NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
635313 |
6drf   |
27305 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1331 |
data_6drf_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_6drf
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_6drf 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_6drf
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 6drf "Master copy" parsed_6drf
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_6drf
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 6drf.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6drf 1
1 6drf.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 943 parsed_6drf 1
1 6drf.mr . . XPLOR/CNS 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 172 parsed_6drf 1
1 6drf.mr . . XPLOR/CNS 4 distance "hydrogen bond" simple 144 parsed_6drf 1
1 6drf.mr . . XPLOR/CNS 5 distance "hydrogen bond" simple 0 parsed_6drf 1
1 6drf.mr . . XPLOR/CNS 6 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 72 parsed_6drf 1
1 6drf.mr . . "MR format" 7 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6drf 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_6drf
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER SIGNALING PROTEIN 11-JUN-18 6DRF
*TITLE STRUCTURE OF HUMAN RETINAL DEGENERATION 3(RD3) PROTEIN
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: PROTEIN RD3;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: RESIDUES 19-153;
*COMPND 5 SYNONYM: RETINAL DEGENERATION PROTEIN 3;
*COMPND 6 ENGINEERED: YES;
*COMPND 7 MUTATION: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606;
*SOURCE 5 GENE: RD3, C1ORF36;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562
*KEYWDS SENSORY TRANSDUCTION, VISION, SIGNALING PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 10
*AUTHOR Q.YU,S.LIM,I.PESHENKO,D.CUDIA,A.M.DIZHOOR,J.B.AMES
*REVDAT 1 06-FEB-19 6DRF 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6drf
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_6drf 1
2 1 . . . parsed_6drf 1
3 1 . . . parsed_6drf 1
4 1 . . . parsed_6drf 1
5 1 . . . parsed_6drf 1
6 1 . . . parsed_6drf 1
7 1 . . . parsed_6drf 1
8 1 . . . parsed_6drf 1
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11 1 . . . parsed_6drf 1
12 1 . . . parsed_6drf 1
13 1 . . . parsed_6drf 1
14 1 . . . parsed_6drf 1
15 1 . . . parsed_6drf 1
16 1 . . . parsed_6drf 1
17 1 . . . parsed_6drf 1
18 1 . . . parsed_6drf 1
19 1 . . . parsed_6drf 1
20 1 . . . parsed_6drf 1
21 1 . . . parsed_6drf 1
22 1 . . . parsed_6drf 1
23 1 . . . parsed_6drf 1
24 1 . . . parsed_6drf 1
25 1 . . . parsed_6drf 1
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28 1 . . . parsed_6drf 1
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59 1 . . . parsed_6drf 1
60 1 . . . parsed_6drf 1
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127 1 . . . parsed_6drf 1
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130 1 . . . parsed_6drf 1
131 1 . . . parsed_6drf 1
132 1 . . . parsed_6drf 1
133 1 . . . parsed_6drf 1
134 1 . . . parsed_6drf 1
135 1 . . . parsed_6drf 1
136 1 . . . parsed_6drf 1
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91 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86.51 193.79 . . 71 . N . 71 . CA . 71 . C . 72 . N parsed_6drf 1
92 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -99.78 -25.74 . . 71 . C . 72 . N . 72 . CA . 72 . C parsed_6drf 1
93 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115.95 160.95 . . 72 . N . 72 . CA . 72 . C . 73 . N parsed_6drf 1
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95 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -49.22 -9.22 . . 74 . N . 74 . CA . 74 . C . 75 . N parsed_6drf 1
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118 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97.36 174.88 . . 93 . N . 93 . CA . 93 . C . 94 . N parsed_6drf 1
119 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -79.11 -39.11 . . 93 . C . 94 . N . 94 . CA . 94 . C parsed_6drf 1
120 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -54.81 -14.81 . . 94 . N . 94 . CA . 94 . C . 95 . N parsed_6drf 1
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123 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -119.08 -79.08 . . 95 . C . 96 . N . 96 . CA . 96 . C parsed_6drf 1
124 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -46.27 42.11 . . 96 . N . 96 . CA . 96 . C . 97 . N parsed_6drf 1
125 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -78.48 -38.48 . . 96 . C . 97 . N . 97 . CA . 97 . C parsed_6drf 1
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170 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -54.12 -14.12 . . 121 . N . 121 . CA . 121 . C . 122 . N parsed_6drf 1
171 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.85 -51.85 . . 121 . C . 122 . N . 122 . CA . 122 . C parsed_6drf 1
172 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -59.70 3.98 . . 122 . N . 122 . CA . 122 . C . 123 . N parsed_6drf 1
stop_
loop_
_TA_constraint_parse_err.ID
_TA_constraint_parse_err.Content
_TA_constraint_parse_err.Begin_line
_TA_constraint_parse_err.Begin_column
_TA_constraint_parse_err.End_line
_TA_constraint_parse_err.End_column
_TA_constraint_parse_err.Entry_ID
_TA_constraint_parse_err.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 2: aco.tbl" 1 1 1 28 parsed_6drf 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_4
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6drf
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 4
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_6drf 2
