NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
610378 |
5t1o   |
30159 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1585 |
data_5t1o_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_5t1o
_Study_list.ID 1
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_5t1o 1
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_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_5t1o
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
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_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 5t1o "Master copy" parsed_5t1o
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_5t1o
_Constraint_stat_list.ID 1
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_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 5t1o.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5t1o 1
1 5t1o.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE ambi 654 parsed_5t1o 1
1 5t1o.mr . . XPLOR/CNS 3 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 146 parsed_5t1o 1
1 5t1o.mr . . unknown 4 unknown "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5t1o 1
1 5t1o.mr . . XPLOR/CNS 5 distance "hydrogen bond" ambi 334 parsed_5t1o 1
1 5t1o.mr . . unknown 6 "pseudocontact shift" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5t1o 1
1 5t1o.mr . . XPLOR/CNS 7 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 451 parsed_5t1o 1
1 5t1o.mr . . "MR format" 8 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5t1o 1
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save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_5t1o
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER TRANSFERASE 19-AUG-16 5T1O
*TITLE SOLUTION-STATE NMR AND SAXS STRUCTURAL ENSEMBLE OF NPR (1-85) IN
*TITLE 2 COMPLEX WITH EIN-NTR (170-424)
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: PHOSPHOCARRIER PROTEIN NPR;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 SYNONYM: NITROGEN-RELATED HPR;
*COMPND 5 EC: 2.7.11.-;
*COMPND 6 ENGINEERED: YES;
*COMPND 7 MOL_ID: 2;
*COMPND 8 MOLECULE: PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE PTSP;
*COMPND 9 CHAIN: B;
*COMPND 10 SYNONYM: ENZYME I-NTR,PHOSPHOTRANSFERASE SYSTEM,ENZYME I;
*COMPND 11 EC: 2.7.3.9;
*COMPND 12 ENGINEERED: YES;
*COMPND 13 MUTATION: YES;
*COMPND 14 OTHER_DETAILS: THIS MOLECULE WAS MUTATED AT POSITION 356 FROM
*COMPND 15 HISTIDINE TO GLUTAMINE. IN E. COLI, WHEN THE NATIVE HISTIDINE IS
*COMPND 16 PRESENT, THE SAMPLE CAN BE PHOSPHORYLATED. IT WAS MUTATED TO PROVIDE
*COMPND 17 A HOMOGENEOUS SAMPLE. ADDITIONALLY, IT COMPRISES RESIDUES 170-424 OF
*COMPND 18 THE LARGER ENZYME I-NTR MOLECULE. RESIDUE 169 IS MUTATED TO GLYCINE
*COMPND 19 DUE TO TEV PROTEASE CLEAVAGE.
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: ESCHERICHIA COLI O157:H7;
*SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 83334;
*SOURCE 4 GENE: PTSO, Z4569, ECS4085;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: ER2566;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PLASMID;
*SOURCE 9 MOL_ID: 2;
*SOURCE 10 ORGANISM_SCIENTIFIC: ESCHERICHIA COLI (STRAIN K12);
*SOURCE 11 ORGANISM_TAXID: 83333;
*SOURCE 12 STRAIN: K12;
*SOURCE 13 GENE: PTSP, YGDF, YGDO, B2829, JW2797;
*SOURCE 14 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 15 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562;
*SOURCE 16 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: ER2566;
*SOURCE 17 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 18 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PET28A
