NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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29645 |
1b6x   |
cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 266 |
data_1b6x_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1b6x
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1b6x 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1b6x
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1b6x "Master copy" parsed_1b6x
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1b6x
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1b6x.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1b6x 1
1 1b6x.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 236 parsed_1b6x 1
1 1b6x.mr . . XPLOR/CNS 3 peak "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1b6x 1
1 1b6x.mr . . n/a 4 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1b6x 1
1 1b6x.mr . . XPLOR/CNS 5 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 30 parsed_1b6x 1
1 1b6x.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1b6x 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1b6x
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER DEOXYRIBONUCLEIC ACID 19-JAN-99 1B6X
*TITLE 3,N4-ETHENO-2'-DEOXYCYTIDINE OPPOSITE GUANINE IN AN 11-MER
*TITLE 2 DUPLEX, SOLUTION STRUCTURE FROM NMR AND MOLECULAR DYNAMICS,
*TITLE 3 4 STRUCTURES
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: 11-MER DNA DUPLEX;
*COMPND 3 CHAIN: A, B;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: NON-BIOLOGICAL SEQUENCE
*KEYWDS DEOXYRIBONUCLEIC ACID, ETHENODC, EDC, EXOCYCLIC LESION
*EXPDTA NMR, 4 STRUCTURES
*AUTHOR D.CULLINAN,F.JOHNSON,A.P.GROLLMAN,M.EISENBERG,
*AUTHOR 2 C.DE LOS SANTOS
*REVDAT 1 12-OCT-04 1B6X 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1b6x
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1b6x 1
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3 1 . . . parsed_1b6x 1
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stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1
;
These files contain the various types of restraints that were
used in the dynamics. First the normal NOE distance restraints,
then some distance constraints that were only used during the
full relaxation matrix back calculation (based on data in H2O),
then the volumes for the full relaxation matrix.
;
2 1 6 50 parsed_1b6x 1
2
;
Used only during full relaxation refinement, since these had no
volumes to constrain them.
;
704 1 705 28 parsed_1b6x 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1
;
assign ( resid 6 and name H8 and segid STR1 )
( resid 5 and name1H4 and segid STR1 ) 4.00 0.70 0.50
;
719 1 720 62 parsed_1b6x 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_4
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_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1b6x
_Org_constr_file_comment.ID 2
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 4
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
set echo=on end
remarks glytorsion.res
remarks Dihedral restrains to keep the glycosidic torsion andgle of
remarks the adduct in anti and put its sugar pucker on usual north.
remarks CDS 1/17/97
;
save_
save_CNS/XPLOR_dihedral_5
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_1b6x
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 5
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Torsion_angle_constraint.ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_1
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_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_4
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Dihedral restrains on the deoxyribose of the central three
except the ethenodC*s sugar. Trying to keep them in south.
;
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Contact the webmaster for help, if required. Sunday, April 28, 2024 7:38:44 PM GMT (wattos1)