1
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stop_
loop_
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1
;
Date: Tue Sep 20 15:33:57 PDT 2011
title /home1/dvgloyd/Desktop/test.tbl
DISTINT version 0.8alpha
TABLE OF INTERPROTON DISTANCES
Values are: d, d-, d+
For the Eq.: d=A*(int.)^B, A=14, B=-0.25
For the Eq.: d+=Ae^(Bd), A=0.0384, B=0.7317
For the Eq.: d-=Ad+B, A=0.3167, B=-0.5167
(G) Geminal nOes are commented out.
(Q) Restraints with unassigned residues are commented out.
(A) Proton label not recognized during Precanced Mode processing.
(Ss=0.2 Se=0.4) Sharp aromatic corrections for (s)pecific hydrogens or rotationally (e)quivalent hydrogens.
(C2=1.04) Corrected for the contribution of 2 coincident methylene proton to the nOe.
(C3=1.2) Corrected for the contribution of 3 coincident methyl protons to the nOe.
(Cm=1.3) Corrected for the contribution of 2 coincident methyl groups to the nOe.
(W2=0.2) Corrected for methylene proton not being stereospecifically assigned. (* replaced with #)
(W3=0.4) Corrected for methyl group not being stereospecifically assigned. (* replaced with #)
;
2 1 18 104 parsed_6d37 1
2
;
echo = false
wrnlev = 0
;
20 1 21 22 parsed_6d37 1
3
;
atom1 atom2 d d- d+ # ppm1 ppm2 intens. codes
Start Here
;
23 1 24 15 parsed_6d37 1
4 "136 0.75 8.31 1023.69" 25 82 25 107 parsed_6d37 1
5 "133 3.07 8.30 412.38" 26 82 26 106 parsed_6d37 1
6 "135 0.75 7.18 97.1382 Ss" 27 82 27 110 parsed_6d37 1
7 "134 0.74 7.22 87.4098 Ss" 28 82 28 110 parsed_6d37 1
8 "137 8.32 7.79 104.493" 29 82 29 107 parsed_6d37 1
9 "149 3.45 3.07 226.582" 30 82 30 107 parsed_6d37 1
10 "154 3.75 3.07 169.635" 31 82 31 107 parsed_6d37 1
11
;
150 3.46 0.75 108.141
assign (resid 11 and name hg# ) (resid 11 and name hb2 ) 2.24 0.28 0.30 ! 160 2.19 2.05 1534.24
assign (resid 11 and name hd1 ) (resid 11 and name hg# ) 2.63 0.32 0.26 ! 151 3.46 2.19 797.856
;
32 82 34 108 parsed_6d37 1
12
;
139 4.62 2.54 460.505
assign (resid 11 and name ha ) (resid 11 and name hg# ) 3.08 0.46 0.36 ! 141 4.62 2.19 429.425
assign (resid 11 and name hd2 ) (resid 11 and name hg# ) 2.64 0.48 0.38 ! 156 3.75 2.19 396.452
;
35 82 37 108 parsed_6d37 1
13 "140 4.62 2.04 228.454" 38 82 38 107 parsed_6d37 1
14 "157 3.75 7.35 296.82" 39 81 39 105 parsed_6d37 1
15 "142 4.62 7.35 215.932" 40 82 40 107 parsed_6d37 1
16 "146 2.04 7.35 206.232" 41 82 41 107 parsed_6d37 1
17 "161 2.20 7.36 143.289" 42 82 42 107 parsed_6d37 1
18 "152 3.45 7.35 127.383" 43 82 43 107 parsed_6d37 1
19 "143 4.62 8.09 123.729" 44 82 44 107 parsed_6d37 1
20 "148 3.45 7.21 453.888 Ss" 45 82 45 110 parsed_6d37 1
21 "138 4.62 7.19 404.465 Ss" 46 82 46 110 parsed_6d37 1
22 "147 3.45 7.22 369.981 Ss" 47 82 47 110 parsed_6d37 1
23 "159 2.19 7.19 295.484 Ss" 48 82 48 110 parsed_6d37 1
24 "158 2.19 7.22 263.353 Ss" 49 82 49 110 parsed_6d37 1
25 "144 2.54 7.18 150.781 Ss" 50 82 50 110 parsed_6d37 1
26
;
153 3.76 7.21 125.208 Ss
assign (resid 12 and name ha ) (resid 12 and name hb# ) 2.61 0.21 0.23 ! 162 4.23 1.42 1725.58 C3
;
51 82 52 111 parsed_6d37 1