*KEYWDS PTSNTR, PHOSPHOTRANSFER, BACTERIAL, COMPLEX, TRANSFERASE
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 20
*AUTHOR M.STRICKLAND,A.M.STANLEY,G.WANG,C.D.SCHWIETERS,S.BUCHANAN,
*AUTHOR 2 A.PETERKOFSKY,N.TJANDRA
*REVDAT 1 16-NOV-16 5T1O 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_5t1o
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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101 . . . . . . . . . . . . . . . . -11.1484 . . . . . 338 . N . 338 . HN parsed_5t1o 1
102 . . . . . . . . . . . . . . . . 1.1246 . . . . . 341 . N . 341 . HN parsed_5t1o 1
103 . . . . . . . . . . . . . . . . 13.8633 . . . . . 342 . N . 342 . HN parsed_5t1o 1
104 . . . . . . . . . . . . . . . . -8.6974 . . . . . 343 . N . 343 . HN parsed_5t1o 1
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117 . . . . . . . . . . . . . . . . 7.2268 . . . . . 371 . N . 371 . HN parsed_5t1o 1
118 . . . . . . . . . . . . . . . . -12.1052 . . . . . 372 . N . 372 . HN parsed_5t1o 1
119 . . . . . . . . . . . . . . . . 9.4945 . . . . . 373 . N . 373 . HN parsed_5t1o 1
120 . . . . . . . . . . . . . . . . 5.1167 . . . . . 377 . N . 377 . HN parsed_5t1o 1
121 . . . . . . . . . . . . . . . . -1.5574 . . . . . 378 . N . 378 . HN parsed_5t1o 1
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130 . . . . . . . . . . . . . . . . -0.1113 . . . . . 389 . N . 389 . HN parsed_5t1o 1
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141 . . . . . . . . . . . . . . . . -0.0992 . . . . . 416 . N . 416 . HN parsed_5t1o 1
142 . . . . . . . . . . . . . . . . -3.2648 . . . . . 417 . N . 417 . HN parsed_5t1o 1
143 . . . . . . . . . . . . . . . . -2.4206 . . . . . 418 . N . 418 . HN parsed_5t1o 1
144 . . . . . . . . . . . . . . . . 0.1987 . . . . . 419 . N . 419 . HN parsed_5t1o 1
145 . . . . . . . . . . . . . . . . -1.3639 . . . . . 423 . N . 423 . HN parsed_5t1o 1
146 . . . . . . . . . . . . . . . . -0.5741 . . . . . 424 . N . 424 . HN parsed_5t1o 1
stop_
loop_
_RDC_constraint_parse_err.ID
_RDC_constraint_parse_err.Content
_RDC_constraint_parse_err.Begin_line
_RDC_constraint_parse_err.Begin_column
_RDC_constraint_parse_err.End_line
_RDC_constraint_parse_err.End_column
_RDC_constraint_parse_err.Entry_ID
_RDC_constraint_parse_err.RDC_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 3: RDC_NPr.tbl" 1 1 1 32 parsed_5t1o 1
2 "# Restraints file 4: RDC_EIN.tbl" 183 1 183 32 parsed_5t1o 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_5
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_5t1o
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 5
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_5t1o 2
2 1 . . . parsed_5t1o 2
3 1 . . . parsed_5t1o 2
4 1 . . . parsed_5t1o 2
5 1 . . . parsed_5t1o 2
6 1 . . . parsed_5t1o 2
7 1 . . . parsed_5t1o 2
8 1 . . . parsed_5t1o 2
9 1 . . . parsed_5t1o 2
10 1 . . . parsed_5t1o 2
11 1 . . . parsed_5t1o 2
12 1 . . . parsed_5t1o 2
13 1 . . . parsed_5t1o 2
14 1 . . . parsed_5t1o 2
15 1 . . . parsed_5t1o 2
16 1 . . . parsed_5t1o 2
17 1 . . . parsed_5t1o 2
18 1 . . . parsed_5t1o 2
19 1 . . . parsed_5t1o 2
20 1 . . . parsed_5t1o 2
21 1 . . . parsed_5t1o 2
22 1 . . . parsed_5t1o 2
23 1 . . . parsed_5t1o 2
24 1 . . . parsed_5t1o 2
25 1 . . . parsed_5t1o 2
26 1 . . . parsed_5t1o 2
27 1 . . . parsed_5t1o 2
28 1 . . . parsed_5t1o 2
29 1 . . . parsed_5t1o 2
30 1 . . . parsed_5t1o 2
31 1 . . . parsed_5t1o 2
32 1 . . . parsed_5t1o 2
33 1 . . . parsed_5t1o 2
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47 1 . . . parsed_5t1o 2
