NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
622380 |
5vwl   |
30297 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1443 |
data_5vwl_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_5vwl
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_5vwl 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_5vwl
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 5vwl "Master copy" parsed_5vwl
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_5vwl
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 5vwl.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5vwl 1
1 5vwl.mr . . DYANA/DIANA 2 distance NOE simple 451 parsed_5vwl 1
1 5vwl.mr . . DYANA/DIANA 3 distance "hydrogen bond" simple 308 parsed_5vwl 1
1 5vwl.mr . . DYANA/DIANA 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 684 parsed_5vwl 1
1 5vwl.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5vwl 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_5vwl
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER VIRAL PROTEIN 22-MAY-17 5VWL
*TITLE SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE MEMBRANE ASSOCIATED SEGMENT OF HIV-1
*TITLE 2 GP41 CYTOPLASMIC TAIL
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: CYTOPLASMIC TAIL OF HIV-1 GP41 PROTEIN;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: TAIL RESIDUES 750-854;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1;
*SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 11676;
*SOURCE 4 GENE: ENV;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 469008;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: BL21 (DE3);
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PET28
*KEYWDS ALPHA-HELIX, CYTOPLASMIC TAIL, HIV-1, ENVELOPE, PLASMA MEMBRANE,
*KEYWDS 2 VIRAL PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 20
*AUTHOR J.S.SAAD,R.E.MURPHY,A.SAMAL,J.VLACH
*REVDAT 1 08-NOV-17 5VWL 0
;
save_
save_DYANA/DIANA_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_5vwl
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_5vwl 1
2 1 . . . parsed_5vwl 1
3 1 . . . parsed_5vwl 1
4 1 . . . parsed_5vwl 1
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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225 1 1 . . . . . . . . . 805 GLN HB parsed_5vwl 1
225 1 2 . . . . . . . . . 809 ASN H parsed_5vwl 1
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330 1 1 . . . . . . . . . 827 ASP HA parsed_5vwl 1
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349 1 1 . . . . . . . . . 831 GLU QG parsed_5vwl 1
349 1 2 . . . . . . . . . 832 VAL H parsed_5vwl 1
350 1 1 . . . . . . . . . 832 VAL H parsed_5vwl 1
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stop_
loop_
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loop_
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
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_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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loop_
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198 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -65.7 42.3 . . 855 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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399 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 793 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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402 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
403 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
404 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
405 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
406 CHI3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
407 CHI3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
408 CHI3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
409 CHI4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
410 CHI4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
411 CHI4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 794 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
412 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 795 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
413 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 795 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
414 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 795 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
415 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 796 TRP . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
416 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 796 TRP . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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466 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 807 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
467 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 807 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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482 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 809 ASN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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491 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 813 ASN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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495 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 814 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
496 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 814 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
497 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 814 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
498 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 814 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
499 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 815 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
500 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 815 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
501 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 815 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
502 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 815 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
503 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 815 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
504 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 815 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
505 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 816 ASN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
506 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 816 ASN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
507 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 816 ASN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
508 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 818 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
509 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 818 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
510 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 818 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
511 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 820 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
512 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 820 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
513 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 820 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
514 CHI21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 820 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
515 CHI21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 820 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
516 CHI21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 820 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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520 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 824 GLU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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555 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 831 GLU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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563 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 833 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
564 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 833 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
565 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 834 GLN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
566 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 834 GLN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
567 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 834 GLN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
568 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 834 GLN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
569 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 834 GLN . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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572 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 837 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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574 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 838 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
575 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 838 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
576 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 838 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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578 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 838 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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593 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 841 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
594 CHI2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 841 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
595 CHI3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 841 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
596 CHI3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 841 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
597 CHI3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 841 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
598 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 842 HIS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
599 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 842 HIS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
600 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -205.0 85.0 . . 842 HIS . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
601 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 843 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
602 CHI1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -325.0 -35.0 . . 843 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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604 CHI21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 205.0 . . 843 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_5vwl 1
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