27 "163 4.23 7.35 793.97" 53 82 53 106 parsed_6d37 1
28 "167 1.42 7.35 1217.25 C3" 54 82 54 110 parsed_6d37 1
29 "169 7.35 8.09 1378.1" 55 82 55 106 parsed_6d37 1
30 "164 4.23 3.57 423.981" 56 82 56 107 parsed_6d37 1
31 "168 1.42 8.09 355.275 C3" 57 82 57 110 parsed_6d37 1
32 "165 4.22 8.10 156.51" 58 82 58 106 parsed_6d37 1
33
;
166 4.23 7.33 267.075
assign (resid 13 and name ha ) (resid 13 and name hb2 ) 2.42 0.25 0.23 ! 171 4.17 3.92 1111.83
assign (resid 13 and name ha ) (resid 13 and name hb1 ) 2.64 0.32 0.27 ! 170 4.17 3.56 787.559
;
59 82 61 108 parsed_6d37 1
34 "174 3.57 8.09 544.376" 62 82 62 107 parsed_6d37 1
35 "172 4.17 8.10 446.964" 63 82 63 107 parsed_6d37 1
36 "176 3.91 8.09 161.974" 64 82 64 107 parsed_6d37 1
37 "173 4.16 7.33 158.936" 65 82 65 107 parsed_6d37 1
38 "181 7.33 8.09 922.198" 66 82 66 107 parsed_6d37 1
39 "178 4.43 7.33 501.351" 67 82 67 107 parsed_6d37 1
40
;
180 1.50 7.33 960.615 C3
assign (resid 14 and name ha ) (resid 14 and name hb# ) 2.54 0.29 0.25 ! 177 4.42 1.51 753.876 C3
;
68 82 69 111 parsed_6d37 1
41 "182 7.34 8.07 863.268" 70 82 70 107 parsed_6d37 1
42 "179 4.43 8.07 239.799" 71 82 71 107 parsed_6d37 1
43 "189 1.77 8.07 451.539" 72 82 72 107 parsed_6d37 1
44 "184 4.83 8.07 246.774" 73 82 73 107 parsed_6d37 1
45 "192 1.42 8.07 140.77" 74 82 74 106 parsed_6d37 1
46 "191 1.87 8.07 135.062" 75 82 75 107 parsed_6d37 1
47 "193 1.47 8.07 116.094" 76 82 76 107 parsed_6d37 1
48 "185 4.84 3.85 974.376" 77 82 77 107 parsed_6d37 1
49 "186 4.84 3.69 720.29" 78 82 78 106 parsed_6d37 1
50 "187 1.77 7.09 380.801 Ss" 79 82 79 110 parsed_6d37 1
51
;
188 1.77 9.59 315.006 Ss
assign (resid 15 and name hb* ) (resid 5 and name hd1 ) 3.56 0.61 0.72 ! 190 1.85 7.09 240.213 Ss
;
80 82 81 111 parsed_6d37 1
52 "194 8.09 9.60 170.021 Ss" 82 82 82 110 parsed_6d37 1
53
;
183 4.83 9.59 117.768 Ss
assign (resid 16 and name hb1 ) (resid 15 and name hb* ) 2.82 0.38 0.30 ! 201 2.13 1.77 604.801
;
83 82 84 108 parsed_6d37 1
54 "208 3.70 1.88 196.39" 85 82 85 106 parsed_6d37 1
55
;
207 3.70 1.76 161.55
assign (resid 16 and name hb1 ) (resid 16 and name hg# ) 2.36 0.23 0.22 ! 202 2.13 1.99 1241.43
assign (resid 16 and name ha ) (resid 16 and name hb1 ) 2.58 0.43 0.34 ! 197 4.58 2.13 486.146
assign (resid 16 and name hd1 ) (resid 16 and name hg# ) 2.97 0.49 0.39 ! 206 3.85 1.99 378.55
assign (resid 16 and name ha ) (resid 16 and name hb2 ) 2.82 0.27 0.33 ! 198 4.58 1.75 279.647
assign (resid 16 and name hd2 ) (resid 16 and name hg# ) 2.54 0.29 0.25 ! 209 3.70 1.99 269.108
assign (resid 16 and name ha ) (resid 16 and name hg# ) 3.61 0.63 0.54 ! 199 4.58 1.99 225.904
assign (resid 16 and name hb1 ) (resid 17 and name hg# ) 2.30 0.21 0.21 ! 204 2.13 1.74 1370.56
assign (resid 16 and name ha ) (resid 17 and name hd# ) 2.35 0.23 0.22 ! 200 4.59 3.48 1249.36
assign (resid 16 and name hg# ) (resid 17 and name hg# ) 3.00 0.43 0.34 ! 210 1.99 1.73 476.284
;
86 82 95 108 parsed_6d37 1
56 "203 2.12 3.47 136.065" 96 82 96 107 parsed_6d37 1
57 "196 4.59 7.19 119.808 Ss" 97 82 97 110 parsed_6d37 1
58
;