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56 1 . . . parsed_5t1o 2
57 1 . . . parsed_5t1o 2
58 1 . . . parsed_5t1o 2
59 1 . . . parsed_5t1o 2
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61 1 . . . parsed_5t1o 2
62 1 . . . parsed_5t1o 2
63 1 . . . parsed_5t1o 2
64 1 . . . parsed_5t1o 2
65 1 . . . parsed_5t1o 2
66 1 . . . parsed_5t1o 2
67 1 . . . parsed_5t1o 2
68 1 . . . parsed_5t1o 2
69 1 . . . parsed_5t1o 2
70 1 . . . parsed_5t1o 2
71 1 . . . parsed_5t1o 2
72 1 . . . parsed_5t1o 2
73 1 . . . parsed_5t1o 2
74 1 . . . parsed_5t1o 2
75 1 . . . parsed_5t1o 2
76 1 . . . parsed_5t1o 2
77 1 . . . parsed_5t1o 2
78 1 . . . parsed_5t1o 2
79 1 . . . parsed_5t1o 2
80 1 . . . parsed_5t1o 2
81 1 . . . parsed_5t1o 2
82 1 . . . parsed_5t1o 2
83 1 . . . parsed_5t1o 2
84 1 . . . parsed_5t1o 2
85 1 . . . parsed_5t1o 2
86 1 . . . parsed_5t1o 2
87 1 . . . parsed_5t1o 2
88 1 . . . parsed_5t1o 2
89 1 . . . parsed_5t1o 2
90 1 . . . parsed_5t1o 2
91 1 . . . parsed_5t1o 2
92 1 . . . parsed_5t1o 2
93 1 . . . parsed_5t1o 2
94 1 . . . parsed_5t1o 2
95 1 . . . parsed_5t1o 2
96 1 . . . parsed_5t1o 2
97 1 . . . parsed_5t1o 2
98 1 . . . parsed_5t1o 2
99 1 . . . parsed_5t1o 2
100 1 . . . parsed_5t1o 2
101 1 . . . parsed_5t1o 2
102 1 . . . parsed_5t1o 2
103 1 . . . parsed_5t1o 2
104 1 . . . parsed_5t1o 2
105 1 . . . parsed_5t1o 2
106 1 . . . parsed_5t1o 2
107 1 . . . parsed_5t1o 2
108 1 . . . parsed_5t1o 2
109 1 . . . parsed_5t1o 2
110 1 . . . parsed_5t1o 2
111 1 . . . parsed_5t1o 2
112 1 . . . parsed_5t1o 2
113 1 . . . parsed_5t1o 2
114 1 . . . parsed_5t1o 2
115 1 . . . parsed_5t1o 2
116 1 . . . parsed_5t1o 2
117 1 . . . parsed_5t1o 2
118 1 . . . parsed_5t1o 2
119 1 . . . parsed_5t1o 2
120 1 . . . parsed_5t1o 2
121 1 . . . parsed_5t1o 2
122 1 . . . parsed_5t1o 2
123 1 . . . parsed_5t1o 2
124 1 . . . parsed_5t1o 2
125 1 . . . parsed_5t1o 2
126 1 . . . parsed_5t1o 2
127 1 . . . parsed_5t1o 2
128 1 . . . parsed_5t1o 2
129 1 . . . parsed_5t1o 2
130 1 . . . parsed_5t1o 2
131 1 . . . parsed_5t1o 2
132 1 . . . parsed_5t1o 2
133 1 . . . parsed_5t1o 2
134 1 . . . parsed_5t1o 2
135 1 . . . parsed_5t1o 2
136 1 . . . parsed_5t1o 2
137 1 . . . parsed_5t1o 2
138 1 . . . parsed_5t1o 2
139 1 . . . parsed_5t1o 2
140 1 . . . parsed_5t1o 2
141 1 . . . parsed_5t1o 2
142 1 . . . parsed_5t1o 2
143 1 . . . parsed_5t1o 2
144 1 . . . parsed_5t1o 2
145 1 . . . parsed_5t1o 2
146 1 . . . parsed_5t1o 2
147 1 . . . parsed_5t1o 2
148 1 . . . parsed_5t1o 2
149 1 . . . parsed_5t1o 2
150 1 . . . parsed_5t1o 2
151 1 . . . parsed_5t1o 2
152 1 . . . parsed_5t1o 2
153 1 . . . parsed_5t1o 2
154 1 . . . parsed_5t1o 2
155 1 . . . parsed_5t1o 2
156 1 . . . parsed_5t1o 2
157 1 . . . parsed_5t1o 2
158 1 . . . parsed_5t1o 2
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stop_
loop_
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loop_
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1
;
Phi/Psi Angles From 'Strong' TALOS-N Predictions:
error margins are set to conservative default values of double the
standard deviation observed in TALOS-N capped at a minimum of +/-20 degree.
;
2 1 4 81 parsed_5t1o 1
2
;
Phi/Psi Angles From 'Generous' TALOS-N Predictions:
error margins are set to default values of triple the standard
deviation observed in TALOS-N capped at a minimum of +/-20 degree.
;
758 1 760 72 parsed_5t1o 1
stop_
loop_
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1 "# Restraints file 9: TALOS_EIN.tbl" 1 1 1 34 parsed_5t1o 1
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