NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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29847 |
1bgz   |
cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 771 |
data_1bgz_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1bgz
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1bgz 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1bgz
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1bgz "Master copy" parsed_1bgz
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1bgz
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1bgz.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1bgz 1
1 1bgz.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 540 parsed_1bgz 1
1 1bgz.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 51 parsed_1bgz 1
1 1bgz.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 180 parsed_1bgz 1
1 1bgz.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1bgz 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1bgz
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RIBONUCLEIC ACID 03-JUN-98 1BGZ
*TITLE S8 RRNA BINDING SITE FROM E. COLI, NMR, 6 STRUCTURES
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: RNA;
*COMPND 3 CHAIN: NULL;
*COMPND 4 FRAGMENT: 16S RRNA BINDING SITE FOR S8;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES;
*COMPND 6 OTHER_DETAILS: RNA HAIRPIN
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: T7 POLYMERASE TRANSCRIPTION;
*SOURCE 3 ORGANISM_SCIENTIFIC: ESCHERICHIA COLI
*KEYWDS RIBONUCLEIC ACID, 16S RRNA, INTERNAL LOOP, BASE TRIPLE
*EXPDTA NMR, 6 STRUCTURES
*AUTHOR K.KALURACHCHI,E.P.NIKONOWICZ
*REVDAT 1 13-JAN-99 1BGZ 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1bgz
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1bgz 1
2 1 . . . parsed_1bgz 1
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stop_
loop_
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loop_
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stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
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stop_
save_
save_CNS/XPLOR_dihedral_4
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_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_1bgz
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178 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60.0 110.0 . HPGA 20 . C2* HPGA 20 . C3* HPGA 20 . O3* HPGA 21 . P parsed_1bgz 1
179 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60.0 110.0 . HPGA 21 . C2* HPGA 21 . C3* HPGA 21 . O3* HPGA 22 . P parsed_1bgz 1
180 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60.0 110.0 . HPGA 22 . C2* HPGA 22 . C3* HPGA 22 . O3* HPGA 23 . P parsed_1bgz 1
stop_
loop_
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_TA_constraint_comment_org.Torsion_angle_constraint_list_ID
1
;
Torsion angle constraints about delta and nu 0
to apply c3 prime endo sugar pucker
;
1 1 3 2 parsed_1bgz 1
2 "Torsion angle constraints about Beta" 210 1 212 3 parsed_1bgz 1
3 "Epsilon Torsion angle constraints" 307 1 309 3 parsed_1bgz 1
4
;
Ki, NOT an experimental measurement.
Restricted based on x-peak intentsities
;
394 1 397 2 parsed_1bgz 1
5 "Alfa, based on 31P chemical shifts" 512 1 514 2 parsed_1bgz 1
6 "zeta, based on 31P chemical shifts" 589 1 591 2 parsed_1bgz 1
7 Gamma 671 1 673 2 parsed_1bgz 1
8
;
The next two constraints are
Impropers to TEST accommodation of planar A595-(A596-U644)
3-base interaction. Not to be included in "real" calculation
assign (segid HPGA and resid 17 and name N9 )
(segid HPGA and resid 17 and name C4 )
(segid HPGA and resid 17 and name N3 )
(segid HPGA and resid 18 and name N6 ) 10.0 0.0 15.0 2
assign (segid HPGA and resid 17 and name C2 )
(segid HPGA and resid 17 and name N3 )
(segid HPGA and resid 18 and name N6 )
(segid HPGA and resid 18 and name C6 ) 10.0 180.0 15.0 2
C2'-C3'-O3'-P from 31P dec {1H-13C}-ctHSQC
;
783 1 799 2 parsed_1bgz 1
stop_
save_
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