NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
623976 |
6be7   |
30355 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 170 |
data_6be7_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_6be7
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_6be7 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_6be7
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 6be7 "Master copy" parsed_6be7
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_6be7
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 6be7.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6be7 1
1 6be7.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 170 parsed_6be7 1
1 6be7.mr . . "MR format" 3 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6be7 1
stop_
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save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_6be7
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER DE NOVO PROTEIN 24-OCT-17 6BE7
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF DE NOVO MACROCYCLE DESIGN8.1
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: DDPT(DPR)(DAR)Q(DGN);
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES;
*COMPND 5 OTHER_DETAILS: HEAD TO TAIL CYCLIC BETWEEN POSITION 1 AND 8
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES;
*SOURCE 3 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606
*KEYWDS MACROCYCLE, DESIGN, DE NOVO PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 20
*AUTHOR M.D.SHORTRIDGE,P.HOSSEINZADEH,F.PARDO-AVILA,G.VARANI,D.BAKER
*REVDAT 1 03-JAN-18 6BE7 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6be7
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_6be7 1
2 1 . . . parsed_6be7 1
3 1 . . . parsed_6be7 1
4 1 . . . parsed_6be7 1
5 1 . . . parsed_6be7 1
6 1 . . . parsed_6be7 1
7 1 . . . parsed_6be7 1
8 1 . . . parsed_6be7 1
9 1 . . . parsed_6be7 1
10 1 . . . parsed_6be7 1
11 1 . . . parsed_6be7 1
12 1 . . . parsed_6be7 1
13 1 . . . parsed_6be7 1
14 1 . . . parsed_6be7 1
15 1 . . . parsed_6be7 1
16 1 . . . parsed_6be7 1
17 1 . . . parsed_6be7 1
18 1 . . . parsed_6be7 1
19 1 . . . parsed_6be7 1
20 1 . . . parsed_6be7 1
21 1 . . . parsed_6be7 1
22 1 . . . parsed_6be7 1
23 1 . . . parsed_6be7 1
24 1 . . . parsed_6be7 1
25 1 . . . parsed_6be7 1
26 1 . . . parsed_6be7 1
27 1 . . . parsed_6be7 1
28 1 . . . parsed_6be7 1
29 1 . . . parsed_6be7 1
30 1 . . . parsed_6be7 1
31 1 . . . parsed_6be7 1
32 1 . . . parsed_6be7 1
33 1 . . . parsed_6be7 1
34 1 . . . parsed_6be7 1
35 1 . . . parsed_6be7 1
36 1 . . . parsed_6be7 1
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38 1 . . . parsed_6be7 1
39 1 . . . parsed_6be7 1
40 1 . . . parsed_6be7 1
41 1 . . . parsed_6be7 1
42 1 . . . parsed_6be7 1
43 1 . . . parsed_6be7 1
44 1 . . . parsed_6be7 1
45 1 . . . parsed_6be7 1
46 1 . . . parsed_6be7 1
47 1 . . . parsed_6be7 1
48 1 . . . parsed_6be7 1
49 1 . . . parsed_6be7 1
50 1 . . . parsed_6be7 1
51 1 . . . parsed_6be7 1
52 1 . . . parsed_6be7 1
53 1 . . . parsed_6be7 1
54 1 . . . parsed_6be7 1
55 1 . . . parsed_6be7 1
56 1 . . . parsed_6be7 1
57 1 . . . parsed_6be7 1
58 1 . . . parsed_6be7 1
59 1 . . . parsed_6be7 1
60 1 . . . parsed_6be7 1
61 1 . . . parsed_6be7 1
62 1 . . . parsed_6be7 1
63 1 . . . parsed_6be7 1
64 1 . . . parsed_6be7 1
65 1 . . . parsed_6be7 1
66 1 . . . parsed_6be7 1
67 1 . . . parsed_6be7 1
68 1 . . . parsed_6be7 1
69 1 . . . parsed_6be7 1
70 1 . . . parsed_6be7 1
71 1 . . . parsed_6be7 1
72 1 . . . parsed_6be7 1
73 1 . . . parsed_6be7 1
74 1 . . . parsed_6be7 1