195 4.59 9.59 119.152 Ss
assign (resid 17 and name hd# ) (resid 17 and name hg# ) 2.83 0.44 0.35 ! 226 3.48 1.68 454.065
assign (resid 17 and name hd# ) (resid 17 and name hg# ) 2.81 0.46 0.37 ! 225 3.48 1.73 418.341
;
98 82 100 108 parsed_6d37 1
59 "215 2.56 0.44 320.218" 101 82 101 107 parsed_6d37 1
60
;
216 2.56 1.33 209.867
assign (resid 17 and name hg# ) (resid 17 and name hb1 ) 2.92 0.41 0.53 ! 228 1.68 0.45 143.795
;
102 82 103 108 parsed_6d37 1
61 "219 1.31 6.82 170.495 Se Ca" 104 82 104 113 parsed_6d37 1
62
;
217 0.45 6.81 132.449 Se Ca
assign (resid 17 and name hd# ) (resid 5 and name hz2 ) 2.92 0.41 0.53 ! 224 3.47 7.19 527.867 Ss
;
105 82 106 111 parsed_6d37 1
63 "222 3.48 7.18 441.682 Ss" 107 82 107 110 parsed_6d37 1
64 "221 3.48 7.22 259.563 Ss" 108 82 108 110 parsed_6d37 1
65 "211 2.55 7.09 225.415 Ss" 109 82 109 110 parsed_6d37 1
66 "212 2.56 9.59 215.337 Ss" 110 82 110 110 parsed_6d37 1
67 "223 3.47 7.10 169.007 Ss" 111 82 111 110 parsed_6d37 1
68 "214 2.56 7.19 138.436 Ss" 112 82 112 110 parsed_6d37 1
69 "227 1.68 7.18 111.63 Ss" 113 82 113 109 parsed_6d37 1
70 "213 2.55 7.21 109.733 Ss" 114 82 114 110 parsed_6d37 1
71 "218 0.44 7.19 93.7548 Ss" 115 82 115 110 parsed_6d37 1
72 "234 3.17 2.56 974.184" 116 82 116 107 parsed_6d37 1
73 "240 2.92 2.56 604.405" 117 82 117 107 parsed_6d37 1
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77 "230 4.35 1.84 231.369" 121 82 121 107 parsed_6d37 1
78 Overlapped 122 82 122 94 parsed_6d37 1
79 "231 4.35 8.38 1153.92" 123 82 123 107 parsed_6d37 1
80 "232 2.26 8.38 113.987" 124 82 124 107 parsed_6d37 1
81 "233 3.17 7.08 263.465 Se Ca ! overlapped" 125 82 125 125 parsed_6d37 1
82 "237 2.91 7.09 185.595 Se Ca" 126 82 126 113 parsed_6d37 1
83 "242 1.82 7.07 168.978 Se Ca" 127 82 127 113 parsed_6d37 1
84 "243 1.83 9.11 103.201" 128 82 128 107 parsed_6d37 1
85 "238 2.91 6.82 100.373 Se Ca" 129 82 129 113 parsed_6d37 1
86 "239 2.92 7.10 198.601 Ss" 130 82 130 110 parsed_6d37 1
87 "244 4.28 8.40 255.451" 131 82 131 107 parsed_6d37 1
88 "245 3.82 8.38 146.045" 132 82 132 107 parsed_6d37 1
89 "1 4.20 8.68 625.102" 133 82 133 107 parsed_6d37 1
90
;
5 1.48 8.68 1144.33 C3
assign (resid 1 and name ha ) (resid 1 and name hb# ) 2.71 0.30 0.39 ! 0 4.18 1.49 1104.12 C3
;
134 82 135 111 parsed_6d37 1
91 "7 8.70 9.11 528.84" 136 82 136 106 parsed_6d37 1
92 "2 4.19 9.11 196.25" 137 82 137 106 parsed_6d37 1
93 "6 1.48 9.11 405.116 C3" 138 82 138 110 parsed_6d37 1
94 "3 4.19 2.16 548.443" 139 82 139 107 parsed_6d37 1
95 "4 4.19 2.39 97.9528" 140 82 140 107 parsed_6d37 1
96 "16 4.06 1.84 328.064" 141 82 141 107 parsed_6d37 1
97 "15 4.07 2.92 151.39" 142 82 142 106 parsed_6d37 1
98 "22 6.83 7.09 4852.82 Se Se Ca Ca" 143 82 143 119 parsed_6d37 1
99 "18 3.10 9.11 1666.69" 144 82 144 107 parsed_6d37 1
100 "21 3.10 9.11 1666.69" 145 82 145 107 parsed_6d37 1
101 "17 3.10 7.07 1526.49 Se Ca" 146 82 146 113 parsed_6d37 1
102 "8 4.06 7.08 415.132 Se Ca" 147 82 147 113 parsed_6d37 1
103
;
9 4.07 9.11 327.634
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