2 1 . . . parsed_6drf 2
3 1 . . . parsed_6drf 2
4 1 . . . parsed_6drf 2
5 1 . . . parsed_6drf 2
6 1 . . . parsed_6drf 2
7 1 . . . parsed_6drf 2
8 1 . . . parsed_6drf 2
9 1 . . . parsed_6drf 2
10 1 . . . parsed_6drf 2
11 1 . . . parsed_6drf 2
12 1 . . . parsed_6drf 2
13 1 . . . parsed_6drf 2
14 1 . . . parsed_6drf 2
15 1 . . . parsed_6drf 2
16 1 . . . parsed_6drf 2
17 1 . . . parsed_6drf 2
18 1 . . . parsed_6drf 2
19 1 . . . parsed_6drf 2
20 1 . . . parsed_6drf 2
21 1 . . . parsed_6drf 2
22 1 . . . parsed_6drf 2
23 1 . . . parsed_6drf 2
24 1 . . . parsed_6drf 2
25 1 . . . parsed_6drf 2
26 1 . . . parsed_6drf 2
27 1 . . . parsed_6drf 2
28 1 . . . parsed_6drf 2
29 1 . . . parsed_6drf 2
30 1 . . . parsed_6drf 2
31 1 . . . parsed_6drf 2
32 1 . . . parsed_6drf 2
33 1 . . . parsed_6drf 2
34 1 . . . parsed_6drf 2
35 1 . . . parsed_6drf 2
36 1 . . . parsed_6drf 2
37 1 . . . parsed_6drf 2
38 1 . . . parsed_6drf 2
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40 1 . . . parsed_6drf 2
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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102 1 2 . . . . . . . . . 97 . O parsed_6drf 2
103 1 1 . . . . . . . . . 102 . HN parsed_6drf 2
103 1 2 . . . . . . . . . 98 . O parsed_6drf 2
104 1 1 . . . . . . . . . 102 . N parsed_6drf 2
104 1 2 . . . . . . . . . 98 . O parsed_6drf 2
105 1 1 . . . . . . . . . 103 . HN parsed_6drf 2
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106 1 2 . . . . . . . . . 99 . O parsed_6drf 2
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108 1 2 . . . . . . . . . 100 . O parsed_6drf 2
109 1 1 . . . . . . . . . 105 . HN parsed_6drf 2
109 1 2 . . . . . . . . . 101 . O parsed_6drf 2
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110 1 2 . . . . . . . . . 101 . O parsed_6drf 2
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111 1 2 . . . . . . . . . 102 . O parsed_6drf 2
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112 1 2 . . . . . . . . . 102 . O parsed_6drf 2
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113 1 2 . . . . . . . . . 103 . O parsed_6drf 2
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114 1 2 . . . . . . . . . 103 . O parsed_6drf 2
115 1 1 . . . . . . . . . 108 . HN parsed_6drf 2
115 1 2 . . . . . . . . . 104 . O parsed_6drf 2
116 1 1 . . . . . . . . . 108 . N parsed_6drf 2
116 1 2 . . . . . . . . . 104 . O parsed_6drf 2
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117 1 2 . . . . . . . . . 105 . O parsed_6drf 2
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140 1 2 . . . . . . . . . 116 . O parsed_6drf 2
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144 1 2 . . . . . . . . . 118 . O parsed_6drf 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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3 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
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6 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
7 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
8 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
9 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
10 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
11 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
12 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
13 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
14 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
15 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
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22 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
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34 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
35 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
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37 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
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50 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
51 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
52 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
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58 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
59 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
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132 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
133 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
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142 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
143 1 . . . . . 2.0 1.7 2.3 parsed_6drf 2
144 1 . . . . . 3.0 2.7 3.3 parsed_6drf 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 3: hbond.tbl" 1 1 1 30 parsed_6drf 2
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_5
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6drf
_Distance_constraint_list.ID 3
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 5
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 4: hbda.tbl" 1 1 1 29 parsed_6drf 3
2 "assign ( resid 9 and name N ) ( resid 9 and name HN ) ( resid 5 and name O )" 2 1 2 85 parsed_6drf 3
3 "assign ( resid 10 and name N ) ( resid 10 and name HN ) ( resid 6 and name O )" 3 1 3 85 parsed_6drf 3
4 "assign ( resid 11 and name N ) ( resid 11 and name HN ) ( resid 7 and name O )" 4 1 4 85 parsed_6drf 3
5 "assign ( resid 12 and name N ) ( resid 12 and name HN ) ( resid 8 and name O )" 5 1 5 85 parsed_6drf 3
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Contact the webmaster for help, if required. Sunday, April 28, 2024 11:50:59 AM GMT (wattos1)