75 1 . . . parsed_6be7 1
76 1 . . . parsed_6be7 1
77 1 . . . parsed_6be7 1
78 1 . . . parsed_6be7 1
79 1 . . . parsed_6be7 1
80 1 . . . parsed_6be7 1
81 1 . . . parsed_6be7 1
82 1 . . . parsed_6be7 1
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84 1 . . . parsed_6be7 1
85 1 . . . parsed_6be7 1
86 1 . . . parsed_6be7 1
87 1 . . . parsed_6be7 1
88 1 . . . parsed_6be7 1
89 1 . . . parsed_6be7 1
90 1 . . . parsed_6be7 1
91 1 . . . parsed_6be7 1
92 1 . . . parsed_6be7 1
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95 1 . . . parsed_6be7 1
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99 1 . . . parsed_6be7 1
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101 1 . . . parsed_6be7 1
102 1 . . . parsed_6be7 1
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105 1 . . . parsed_6be7 1
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109 1 . . . parsed_6be7 1
110 1 . . . parsed_6be7 1
111 1 . . . parsed_6be7 1
112 1 . . . parsed_6be7 1
113 1 . . . parsed_6be7 1
114 1 . . . parsed_6be7 1
115 1 . . . parsed_6be7 1
116 1 . . . parsed_6be7 1
117 1 . . . parsed_6be7 1
118 1 . . . parsed_6be7 1
119 1 . . . parsed_6be7 1
120 1 . . . parsed_6be7 1
121 1 . . . parsed_6be7 1
122 1 . . . parsed_6be7 1
123 1 . . . parsed_6be7 1
124 1 . . . parsed_6be7 1
125 1 . . . parsed_6be7 1
126 1 . . . parsed_6be7 1
127 1 . . . parsed_6be7 1
128 1 . . . parsed_6be7 1
129 1 . . . parsed_6be7 1
130 1 . . . parsed_6be7 1
131 1 . . . parsed_6be7 1
132 1 . . . parsed_6be7 1
133 1 . . . parsed_6be7 1
134 1 . . . parsed_6be7 1
135 1 . . . parsed_6be7 1
136 1 . . . parsed_6be7 1
137 1 . . . parsed_6be7 1
138 1 . . . parsed_6be7 1
139 1 . . . parsed_6be7 1
140 1 . . . parsed_6be7 1
141 1 . . . parsed_6be7 1
142 1 . . . parsed_6be7 1
143 1 . . . parsed_6be7 1
144 1 . . . parsed_6be7 1
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147 1 . . . parsed_6be7 1
148 1 . . . parsed_6be7 1
149 1 . . . parsed_6be7 1
150 1 . . . parsed_6be7 1
151 1 . . . parsed_6be7 1
152 1 . . . parsed_6be7 1
153 1 . . . parsed_6be7 1
154 1 . . . parsed_6be7 1
155 1 . . . parsed_6be7 1
156 1 . . . parsed_6be7 1
157 1 . . . parsed_6be7 1
158 1 . . . parsed_6be7 1
159 1 . . . parsed_6be7 1
160 1 . . . parsed_6be7 1
161 1 . . . parsed_6be7 1
162 1 . . . parsed_6be7 1
163 1 . . . parsed_6be7 1
164 1 . . . parsed_6be7 1
165 1 . . . parsed_6be7 1
166 1 . . . parsed_6be7 1
167 1 . . . parsed_6be7 1
168 1 . . . parsed_6be7 1
169 1 . . . parsed_6be7 1
170 1 . . . parsed_6be7 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
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_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 1 . HA parsed_6be7 1
1 1 2 . . . . . . . . . 1 . HN parsed_6be7 1
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7 1 2 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_6be7 1
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19 1 1 . . . . . . . . . 1 . HA parsed_6be7 1
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21 1 1 . . . . . . . . . 4 . HA parsed_6be7 1
21 1 2 . . . . . . . . . 3 . HA parsed_6be7 1
22 1 1 . . . . . . . . . 6 . HA parsed_6be7 1
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23 1 1 . . . . . . . . . 6 . HA parsed_6be7 1
23 1 2 . . . . . . . . . 7 . HA parsed_6be7 1
24 1 1 . . . . . . . . . 7 . HA parsed_6be7 1
24 1 2 . . . . . . . . . 6 . HA parsed_6be7 1
25 1 1 . . . . . . . . . 2 . HN parsed_6be7 1
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27 1 1 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_6be7 1
27 1 2 . . . . . . . . . 8 . HN parsed_6be7 1
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29 1 1 . . . . . . . . . 1 . HB1 parsed_6be7 1
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31 1 1 . . . . . . . . . 1 . HB1 parsed_6be7 1
31 1 2 . . . . . . . . . 1 . HA parsed_6be7 1
32 1 1 . . . . . . . . . 1 . HB1 parsed_6be7 1
32 1 2 . . . . . . . . . 8 . HA parsed_6be7 1
33 1 1 . . . . . . . . . 1 . HB2 parsed_6be7 1
33 1 2 . . . . . . . . . 1 . HA parsed_6be7 1
34 1 1 . . . . . . . . . 2 . HA parsed_6be7 1
34 1 2 . . . . . . . . . 1 . HB2 parsed_6be7 1
35 1 1 . . . . . . . . . 2 . HA parsed_6be7 1
35 1 2 . . . . . . . . . 2 . HB1 parsed_6be7 1
36 1 1 . . . . . . . . . 2 . HB1 parsed_6be7 1
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37 1 2 . . . . . . . . . 2 . HB1 parsed_6be7 1
38 1 1 . . . . . . . . . 2 . HB2 parsed_6be7 1
38 1 2 . . . . . . . . . 2 . HN parsed_6be7 1
39 1 1 . . . . . . . . . 2 . HA parsed_6be7 1
39 1 2 . . . . . . . . . 3 . HG# parsed_6be7 1
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40 1 2 . . . . . . . . . 1 . HN parsed_6be7 1
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44 1 2 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_6be7 1
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45 1 2 . . . . . . . . . 2 . HA parsed_6be7 1
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46 1 2 . . . . . . . . . 3 . HD2 parsed_6be7 1
47 1 1 . . . . . . . . . 2 . HB2 parsed_6be7 1
47 1 2 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_6be7 1
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48 1 2 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_6be7 1
49 1 1 . . . . . . . . . 3 . HA parsed_6be7 1
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50 1 1 . . . . . . . . . 3 . HB1 parsed_6be7 1
50 1 2 . . . . . . . . . 3 . HA parsed_6be7 1
51 1 1 . . . . . . . . . 3 . HD# parsed_6be7 1
51 1 2 . . . . . . . . . 3 . HA parsed_6be7 1
52 1 1 . . . . . . . . . 3 . HD2 parsed_6be7 1
52 1 2 . . . . . . . . . 3 . HG# parsed_6be7 1
53 1 1 . . . . . . . . . 3 . HD2 parsed_6be7 1
53 1 2 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_6be7 1
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54 1 2 . . . . . . . . . 3 . HA parsed_6be7 1
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60 1 2 . . . . . . . . . 6 . HE parsed_6be7 1
61 1 1 . . . . . . . . . 3 . HB# parsed_6be7 1
61 1 2 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_6be7 1
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stop_
loop_
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;
-------------------------------------------------------------------------!
NOE Table for SLANT peptide !
Updated 052117 mds
SLANT, 8mer ASP ASP PRO THR pro arg GLN gln
Upper case L-Amino Acid
Lower case D-Amino Acid
! NOE binning !!
strong 2.5 0.7 0.7
medium 3.5 1.2 1.2
weak 4.5 1.6 1.6
very weak 5.0 2.0 2.0
TOTAL NOES = 170
long range (j-i >6) = 8
short range (2 > j-i < 5) = 30
sequential (i to j) = 48
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------------------------------------------------------------------------!
! BACKBONE !!
! HA-HN !!
;
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2 "! HA-HA !!" 47 1 47 12 parsed_6be7 1
3 "! HN-HN !!" 58 1 58 12 parsed_6be7 1
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11 "assign ( resid 6 and name HA ) ( resid 4 and name HN ) 4.5 1.6 1.6" 178 1 178 75 parsed_6be7 1
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Contact the webmaster for help, if required. Monday, April 29, 2024 9:29:08 AM GMT (wattos1)